215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0497 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_0329  membrane dipeptidase  93.23 
 
 
325 aa  638  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.371464  normal  0.432124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0331  membrane dipeptidase  93.54 
 
 
325 aa  639  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0308  membrane dipeptidase  93.23 
 
 
325 aa  638  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71240  hypothetical protein  96.31 
 
 
325 aa  654  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4899  membrane dipeptidase  93.54 
 
 
325 aa  639  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195029  normal  0.655649 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6182  hypothetical protein  95.31 
 
 
320 aa  640  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5225  peptidase M19, renal dipeptidase  94.15 
 
 
325 aa  645  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511272  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0497  membrane dipeptidase  100 
 
 
325 aa  674  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0394  renal dipeptidase family protein  91.38 
 
 
325 aa  632  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4784  peptidase M19, renal dipeptidase  91.38 
 
 
325 aa  630  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  81.48 
 
 
325 aa  565  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2726  membrane dipeptidase  76.92 
 
 
325 aa  541  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.147057  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4019  M19 family peptidase  78.12 
 
 
328 aa  540  1e-152  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  69.44 
 
 
323 aa  489  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  70.4 
 
 
323 aa  488  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  70.72 
 
 
323 aa  489  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  69.78 
 
 
323 aa  481  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  69.47 
 
 
323 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  69.78 
 
 
323 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  69.47 
 
 
323 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  69.47 
 
 
323 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  69.78 
 
 
323 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  69.47 
 
 
323 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  69.78 
 
 
323 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  69.47 
 
 
323 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  69.47 
 
 
323 aa  481  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  69.47 
 
 
323 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  69.47 
 
 
323 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  69.16 
 
 
323 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  67.81 
 
 
323 aa  478  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  69.16 
 
 
323 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  68.12 
 
 
323 aa  479  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  67.5 
 
 
323 aa  477  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  65.62 
 
 
323 aa  465  1e-130  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  65.41 
 
 
323 aa  458  1e-128  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1105  peptidase M19, renal dipeptidase  60.99 
 
 
332 aa  431  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0861  membrane dipeptidase  59.01 
 
 
324 aa  420  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3059  peptidase M19, renal dipeptidase  39.18 
 
 
328 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3861  M19 family peptidase  38.32 
 
 
332 aa  236  4e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2693  dipeptidase, putative  38.56 
 
 
328 aa  235  9e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  34.89 
 
 
323 aa  225  7e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0876  membrane dipeptidase  35.19 
 
 
329 aa  219  4e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131069  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05502  hypothetical protein  32.51 
 
 
329 aa  213  4e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001564  microsomal dipeptidase  32.72 
 
 
329 aa  213  4e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.609765  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1239  peptidase M19, renal dipeptidase  33.96 
 
 
346 aa  207  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.120176 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2127  peptidase M19, renal dipeptidase  33.23 
 
 
329 aa  206  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0146717  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0578  peptidase M19 renal dipeptidase  35.4 
 
 
336 aa  206  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0814  peptidase M19 renal dipeptidase  32.3 
 
 
327 aa  204  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1814  peptidase M19, renal dipeptidase  32.71 
 
 
329 aa  204  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3382  peptidase M19, renal dipeptidase  32.71 
 
 
326 aa  191  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.290781  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2882  peptidase M19, renal dipeptidase  32.93 
 
 
377 aa  182  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756766  normal  0.22542 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1602  peptidase M19, renal dipeptidase  33.55 
 
 
323 aa  176  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.184491  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1522  Zn-dependent dipeptidase  32.09 
 
 
368 aa  172  8e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.329262  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  33.72 
 
 
357 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  30.46 
 
 
327 aa  143  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0814  multidrug resistance protein B  33.76 
 
 
332 aa  143  4e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0068  peptidase M19 renal dipeptidase  30.62 
 
 
332 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  33.2 
 
 
311 aa  138  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0917  peptidase M19, renal dipeptidase  28.32 
 
 
386 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182228  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  31.12 
 
 
328 aa  137  3e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  3.44928e-05  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  31.13 
 
 
307 aa  134  2e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  29.92 
 
 
312 aa  128  1e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  31.27 
 
 
602 aa  128  2e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3840  peptidase M19, renal dipeptidase  31.37 
 
 
335 aa  127  4e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  28.57 
 
 
348 aa  126  4e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  29.5 
 
 
315 aa  125  9e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  28.32 
 
 
399 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  29.55 
 
 
311 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  29.04 
 
 
355 aa  122  1e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  27.22 
 
 
402 aa  120  2e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  27.41 
 
 
315 aa  120  2e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.19053e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  29.84 
 
 
338 aa  120  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0838  peptidase M19, renal dipeptidase  27.76 
 
 
388 aa  119  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.994028  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  28.35 
 
 
326 aa  119  7e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2779  renal dipeptidase family protein  26.44 
 
 
379 aa  119  9e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  25.8 
 
 
381 aa  119  1e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3448  Membrane dipeptidase  31.1 
 
 
333 aa  117  2e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3166  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  30.51 
 
 
400 aa  116  4e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  27.97 
 
 
333 aa  117  4e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3791  renal dipeptidase family protein  25.69 
 
 
396 aa  116  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  30.66 
 
 
433 aa  116  5e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3183  twin-arginine translocation pathway signal  27.06 
 
 
388 aa  116  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3174  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  27.83 
 
 
399 aa  115  9e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845004  normal  0.812253 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  28.25 
 
 
313 aa  115  1e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3577  peptidase M19 renal dipeptidase  26.52 
 
 
388 aa  115  1e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  27.94 
 
 
444 aa  115  1e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3509  peptidase M19 renal dipeptidase  26.84 
 
 
388 aa  114  2e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  26.22 
 
 
433 aa  114  2e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  4.16179e-06  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0741  peptidase M19 renal dipeptidase  26.2 
 
 
388 aa  114  2e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0102  thermostable dipeptidase  30.9 
 
 
337 aa  114  2e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3700  peptidase M19 renal dipeptidase  29.33 
 
 
388 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.56612 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  28.96 
 
 
415 aa  114  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  29.41 
 
 
306 aa  113  6e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3133  twin-arginine translocation pathway signal  24.86 
 
 
387 aa  112  1e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0834  twin-arginine translocation pathway signal  24.86 
 
 
387 aa  112  1e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  29.71 
 
 
350 aa  111  2e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1454  hypothetical protein  26.67 
 
 
329 aa  110  2e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.929699  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  26.23 
 
 
412 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  26.52 
 
 
438 aa  109  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3756  peptidase M19, renal dipeptidase  25.48 
 
 
388 aa  109  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>