104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1408 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1408  protein of unknown function DUF45  100 
 
 		 177 aa  363  1e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3622  hypothetical protein  64.5 
 
 		 175 aa  231  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3055  hypothetical protein  63.25 
 
 		 169 aa  222  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0062  protein of unknown function DUF45  63.86 
 
 		 173 aa  222  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1783  hypothetical protein  59.09 
 
 		 189 aa  221  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1039  hypothetical protein  67.95 
 
 		 179 aa  216  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3482  hypothetical protein  63.69 
 
 		 165 aa  214  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3516  hypothetical protein  63.69 
 
 		 165 aa  214  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503461  hitchhiker  0.0000110103 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3412  hypothetical protein  63.69 
 
 		 165 aa  214  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.934069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3408  hypothetical protein  63.69 
 
 		 165 aa  214  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3578  hypothetical protein  63.69 
 
 		 165 aa  214  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.146008 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0180  hypothetical protein  61.11 
 
 		 169 aa  214  7e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3023  hypothetical protein  59.51 
 
 		 167 aa  213  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4195  hypothetical protein  63.46 
 
 		 175 aa  213  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000226186 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0250  hypothetical protein  58.64 
 
 		 172 aa  211  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2949  protein of unknown function DUF45  58.54 
 
 		 166 aa  209  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.12197 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3432  protein of unknown function DUF45  56.07 
 
 		 174 aa  209  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000422395 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2775  hypothetical protein  60.38 
 
 		 207 aa  208  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.828021  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0498  hypothetical protein  58.64 
 
 		 169 aa  208  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1097  hypothetical protein  58.64 
 
 		 169 aa  208  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0560  hypothetical protein  58.64 
 
 		 169 aa  208  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1134  hypothetical protein  58.08 
 
 		 180 aa  207  8e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3267  hypothetical protein  56.97 
 
 		 167 aa  207  8e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3552  hypothetical protein  56.97 
 
 		 167 aa  207  8e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.393221  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0615  hypothetical protein  56.97 
 
 		 167 aa  207  8e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3377  hypothetical protein  56.97 
 
 		 167 aa  207  8e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3521  hypothetical protein  56.97 
 
 		 167 aa  207  8e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4399  hypothetical protein  56.97 
 
 		 167 aa  207  8e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.255986  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02954  predicted metal dependent hydrolase  56.97 
 
 		 167 aa  206  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0616  protein of unknown function DUF45  56.97 
 
 		 167 aa  206  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.903914  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3541  hypothetical protein  56.96 
 
 		 166 aa  206  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02904  hypothetical protein  56.97 
 
 		 167 aa  206  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0829  protein of unknown function DUF45  56.79 
 
 		 170 aa  204  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2868  hypothetical protein  58.54 
 
 		 171 aa  202  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2355  protein of unknown function DUF45  58.54 
 
 		 172 aa  202  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.202802  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3223  hypothetical protein  60.26 
 
 		 165 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4315  hypothetical protein  55.83 
 
 		 170 aa  198  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0508  hypothetical protein  57.06 
 
 		 166 aa  198  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05640  hypothetical protein  61.35 
 
 		 171 aa  198  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4958  hypothetical protein  56.44 
 
 		 179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0510  hypothetical protein  58.54 
 
 		 174 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3068  hypothetical protein  60.9 
 
 		 165 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5013  hypothetical protein  58.6 
 
 		 174 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4831  hypothetical protein  56.44 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3505  hypothetical protein  53.99 
 
 		 167 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1539  hypothetical protein  55.28 
 
 		 169 aa  194  5.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1390  hypothetical protein  57.06 
 
 		 164 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5007  hypothetical protein  55.83 
 
 		 179 aa  194  6e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.311792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1485  hypothetical protein  57.69 
 
 		 167 aa  193  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.991457  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07290  hypothetical protein  58.33 
 
 		 162 aa  192  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.303168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01747  hypothetical protein  55.7 
 
 		 175 aa  192  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5254  hypothetical protein  57.86 
 
 		 178 aa  191  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0188  hypothetical protein  54.22 
 
 		 166 aa  192  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0664  hypothetical protein  57.69 
 
 		 162 aa  191  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0789398  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2641  protein of unknown function DUF45  57.69 
 
 		 167 aa  191  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  0.90331 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0136  hypothetical protein  50.62 
 
 		 163 aa  191  6e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1222  hypothetical protein  52.2 
 
 		 170 aa  190  8e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3293  hypothetical protein  51.53 
 
 		 179 aa  190  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222647  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1484  hypothetical protein  59.04 
 
 		 168 aa  189  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2650  hypothetical protein  52.98 
 
 		 203 aa  189  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.473621 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003680  hypothetical protein  50.31 
 
 		 171 aa  188  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3643  protein of unknown function DUF45  53.85 
 
 		 167 aa  186  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276898  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0466  hypothetical protein  57.05 
 
 		 163 aa  186  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1535  hypothetical protein  52.17 
 
 		 169 aa  185  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.156288  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0130  hypothetical protein  53.55 
 
 		 168 aa  185  3e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0173602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02144  hypothetical protein  49.69 
 
 		 171 aa  185  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2608  hypothetical protein  52.8 
 
 		 169 aa  184  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.353391  hitchhiker  0.0000000267232 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1271  hypothetical protein  53.12 
 
 		 165 aa  184  7e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012956 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2446  hypothetical protein  52.8 
 
 		 169 aa  183  9e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.382195  hitchhiker  0.00000000481223 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2516  hypothetical protein  52.8 
 
 		 169 aa  183  9e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000013684 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1643  hypothetical protein  52.8 
 
 		 174 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00239821  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2626  hypothetical protein  52.8 
 
 		 168 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1680  hypothetical protein  52.8 
 
 		 174 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0855822  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2700  protein of unknown function DUF45  52.8 
 
 		 174 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0148854  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1658  hypothetical protein  52.8 
 
 		 170 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.268756  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2840  hypothetical protein  48.82 
 
 		 173 aa  182  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1608  hypothetical protein  54.19 
 
 		 162 aa  180  8.000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000317368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1839  hypothetical protein  54.19 
 
 		 162 aa  180  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00369136  normal  0.470716 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0142  putative metal-dependent hydrolase  53.06 
 
 		 153 aa  175  3e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2061  hypothetical protein  52 
 
 		 174 aa  175  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0980857  normal  0.354164 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2454  hypothetical protein  51.59 
 
 		 168 aa  174  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.542737  unclonable  0.00000219257 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1213  protein of unknown function DUF45  49.69 
 
 		 168 aa  174  8e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1592  hypothetical protein  54.04 
 
 		 167 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.18877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3056  hypothetical protein  53.69 
 
 		 169 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.210578  hitchhiker  0.00906067 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1415  hypothetical protein  50.32 
 
 		 166 aa  168  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00105973  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2447  hypothetical protein  48.45 
 
 		 199 aa  165  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02667  hypothetical protein  44.38 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.447659  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0977  protein of unknown function DUF45  26.36 
 
 		 259 aa  45.4  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0561  protein of unknown function DUF45  35.85 
 
 		 211 aa  44.7  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  26.74 
 
 		 236 aa  43.9  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2293  hypothetical protein  39.62 
 
 		 227 aa  44.3  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  40 
 
 		 244 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0317  hypothetical protein  25.19 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0384  zinc metalloprotease  25.19 
 
 		 235 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0625718  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0322  hypothetical protein  25.19 
 
 		 235 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000118894  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  29.11 
 
 		 245 aa  42.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0337  hypothetical protein  25.19 
 
 		 235 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000389941  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  42.5 
 
 		 224 aa  42.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0369  hypothetical protein  25.19 
 
 		 235 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0306  zinc metalloprotease  27.34 
 
 		 235 aa  42  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>