40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0824 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0824  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  338  2e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.332875 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1361  membrane-flanked domain  61.35 
 
 
172 aa  218  3e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.30148  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1403  hypothetical protein  55.15 
 
 
165 aa  200  7e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1602  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2576  membrane-flanked domain-containing protein  47.53 
 
 
146 aa  147  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.261166  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0579  membrane-flanked domain-containing protein  38.41 
 
 
153 aa  103  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0188  hypothetical protein  35.98 
 
 
157 aa  95.9  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.167897 
 
 
-
 
NC_002950  PG1471  hypothetical protein  34.38 
 
 
155 aa  92.8  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0078  hypothetical protein  36.48 
 
 
158 aa  88.2  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2094  hypothetical protein  33.14 
 
 
178 aa  85.1  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.859623  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0473  membrane-flanked domain-containing protein  36.36 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.325345  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7601  hypothetical protein  34 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.181543 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2068  hypothetical protein  31.25 
 
 
175 aa  75.1  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0096  hypothetical membrane associated protein  31.25 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.129963  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2654  hypothetical protein  31.61 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2524  hypothetical protein  31.61 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  27.49 
 
 
166 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1284  membrane-flanked domain-containing protein  32.22 
 
 
208 aa  58.9  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.935757  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1149  membrane-flanked domain protein  31.82 
 
 
126 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  27.41 
 
 
170 aa  52.4  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  31.82 
 
 
229 aa  50.8  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  28.68 
 
 
203 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  26.75 
 
 
185 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1171  membrane-flanked domain-containing protein  28.37 
 
 
289 aa  48.5  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  23.38 
 
 
219 aa  47.8  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0446  membrane-flanked domain  33.33 
 
 
194 aa  47.4  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000176229  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  20.45 
 
 
227 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1328  membrane-flanked domain protein  29.7 
 
 
198 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000392278 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  27.33 
 
 
245 aa  45.8  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  25.81 
 
 
172 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  25.81 
 
 
172 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  25.81 
 
 
172 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  26.67 
 
 
189 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  34.48 
 
 
170 aa  43.9  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0162  hypothetical protein  31.25 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.373951  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  30.86 
 
 
181 aa  42  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1800  hypothetical protein  28.57 
 
 
170 aa  42  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.504578  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3601  membrane-flanked domain protein  29.27 
 
 
173 aa  42  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  29.59 
 
 
189 aa  41.6  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1045  membrane-flanked domain protein  24.2 
 
 
182 aa  41.6  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  38.46 
 
 
252 aa  40.8  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>