291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1117 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1117  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 
141 aa  283  8e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.876099  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1906  preprotein translocase, YajC subunit  41.67 
 
 
116 aa  94.4  6e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  36.36 
 
 
143 aa  81.3  4e-15  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0068  preprotein translocase, YajC subunit  37.96 
 
 
116 aa  80.1  9e-15  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0068  preprotein translocase, YajC subunit  42.86 
 
 
116 aa  79.7  1e-14  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.95541  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1339  preprotein translocase, YajC subunit  43.56 
 
 
129 aa  78.2  3e-14  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  36.63 
 
 
108 aa  77  9e-14  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  36.84 
 
 
114 aa  75.9  2e-13  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  39.22 
 
 
110 aa  75.5  2e-13  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  39.22 
 
 
110 aa  75.9  2e-13  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  3.13492e-06  hitchhiker  7.20992e-06 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  28.07 
 
 
168 aa  74.3  5e-13  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  37.21 
 
 
108 aa  73.9  6e-13  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  35.96 
 
 
123 aa  73.9  7e-13  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 
107 aa  73.9  7e-13  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 
107 aa  73.9  7e-13  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 
107 aa  73.9  7e-13  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 
107 aa  73.9  7e-13  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 
107 aa  73.9  7e-13  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 
107 aa  73.9  7e-13  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  31.67 
 
 
133 aa  73.6  9e-13  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1757  preprotein translocase subunit YajC  39.8 
 
 
110 aa  73.6  1e-12  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  1.15206e-07  hitchhiker  0.00353276 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  44.3 
 
 
91 aa  73.2  1e-12  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.07658e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  31.78 
 
 
143 aa  73.2  1e-12  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  9.2041e-07  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  43.18 
 
 
95 aa  72.4  2e-12  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2786  preprotein translocase subunit YajC  35.64 
 
 
110 aa  72.4  2e-12  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  4.16487e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  37.36 
 
 
107 aa  72.4  2e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1458  preprotein translocase, YajC subunit  45.35 
 
 
99 aa  72.4  2e-12  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000156531  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  35.64 
 
 
110 aa  72.4  2e-12  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.42137e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  35.64 
 
 
110 aa  72.4  2e-12  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.18136e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  35.64 
 
 
110 aa  72.4  2e-12  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  2.98712e-08  hitchhiker  6.23922e-08 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1983  hypothetical protein  41.46 
 
 
111 aa  72.8  2e-12  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1978  hypothetical protein  41.46 
 
 
111 aa  72.8  2e-12  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  35.64 
 
 
110 aa  72  3e-12  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  3.29003e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  35.85 
 
 
120 aa  72  3e-12  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  36.26 
 
 
109 aa  70.9  5e-12  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  31.58 
 
 
109 aa  71.2  5e-12  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  37.35 
 
 
109 aa  71.2  5e-12  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  37.25 
 
 
110 aa  70.5  8e-12  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0806  preprotein translocase, YajC subunit  39.58 
 
 
103 aa  70.1  1e-11  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0248725  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  37.65 
 
 
108 aa  69.7  1e-11  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  37.65 
 
 
114 aa  69.7  1e-11  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0391  preprotein translocase, YajC subunit  36.04 
 
 
121 aa  69.7  1e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  4.30502e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  37.65 
 
 
108 aa  68.9  2e-11  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  37.65 
 
 
108 aa  68.9  2e-11  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  37.65 
 
 
108 aa  68.9  2e-11  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  37.65 
 
 
108 aa  68.9  2e-11  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  37.65 
 
 
108 aa  68.9  2e-11  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  37.65 
 
 
108 aa  68.9  2e-11  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2891  preprotein translocase subunit YajC  35.71 
 
 
110 aa  69.3  2e-11  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  hitchhiker  0.000439753 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  37.65 
 
 
108 aa  68.9  2e-11  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1436  protein translocase subunit yajC  40.96 
 
 
91 aa  68.6  3e-11  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.09142e-09  hitchhiker  0.000636763 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1322  preprotein translocase, YajC subunit  37.97 
 
 
116 aa  68.6  3e-11  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1448  protein translocase subunit yajC  40.96 
 
 
91 aa  68.6  3e-11  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  1.94286e-06  hitchhiker  0.00984378 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1930  preprotein translocase, YajC subunit  37.33 
 
 
111 aa  67.8  4e-11  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  35.16 
 
 
120 aa  67.8  5e-11  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  39.58 
 
 
110 aa  67.8  5e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  35.16 
 
 
109 aa  67.8  5e-11  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  39.58 
 
 
110 aa  67.8  5e-11  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  31.43 
 
 
104 aa  67.4  6e-11  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  35.16 
 
 
111 aa  67  9e-11  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0275  preprotein translocase, YajC subunit  33.67 
 
 
110 aa  66.6  1e-10  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000715247  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2701  preprotein translocase subunit YajC  34.31 
 
 
110 aa  66.2  1e-10  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00115009  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  32.58 
 
 
94 aa  66.2  1e-10  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3519  preprotein translocase subunit YajC  34.48 
 
 
109 aa  66.2  1e-10  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0958686  normal  0.24263 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  35.87 
 
 
117 aa  66.6  1e-10  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2108  preprotein translocase, YajC subunit  32 
 
 
135 aa  66.6  1e-10  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  37.04 
 
 
120 aa  65.9  2e-10  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1409  preprotein translocase, YajC subunit  32.63 
 
 
115 aa  65.9  2e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  31.31 
 
 
110 aa  65.9  2e-10  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1308  preprotein translocase, YajC subunit  32.63 
 
 
115 aa  66.2  2e-10  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2078  protein translocase subunit yajC  38.1 
 
 
106 aa  66.2  2e-10  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.459618  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  31 
 
 
109 aa  65.9  2e-10  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  1.98451e-12  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  37.04 
 
 
120 aa  65.9  2e-10  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  35 
 
 
105 aa  65.9  2e-10  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  35.23 
 
 
108 aa  65.9  2e-10  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  37.35 
 
 
108 aa  65.9  2e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2541  protein translocase subunit yajC  33.7 
 
 
115 aa  65.9  2e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170087  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2336  preprotein translocase, YajC subunit  38.55 
 
 
91 aa  65.1  3e-10  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000343241  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1495  preprotein translocase, YajC subunit  30.09 
 
 
115 aa  65.1  3e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.528936 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1667  preprotein translocase, YajC subunit  35.37 
 
 
93 aa  65.5  3e-10  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0070914  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2192  preprotein translocase subunit YajC  40.7 
 
 
111 aa  64.7  4e-10  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0011264  hitchhiker  0.00792113 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  28.28 
 
 
125 aa  64.7  4e-10  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  34.02 
 
 
123 aa  64.7  4e-10  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 
108 aa  64.7  4e-10  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  33.33 
 
 
108 aa  64.7  4e-10  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  38.54 
 
 
108 aa  64.7  4e-10  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  28.24 
 
 
109 aa  64.3  5e-10  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00355  preprotein translocase subunit YajC  29.79 
 
 
110 aa  64.3  5e-10  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324829  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0439  preprotein translocase subunit YajC  29.79 
 
 
110 aa  64.3  5e-10  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00359  hypothetical protein  29.79 
 
 
110 aa  64.3  5e-10  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35742  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  31.33 
 
 
93 aa  64.7  5e-10  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3202  preprotein translocase, YajC subunit  29.79 
 
 
110 aa  64.3  5e-10  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.463836  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3226  preprotein translocase subunit YajC  29.79 
 
 
110 aa  64.3  5e-10  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  1.05955e-06 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0437  preprotein translocase subunit YajC  29.79 
 
 
110 aa  64.3  5e-10  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  28.24 
 
 
110 aa  64.3  5e-10  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0477  preprotein translocase subunit YajC  29.79 
 
 
110 aa  64.3  5e-10  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  35 
 
 
115 aa  64.7  5e-10  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0487  preprotein translocase subunit YajC  29.79 
 
 
110 aa  64.3  5e-10  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  30.11 
 
 
146 aa  64.3  6e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0147  preprotein translocase, YajC subunit  35.8 
 
 
101 aa  63.9  7e-10  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  3.91893e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>