More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2423 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02202  NADH dehydrogenase subunit M  72.73 
 
 		 509 aa  735    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.786903  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1380  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  72.73 
 
 		 509 aa  735    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4130  NADH dehydrogenase subunit M  80.78 
 
 		 510 aa  726    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28550  NADH dehydrogenase subunit M  85.46 
 
 		 509 aa  828    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1010  NADH dehydrogenase subunit M  67.86 
 
 		 514 aa  669    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3376  NADH dehydrogenase I, M subunit  79.61 
 
 		 510 aa  747    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1862  NADH dehydrogenase subunit M  80.78 
 
 		 510 aa  753    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.485949  normal  0.0328463 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2431  NADH dehydrogenase subunit M  72.73 
 
 		 509 aa  735    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3208  NADH dehydrogenase subunit M  79.22 
 
 		 510 aa  743    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281414  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2456  NADH dehydrogenase subunit M  72.33 
 
 		 509 aa  732    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1571  NADH dehydrogenase subunit M  73.05 
 
 		 510 aa  729    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02162  hypothetical protein  72.73 
 
 		 509 aa  735    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2426  NADH dehydrogenase subunit M  72.73 
 
 		 509 aa  735    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1805  NADH dehydrogenase subunit M  73.05 
 
 		 510 aa  729    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.168858 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2653  NADH dehydrogenase subunit M  72.53 
 
 		 509 aa  733    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3614  NADH dehydrogenase subunit M  79.61 
 
 		 510 aa  762    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.166771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1503  NADH dehydrogenase subunit M  73.08 
 
 		 511 aa  734    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2821  NADH dehydrogenase subunit M  72.82 
 
 		 509 aa  714    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.43  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2423  NADH dehydrogenase subunit M  100 
 
 		 509 aa  997    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.200315 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3297  NADH dehydrogenase subunit M  70.92 
 
 		 509 aa  736    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.416453 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1735  NADH dehydrogenase subunit M  80.78 
 
 		 510 aa  725    Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00591275  normal  0.538145 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2570  NADH dehydrogenase subunit M  72.73 
 
 		 509 aa  735    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2558  NADH dehydrogenase subunit M  79.68 
 
 		 509 aa  786    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1465  NADH dehydrogenase subunit M  73.05 
 
 		 510 aa  728    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1405  NADH dehydrogenase subunit M  71.63 
 
 		 532 aa  720    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0707014  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2556  NADH dehydrogenase subunit M  72.53 
 
 		 509 aa  734    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3416  NADH dehydrogenase subunit M  72.73 
 
 		 509 aa  735    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1375  NADH dehydrogenase subunit M  72.73 
 
 		 509 aa  735    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.905412 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2761  NADH dehydrogenase subunit M  73.08 
 
 		 511 aa  733    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2545  NADH dehydrogenase subunit M  72.53 
 
 		 509 aa  734    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3121  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  66.87 
 
 		 513 aa  652    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0441802  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2663  NADH dehydrogenase subunit M  72.53 
 
 		 509 aa  734    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2501  NADH dehydrogenase subunit M  72.53 
 
 		 509 aa  734    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2539  NADH dehydrogenase subunit M  69.78 
 
 		 511 aa  705    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3702  NADH dehydrogenase subunit M  80.78 
 
 		 510 aa  727    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.65414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29860  NADH dehydrogenase subunit M  79.68 
 
 		 509 aa  786    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000573313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0370  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  61.32 
 
 		 507 aa  608  1e-173  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0595  NADH dehydrogenase subunit M  60.81 
 
 		 541 aa  598  1e-170  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000354161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0584  NADH dehydrogenase subunit M  61 
 
 		 541 aa  597  1e-169  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1688  NADH dehydrogenase subunit M  55.56 
 
 		 577 aa  550  1e-155  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.694136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1024  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  55.01 
 
 		 500 aa  473  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.272198  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1116  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  52.57 
 
 		 493 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3814  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  50.92 
 
 		 490 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1348  NADH dehydrogenase I, M subunit  53.8 
 
 		 489 aa  442  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.467461  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1109  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  54.29 
 
 		 505 aa  436  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2871  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  50.22 
 
 		 537 aa  422  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0408599 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0707  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  54.69 
 
 		 493 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.296941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0314  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.59 
 
 		 493 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3623  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.69 
 
 		 497 aa  358  9.999999999999999e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.2 
 
 		 525 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177133  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2411  NADH dehydrogenase subunit M  40.62 
 
 		 502 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139684  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3430  NADH dehydrogenase I, M subunit  47.34 
 
 		 496 aa  352  7e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0814  NADH dehydrogenase subunit M  40.2 
 
 		 502 aa  350  4e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669912  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1656  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.44 
 
 		 495 aa  348  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.750988  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3914  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.31 
 
 		 535 aa  348  1e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0719914  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0809  NADH dehydrogenase subunit M  40 
 
 		 502 aa  347  2e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3343  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.65 
 
 		 519 aa  347  3e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816819 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0171  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.45 
 
 		 496 aa  347  4e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2820  NADH dehydrogenase subunit M  41.6 
 
 		 494 aa  346  5e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.38 
 
 		 503 aa  345  7e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1034  NADH dehydrogenase subunit M  40 
 
 		 501 aa  345  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2386  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.22 
 
 		 507 aa  344  2e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0446554  normal  0.771852 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3998  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.83 
 
 		 535 aa  344  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000144113 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1337  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.56 
 
 		 481 aa  345  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210293  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0350  NADH dehydrogenase I, M subunit  41.69 
 
 		 522 aa  343  4e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0829  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.13 
 
 		 504 aa  342  1e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1358  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.33 
 
 		 481 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.199626  normal  0.187922 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3212  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.72 
 
 		 517 aa  339  7e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1248  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.45 
 
 		 534 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130648  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1365  NADH dehydrogenase subunit M  41.51 
 
 		 503 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.1 
 
 		 542 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0442  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.1 
 
 		 542 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.990094  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0414  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.29 
 
 		 542 aa  336  5e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2154  NADH dehydrogenase subunit M  41.05 
 
 		 496 aa  336  5e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.575239  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1073  NADH dehydrogenase subunit M  41.2 
 
 		 496 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1817  NADH dehydrogenase subunit M  41.2 
 
 		 496 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1142  NADH dehydrogenase subunit M  41.2 
 
 		 496 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.400671  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1448  NADH dehydrogenase subunit M  41.2 
 
 		 496 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1311  NADH dehydrogenase subunit M  41.2 
 
 		 496 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0725  NADH dehydrogenase subunit M  41.2 
 
 		 496 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10971  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1302  NADH dehydrogenase subunit M  41.2 
 
 		 496 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982872  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0425  NADH dehydrogenase subunit M  41.2 
 
 		 496 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.271774  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4621  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.55 
 
 		 503 aa  333  5e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0225414 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2232  NADH dehydrogenase subunit M  39.75 
 
 		 513 aa  333  6e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3214  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.42 
 
 		 514 aa  332  8e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4732  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.54 
 
 		 480 aa  332  9e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708423  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1567  NADH dehydrogenase subunit M  40.68 
 
 		 510 aa  332  9e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0145309  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1952  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.74 
 
 		 507 aa  332  1e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0417902  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5565  NADH dehydrogenase subunit M  39.92 
 
 		 496 aa  332  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0400022  normal  0.331028 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1728  NADH dehydrogenase subunit M  42.66 
 
 		 512 aa  332  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.694351  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1273  NADH dehydrogenase subunit M  41.08 
 
 		 503 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2275  NADH dehydrogenase subunit M  40.85 
 
 		 496 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229712  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0902  NADH dehydrogenase subunit M  43.12 
 
 		 503 aa  331  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4060  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.01 
 
 		 480 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.40537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1040  NADH dehydrogenase subunit M  40.12 
 
 		 496 aa  331  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.926201  normal  0.336803 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1625  NADH dehydrogenase subunit M  39.92 
 
 		 496 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209377  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2261  NADH dehydrogenase subunit M  39.92 
 
 		 496 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.796685  normal  0.444802 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2237  NADH dehydrogenase subunit M  39.92 
 
 		 496 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.759454  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.68 
 
 		 494 aa  330  4e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000177754 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1367  NADH dehydrogenase subunit M  40.69 
 
 		 504 aa  330  4e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73718  normal  0.0186615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>