135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0466 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0466  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  335  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5254  hypothetical protein  82.39 
 
 		 178 aa  283  5.999999999999999e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0664  hypothetical protein  77.36 
 
 		 162 aa  268  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0789398  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07290  hypothetical protein  77.99 
 
 		 162 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.303168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0510  hypothetical protein  74.69 
 
 		 174 aa  263  5e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05640  hypothetical protein  75.16 
 
 		 171 aa  258  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5013  hypothetical protein  73.01 
 
 		 174 aa  256  8e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0508  hypothetical protein  70.99 
 
 		 166 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5007  hypothetical protein  71.6 
 
 		 179 aa  251  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.311792  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4958  hypothetical protein  70.99 
 
 		 179 aa  248  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4831  hypothetical protein  70.37 
 
 		 179 aa  247  5e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1485  hypothetical protein  69.18 
 
 		 167 aa  236  8e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.991457  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2641  protein of unknown function DUF45  69.18 
 
 		 167 aa  233  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  0.90331 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3068  hypothetical protein  65.64 
 
 		 165 aa  226  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3223  hypothetical protein  64.78 
 
 		 165 aa  219  9e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0616  protein of unknown function DUF45  64.52 
 
 		 167 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.903914  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4399  hypothetical protein  64.52 
 
 		 167 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.255986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3267  hypothetical protein  64.52 
 
 		 167 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3552  hypothetical protein  64.52 
 
 		 167 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.393221  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0615  hypothetical protein  64.52 
 
 		 167 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3377  hypothetical protein  64.52 
 
 		 167 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3521  hypothetical protein  64.52 
 
 		 167 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02954  predicted metal dependent hydrolase  64.52 
 
 		 167 aa  210  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02904  hypothetical protein  64.52 
 
 		 167 aa  210  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0498  hypothetical protein  61.73 
 
 		 169 aa  209  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1097  hypothetical protein  61.73 
 
 		 169 aa  209  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0560  hypothetical protein  61.73 
 
 		 169 aa  209  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01747  hypothetical protein  57.67 
 
 		 175 aa  207  4e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3412  hypothetical protein  60.87 
 
 		 165 aa  204  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.934069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3408  hypothetical protein  60.87 
 
 		 165 aa  204  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3578  hypothetical protein  60.87 
 
 		 165 aa  204  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.146008 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3516  hypothetical protein  60.87 
 
 		 165 aa  204  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503461  hitchhiker  0.0000110103 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3482  hypothetical protein  60.87 
 
 		 165 aa  204  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3643  protein of unknown function DUF45  57.06 
 
 		 167 aa  204  5e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276898  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3541  hypothetical protein  61.29 
 
 		 166 aa  204  6e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3505  hypothetical protein  57.06 
 
 		 167 aa  203  7e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4195  hypothetical protein  57.41 
 
 		 175 aa  200  5e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000226186 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0250  hypothetical protein  56.79 
 
 		 172 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0180  hypothetical protein  56.79 
 
 		 169 aa  197  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3622  hypothetical protein  59.63 
 
 		 175 aa  196  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0130  hypothetical protein  54.66 
 
 		 168 aa  196  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0173602  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3293  hypothetical protein  57.14 
 
 		 179 aa  194  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222647  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2949  protein of unknown function DUF45  59.35 
 
 		 166 aa  194  6e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.12197 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4315  hypothetical protein  58.02 
 
 		 170 aa  193  8.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2775  hypothetical protein  55.62 
 
 		 207 aa  193  9e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.828021  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1783  hypothetical protein  57.76 
 
 		 189 aa  193  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0062  protein of unknown function DUF45  60.25 
 
 		 173 aa  191  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3055  hypothetical protein  57.76 
 
 		 169 aa  190  8e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1539  hypothetical protein  55 
 
 		 169 aa  189  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3023  hypothetical protein  54.94 
 
 		 167 aa  189  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1222  hypothetical protein  53.42 
 
 		 170 aa  188  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1039  hypothetical protein  59.12 
 
 		 179 aa  187  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1408  protein of unknown function DUF45  57.05 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2650  hypothetical protein  53.42 
 
 		 203 aa  186  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.473621 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1134  hypothetical protein  56.49 
 
 		 180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1390  hypothetical protein  54.04 
 
 		 164 aa  181  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1839  hypothetical protein  52.53 
 
 		 162 aa  181  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00369136  normal  0.470716 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1608  hypothetical protein  51.9 
 
 		 162 aa  180  1e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000317368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3432  protein of unknown function DUF45  52.17 
 
 		 174 aa  180  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000422395 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0142  putative metal-dependent hydrolase  54.48 
 
 		 153 aa  177  4e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2608  hypothetical protein  50 
 
 		 169 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.353391  hitchhiker  0.0000000267232 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0829  protein of unknown function DUF45  51.55 
 
 		 170 aa  177  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1213  protein of unknown function DUF45  52.17 
 
 		 168 aa  176  9e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2446  hypothetical protein  50 
 
 		 169 aa  176  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.382195  hitchhiker  0.00000000481223 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2516  hypothetical protein  50 
 
 		 169 aa  176  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000013684 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2061  hypothetical protein  51.32 
 
 		 174 aa  176  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0980857  normal  0.354164 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2840  hypothetical protein  48.77 
 
 		 173 aa  175  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0188  hypothetical protein  51.25 
 
 		 166 aa  175  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2868  hypothetical protein  53.09 
 
 		 171 aa  174  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003680  hypothetical protein  46.91 
 
 		 171 aa  173  8e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2355  protein of unknown function DUF45  53.09 
 
 		 172 aa  173  8e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.202802  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1271  hypothetical protein  54.55 
 
 		 165 aa  173  9e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012956 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0136  hypothetical protein  48.1 
 
 		 163 aa  173  9e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02144  hypothetical protein  46.01 
 
 		 171 aa  172  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2626  hypothetical protein  49.03 
 
 		 168 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1658  hypothetical protein  50.64 
 
 		 170 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.268756  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3056  hypothetical protein  53.38 
 
 		 169 aa  169  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.210578  hitchhiker  0.00906067 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2700  protein of unknown function DUF45  50.64 
 
 		 174 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0148854  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2454  hypothetical protein  50.97 
 
 		 168 aa  168  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.542737  unclonable  0.00000219257 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1643  hypothetical protein  50.64 
 
 		 174 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00239821  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1680  hypothetical protein  50.64 
 
 		 174 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0855822  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1535  hypothetical protein  49.36 
 
 		 169 aa  168  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.156288  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1415  hypothetical protein  46.91 
 
 		 166 aa  166  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00105973  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1484  hypothetical protein  53.42 
 
 		 168 aa  158  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2447  hypothetical protein  44.44 
 
 		 199 aa  156  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1592  hypothetical protein  47.65 
 
 		 167 aa  154  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.18877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02667  hypothetical protein  43.42 
 
 		 165 aa  122  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.447659  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  29.73 
 
 		 236 aa  50.8  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  31.4 
 
 		 245 aa  48.5  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07620  predicted metal-dependent hydrolase  45.45 
 
 		 201 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.966751  normal  0.648637 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  29.11 
 
 		 285 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  29.55 
 
 		 288 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04860  predicted metal-dependent hydrolase  48.84 
 
 		 184 aa  44.7  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  29.55 
 
 		 292 aa  44.7  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  29.55 
 
 		 292 aa  44.7  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  32.91 
 
 		 218 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  28.95 
 
 		 251 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  26.44 
 
 		 285 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2542  protein of unknown function DUF45  28.99 
 
 		 242 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.65103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  35.09 
 
 		 251 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>