More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3618 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3618  PhoH family protein  100 
 
 		 342 aa  691    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0041  PhoH family protein  60.43 
 
 		 351 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000833124 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0438  phosphate starvation inducible protein  59.94 
 
 		 357 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0030  PhoH family protein  59.94 
 
 		 349 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0018  PhoH family protein  59.62 
 
 		 350 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.28473 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0757  PhoH family protein  58.02 
 
 		 353 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.899998  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3771  PhoH-like protein  59.56 
 
 		 322 aa  372  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2155  PhoH family protein  60.83 
 
 		 327 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0868609  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3920  PhoH-like protein  56.68 
 
 		 348 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2067  PhoH family protein  60.51 
 
 		 327 aa  366  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0286047  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1016  PhoH family protein  57.73 
 
 		 337 aa  363  2e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0442383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0069  PhoH family protein  54.6 
 
 		 363 aa  362  5.0000000000000005e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0287585 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3599  hypothetical protein  57.59 
 
 		 346 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2388  PhoH family protein  58.31 
 
 		 360 aa  360  2e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.156507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3284  PhoH family protein  57.59 
 
 		 346 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1354  PhoH family protein  58.79 
 
 		 333 aa  359  3e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0963523  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3873  hypothetical protein  57.68 
 
 		 339 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0981  PhoH-like protein  57.59 
 
 		 348 aa  357  1.9999999999999998e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3692  PhoH family protein  56.77 
 
 		 375 aa  352  5e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.316664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0188  PhoH-like protein  55.8 
 
 		 338 aa  351  8e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0451  PhoH family protein  58.28 
 
 		 351 aa  348  6e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0015  PhoH-like protein  56.69 
 
 		 349 aa  347  2e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.945712  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0638  PhoH family protein  58.41 
 
 		 338 aa  346  3e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0022  PhoH-like protein  56.37 
 
 		 349 aa  345  7e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.232507  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3529  PhoH family protein  55.94 
 
 		 368 aa  345  7e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3205  PhoH family protein  55.94 
 
 		 368 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0700  PhoH-like protein  56.05 
 
 		 373 aa  344  2e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.233967 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0469  PhoH-like protein  56.73 
 
 		 352 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0047  putative phosphate starvation-inducible protein, PhoH-like protein  56.73 
 
 		 345 aa  343  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2063  PhoH-like protein  55.21 
 
 		 335 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.590057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3400  PhoH family protein  55.94 
 
 		 368 aa  342  5e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1811  PhoH family protein  56.92 
 
 		 379 aa  342  5e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147763  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0241  PhoH-like protein  55.27 
 
 		 351 aa  342  7e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0591  PhoH-like protein, phosphate starvation inducible  54.86 
 
 		 344 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3181  PhoH family protein  56.11 
 
 		 365 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0246823  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1244  PhoH family protein  52.1 
 
 		 370 aa  338  9e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0234  PhoH family protein  55.28 
 
 		 369 aa  335  9e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.253584  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1056  PhoH family protein  54.83 
 
 		 341 aa  329  4e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.563658  normal  0.821458 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2896  PhoH family protein  52.06 
 
 		 355 aa  324  1e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.434704 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1231  putative ATP-binding protein in pho regulon  53.72 
 
 		 339 aa  314  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000466652  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1733  PhoH family protein  51.74 
 
 		 326 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1340  PhoH family protein  49.06 
 
 		 328 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0134835  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1815  PhoH family protein  51.16 
 
 		 323 aa  303  2.0000000000000002e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.294918  normal  0.443651 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3538  PhoH-like protein  50.99 
 
 		 359 aa  302  7.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4204  PhoH family protein  52.16 
 
 		 319 aa  298  8e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4042  PhoH family protein  52.16 
 
 		 319 aa  298  8e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4052  PhoH family protein  52.16 
 
 		 319 aa  298  8e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4327  PhoH family protein  52.16 
 
 		 319 aa  298  8e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24127e-53 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4529  PhoH family protein  52.16 
 
 		 319 aa  298  8e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4385  PhoH family protein  52.16 
 
 		 319 aa  297  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0814  PhoH family protein  51.83 
 
 		 319 aa  297  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.429473  decreased coverage  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4156  PhoH family protein  52.16 
 
 		 319 aa  297  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4438  PhoH family protein  52.16 
 
 		 319 aa  297  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000388335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4422  PhoH family protein  51.83 
 
 		 319 aa  296  3e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.273758  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0779  PhoH family protein  51.94 
 
 		 331 aa  295  5e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1071  PhoH-like protein  49.53 
 
 		 333 aa  295  5e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2426  PhoH family protein  52.51 
 
 		 320 aa  295  6e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000154292  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2230  PhoH family protein  50 
 
 		 329 aa  295  6e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.148579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0749  PhoH family protein  51.32 
 
 		 327 aa  295  8e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00019197 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2905  PhoH family protein  49.22 
 
 		 359 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.21329  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0597  PhoH-like protein  51.32 
 
 		 340 aa  295  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3031  PhoH family protein  51.5 
 
 		 319 aa  294  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2813  PhoH family protein  49.22 
 
 		 359 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1127  hypothetical protein  50.81 
 
 		 340 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3070  PhoH family protein  49.2 
 
 		 324 aa  293  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000842405 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2721  PhoH-like protein  49.53 
 
 		 354 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1558  PhoH family protein  50.16 
 
 		 332 aa  293  3e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.400448  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0242  PhoH family protein  48.28 
 
 		 344 aa  292  4e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0574  PhoH family protein  49.16 
 
 		 322 aa  293  4e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184118  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1436  PhoH family protein  51.29 
 
 		 326 aa  293  4e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3301  lipoate synthase  49.38 
 
 		 364 aa  292  5e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0967934 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12330  hypothetical protein  50.49 
 
 		 340 aa  292  5e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0575  PhoH family protein  50.78 
 
 		 331 aa  292  7e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0928819 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1225  PhoH family protein  51.14 
 
 		 323 aa  291  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0814  PhoH-like protein  50.16 
 
 		 365 aa  291  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1138  PhoH family protein  49.21 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4951  PhoH-like protein  50.64 
 
 		 334 aa  289  4e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3832  PhoH family protein  51.29 
 
 		 351 aa  289  4e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0480  phosphate starvation-induced protein  50.84 
 
 		 353 aa  289  5.0000000000000004e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0712  PhoH family protein  49.68 
 
 		 347 aa  288  7e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3701  PhoH family protein  48.32 
 
 		 335 aa  288  9e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.933672  normal  0.818626 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0633  PhoH family protein  51.31 
 
 		 332 aa  288  9e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1663  PhoH family protein  48.55 
 
 		 315 aa  287  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2721  PhoH family protein  49.1 
 
 		 352 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0225  PhoH family protein  49.1 
 
 		 352 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2705  PhoH-like protein  49.2 
 
 		 319 aa  287  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4841  PhoH family protein  50.48 
 
 		 332 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2357  PhoH family protein  49.1 
 
 		 352 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1629  PhoH family protein  48.55 
 
 		 315 aa  287  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2437  PhoH family protein  49.1 
 
 		 352 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0492  PhoH family protein  48.32 
 
 		 335 aa  287  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.307318  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3780  PhoH family protein  51.27 
 
 		 350 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.150452 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3573  phoH family protein  47.77 
 
 		 368 aa  286  5e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189544  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0888  PhoH family protein  48.8 
 
 		 354 aa  286  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.437404  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2713  PhoH family protein  48.09 
 
 		 356 aa  286  5e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.787993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0709  PhoH family protein  48.8 
 
 		 354 aa  286  5e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95861  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0723  PhoH family protein  48.8 
 
 		 354 aa  286  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4663  PhoH family protein  50.16 
 
 		 332 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337379  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4787  PhoH family protein  50.16 
 
 		 332 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0880837 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3528  PhoH-like protein  48.35 
 
 		 340 aa  285  9e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.959961  normal  0.0258567 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>