197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0055 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0055  Forkhead-associated protein  100 
 
 
260 aa  518  1e-146  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2371  diguanylate cyclase  37.76 
 
 
294 aa  66.6  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.191081 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0908  FHA domain-containing protein  40.74 
 
 
162 aa  62.4  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000938723  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0027  forkhead-associated protein  40.66 
 
 
158 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.620379  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  30.84 
 
 
566 aa  60.1  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4227  FHA domain containing protein  31.97 
 
 
308 aa  59.3  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208424  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2598  Forkhead-associated protein  35.71 
 
 
350 aa  58.9  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00800  FHA domain-containing protein  36.96 
 
 
186 aa  58.2  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.151264  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5712  diguanylate cyclase  37.36 
 
 
316 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.54195  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0219  diguanylate cyclase  34.82 
 
 
303 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3464  FHA domain containing protein  35.79 
 
 
694 aa  56.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0731719  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0092  FHA domain containing protein  45.83 
 
 
219 aa  55.8  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2992  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 
387 aa  55.5  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2541  FHA domain-containing protein  32.99 
 
 
514 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.913197  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00230  FHA domain-containing protein  34.38 
 
 
160 aa  55.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.853372  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3938  FHA domain-containing protein  30.48 
 
 
529 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2309  FHA domain-containing protein  32.29 
 
 
279 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0931454  hitchhiker  0.000599707 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0136  diguanylate cyclase  42.68 
 
 
288 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.041844  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28591  hypothetical protein  33.33 
 
 
770 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2308  FHA domain-containing protein  37.66 
 
 
149 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0512464  hitchhiker  0.000482709 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5478  FHA domain containing protein  35.71 
 
 
673 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366631  normal  0.328506 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3733  FHA domain containing protein  38.46 
 
 
172 aa  53.9  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.399873  normal  0.0527204 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1296  FHA domain-containing protein  30.46 
 
 
1493 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1735  Forkhead-associated protein  40 
 
 
269 aa  53.1  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.164124  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0907  FHA domain-containing protein  36.26 
 
 
252 aa  53.5  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000610253  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3218  Stage II sporulation E family protein  36.36 
 
 
630 aa  53.1  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717708  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1632  FHA domain containing protein  37.93 
 
 
149 aa  53.1  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0024  FHA domain-containing protein  36.17 
 
 
280 aa  52.8  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1054  FHA domain-containing protein  33.7 
 
 
405 aa  52.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.779489  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0076  FHA domain containing protein  33.67 
 
 
166 aa  52.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103103  normal  0.271335 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2501  FHA domain-containing protein  37.17 
 
 
306 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.320482  decreased coverage  0.000381992 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0026  FHA domain containing protein  28.12 
 
 
154 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.259874  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2154  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  40.28 
 
 
851 aa  51.6  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.288386  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1780  FHA domain-containing protein  32.95 
 
 
154 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000257566  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2060  FHA domain-containing protein  38.89 
 
 
154 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52887  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0030  FHA domain containing protein  35.42 
 
 
169 aa  52  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1268  hypothetical protein  36.08 
 
 
270 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.331296  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3359  hypothetical protein  32.74 
 
 
291 aa  50.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.110922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0103  FHA domain containing protein  35.56 
 
 
189 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0428649  normal  0.0274724 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1709  FHA domain-containing protein  34.34 
 
 
268 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  39.18 
 
 
1108 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18260  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
167 aa  50.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37.66 
 
 
1004 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2709  FHA domain-containing protein  33.68 
 
 
456 aa  50.1  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0033  FHA domain containing protein  37.8 
 
 
428 aa  50.4  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2688  FHA domain containing protein  35.71 
 
 
272 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00226297  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0040  FHA domain containing protein  32.29 
 
 
154 aa  50.1  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.906333  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0150  diguanylate cyclase  38.67 
 
 
289 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0139  diguanylate cyclase  38.67 
 
 
289 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0031  Forkhead-associated protein  36.67 
 
 
433 aa  50.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2595  FHA domain containing protein  35.71 
 
 
272 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0860474  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0031  FHA domain containing protein  34.04 
 
 
161 aa  49.7  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.74184  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0035  FHA domain protein  32.97 
 
 
178 aa  49.7  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0013  FHA domain containing protein  41.33 
 
 
170 aa  49.7  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.943282  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27030  FHA domain-containing protein  38.78 
 
 
474 aa  49.3  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3181  FHA domain-containing protein  29.52 
 
 
302 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.999719  normal  0.141986 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0895  FHA domain containing protein  35.23 
 
 
122 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0082  FHA domain containing protein  32.29 
 
 
156 aa  49.3  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0678  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.07 
 
 
510 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0623565  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0553  FHA domain-containing protein  32.29 
 
 
226 aa  49.3  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4534  FHA domain-containing protein  35.14 
 
 
298 aa  48.9  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.259874  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0899  FHA domain containing protein  35.23 
 
 
122 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0223  FHA domain-containing protein  36.05 
 
 
513 aa  48.9  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.443938 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0751  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  40.79 
 
 
863 aa  48.9  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.039806 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0132  diguanylate cyclase  37.33 
 
 
289 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0508624  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0429  diguanylate cyclase  33.94 
 
 
338 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6477  FHA domain-containing protein  38.64 
 
 
246 aa  48.9  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0374778 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0307  FHA domain-containing protein  31.68 
 
 
444 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0032  FHA domain containing protein  32.32 
 
 
154 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0020  FHA domain-containing protein  30.93 
 
 
154 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.711255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0028  FHA domain-containing protein  30.93 
 
 
154 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.377029  hitchhiker  0.00774619 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0020  FHA domain-containing protein  30.93 
 
 
154 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.844855  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0175  FHA domain containing protein  29.17 
 
 
152 aa  48.1  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.545255  normal  0.675228 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0042  FHA domain-containing protein  35.96 
 
 
262 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0179739  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2502  FHA domain containing protein  39.33 
 
 
435 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0034  FHA domain containing protein  30.93 
 
 
175 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0140  FHA domain-containing protein  36.52 
 
 
533 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.425814  hitchhiker  0.00649643 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2102  FHA domain containing protein  34.44 
 
 
174 aa  48.5  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3061  FHA domain-containing protein  30.21 
 
 
159 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5167  FHA domain containing protein  37.04 
 
 
320 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.445837  normal  0.281623 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1666  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.88 
 
 
799 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4141  diguanylate cyclase  29.22 
 
 
312 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274749 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00410  FHA domain-containing protein  29.9 
 
 
156 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.649805 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2193  transcriptional regulator, SARP family  34.44 
 
 
385 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163999  hitchhiker  0.00133858 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0047  FHA domain-containing protein  35.96 
 
 
253 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.183651 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4979  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
158 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232716  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0874  FHA domain containing protein  30.85 
 
 
167 aa  48.1  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1639  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  36.05 
 
 
799 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1302  FHA domain containing protein  33.33 
 
 
161 aa  47.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4010  FHA domain containing protein  33.33 
 
 
156 aa  47  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.196899  normal  0.106089 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0458  diguanylate cyclase  34.83 
 
 
326 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0330  FHA domain-containing protein  31.17 
 
 
144 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3040  FHA domain containing protein  41.46 
 
 
137 aa  47.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1456  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  38.1 
 
 
623 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.80149  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1886  FHA domain containing protein  35.05 
 
 
156 aa  47  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0328071 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0473  hypothetical protein  36.78 
 
 
147 aa  47  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.592992  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0457  diguanylate cyclase  34.83 
 
 
326 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0025  FHA domain containing protein  29.9 
 
 
160 aa  47  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143268 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0237  ATP-binding region ATPase domain protein  38.16 
 
 
567 aa  46.6  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0023  FHA domain-containing protein  30.93 
 
 
153 aa  46.6  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>