155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2447 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2447  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  412  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1415  hypothetical protein  67.07 
 
 		 166 aa  245  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00105973  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1535  hypothetical protein  62.65 
 
 		 169 aa  226  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.156288  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2608  hypothetical protein  60.84 
 
 		 169 aa  226  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.353391  hitchhiker  0.0000000267232 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2446  hypothetical protein  60.84 
 
 		 169 aa  225  3e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.382195  hitchhiker  0.00000000481223 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2516  hypothetical protein  60.84 
 
 		 169 aa  225  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000013684 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2840  hypothetical protein  60.24 
 
 		 173 aa  224  8e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2700  protein of unknown function DUF45  60.48 
 
 		 174 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0148854  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1643  hypothetical protein  60.48 
 
 		 174 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00239821  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1680  hypothetical protein  60.48 
 
 		 174 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0855822  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1658  hypothetical protein  61.21 
 
 		 170 aa  218  7e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.268756  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2626  hypothetical protein  60.61 
 
 		 168 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2454  hypothetical protein  59.87 
 
 		 168 aa  208  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.542737  unclonable  0.00000219257 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3056  hypothetical protein  59.64 
 
 		 169 aa  205  5e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.210578  hitchhiker  0.00906067 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0250  hypothetical protein  54.88 
 
 		 172 aa  201  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0180  hypothetical protein  53.66 
 
 		 169 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1592  hypothetical protein  57.23 
 
 		 167 aa  194  6e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.18877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0829  protein of unknown function DUF45  57.05 
 
 		 170 aa  193  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3432  protein of unknown function DUF45  56.41 
 
 		 174 aa  191  6e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000422395 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1271  hypothetical protein  55.83 
 
 		 165 aa  191  6e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012956 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3023  hypothetical protein  51.57 
 
 		 167 aa  186  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1222  hypothetical protein  53.66 
 
 		 170 aa  185  4e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3622  hypothetical protein  52.5 
 
 		 175 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3068  hypothetical protein  52.2 
 
 		 165 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02144  hypothetical protein  52.56 
 
 		 171 aa  179  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3223  hypothetical protein  50.31 
 
 		 165 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4195  hypothetical protein  52.44 
 
 		 175 aa  179  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000226186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5007  hypothetical protein  51.22 
 
 		 179 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.311792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2641  protein of unknown function DUF45  49.7 
 
 		 167 aa  178  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  0.90331 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0188  hypothetical protein  51.97 
 
 		 166 aa  178  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2775  hypothetical protein  48.55 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.828021  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1539  hypothetical protein  52.5 
 
 		 169 aa  177  7e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1039  hypothetical protein  51.53 
 
 		 179 aa  177  7e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4958  hypothetical protein  51.22 
 
 		 179 aa  177  9e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4831  hypothetical protein  51.22 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1390  hypothetical protein  54.43 
 
 		 164 aa  176  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0508  hypothetical protein  50.93 
 
 		 166 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4315  hypothetical protein  52.26 
 
 		 170 aa  175  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5013  hypothetical protein  49.1 
 
 		 174 aa  175  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3293  hypothetical protein  44.38 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222647  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0616  protein of unknown function DUF45  50.61 
 
 		 167 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.903914  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4399  hypothetical protein  50.92 
 
 		 167 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.255986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1783  hypothetical protein  52.26 
 
 		 189 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0615  hypothetical protein  50.92 
 
 		 167 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003680  hypothetical protein  48.72 
 
 		 171 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3377  hypothetical protein  50.92 
 
 		 167 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3267  hypothetical protein  50.92 
 
 		 167 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3552  hypothetical protein  50.92 
 
 		 167 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.393221  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3521  hypothetical protein  50.92 
 
 		 167 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02954  predicted metal dependent hydrolase  50.92 
 
 		 167 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02904  hypothetical protein  50.92 
 
 		 167 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1485  hypothetical protein  49.69 
 
 		 167 aa  171  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.991457  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0498  hypothetical protein  50.9 
 
 		 169 aa  171  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1097  hypothetical protein  50.9 
 
 		 169 aa  171  5e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0560  hypothetical protein  50.9 
 
 		 169 aa  171  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0510  hypothetical protein  50 
 
 		 174 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0664  hypothetical protein  50.96 
 
 		 162 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0789398  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07290  hypothetical protein  52.26 
 
 		 162 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.303168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3055  hypothetical protein  49.68 
 
 		 169 aa  170  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5254  hypothetical protein  49.07 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0136  hypothetical protein  48.45 
 
 		 163 aa  169  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3505  hypothetical protein  46.95 
 
 		 167 aa  169  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3412  hypothetical protein  50.96 
 
 		 165 aa  165  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.934069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3482  hypothetical protein  50.96 
 
 		 165 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3578  hypothetical protein  50.96 
 
 		 165 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.146008 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3516  hypothetical protein  50.96 
 
 		 165 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503461  hitchhiker  0.0000110103 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3408  hypothetical protein  50.96 
 
 		 165 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1408  protein of unknown function DUF45  48.45 
 
 		 177 aa  165  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1134  hypothetical protein  45.96 
 
 		 180 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1839  hypothetical protein  46.58 
 
 		 162 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00369136  normal  0.470716 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3643  protein of unknown function DUF45  46.34 
 
 		 167 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276898  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3541  hypothetical protein  49.03 
 
 		 166 aa  163  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01747  hypothetical protein  49.03 
 
 		 175 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2061  hypothetical protein  50.34 
 
 		 174 aa  160  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0980857  normal  0.354164 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05640  hypothetical protein  48.15 
 
 		 171 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1608  hypothetical protein  45.34 
 
 		 162 aa  158  5e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000317368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2868  hypothetical protein  48.75 
 
 		 171 aa  158  6e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2355  protein of unknown function DUF45  48.75 
 
 		 172 aa  157  9e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.202802  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0062  protein of unknown function DUF45  48.1 
 
 		 173 aa  157  9e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0466  hypothetical protein  44.44 
 
 		 163 aa  156  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0130  hypothetical protein  44.1 
 
 		 168 aa  156  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0173602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1484  hypothetical protein  51.53 
 
 		 168 aa  155  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2949  protein of unknown function DUF45  46.5 
 
 		 166 aa  154  9e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.12197 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0142  putative metal-dependent hydrolase  49.65 
 
 		 153 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2650  hypothetical protein  47.4 
 
 		 203 aa  147  8e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.473621 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1213  protein of unknown function DUF45  42.77 
 
 		 168 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02667  hypothetical protein  42.07 
 
 		 165 aa  140  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.447659  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  32.1 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  32.1 
 
 		 300 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  30.86 
 
 		 316 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  32.1 
 
 		 300 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  30.86 
 
 		 295 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  30.86 
 
 		 295 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  30.86 
 
 		 295 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  30.86 
 
 		 292 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  30.86 
 
 		 285 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  30.86 
 
 		 303 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  30.86 
 
 		 292 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  30.86 
 
 		 292 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  30 
 
 		 301 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>