More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1166 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1166  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 		 446 aa  890    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0836  Ppx/GppA phosphatase  54.57 
 
 		 441 aa  364  1e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0685  Ppx/GppA family phosphatase  52.46 
 
 		 498 aa  351  1e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0641  Ppx/GppA family phosphatase  52.46 
 
 		 498 aa  351  1e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0251449  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3811  Ppx/GppA phosphatase  53.43 
 
 		 504 aa  351  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000504204  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0471  Ppx/GppA phosphatase  52.02 
 
 		 413 aa  347  2e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1927  Ppx/GppA phosphatase  52.36 
 
 		 378 aa  344  2e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0888  exopolyphosphatase  53.58 
 
 		 603 aa  343  2.9999999999999997e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00574973  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0427  Ppx/GppA phosphatase  48.92 
 
 		 520 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3629  Ppx/GppA phosphatase  51.1 
 
 		 380 aa  336  5e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  0.0833507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3742  Ppx/GppA phosphatase  53.27 
 
 		 375 aa  333  3e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3082  Ppx/GppA phosphatase  50.83 
 
 		 366 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1516  Ppx/GppA phosphatase  53.73 
 
 		 376 aa  333  4e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219937  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0472  Ppx/GppA phosphatase  48.54 
 
 		 433 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3433  Ppx/GppA phosphatase  53.27 
 
 		 375 aa  331  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.513976 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0372  Ppx/GppA phosphatase  49.39 
 
 		 509 aa  330  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0659  Ppx/GppA phosphatase  53.92 
 
 		 367 aa  330  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3596  Ppx/GppA phosphatase  51.14 
 
 		 357 aa  326  6e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137051  normal  0.0418911 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1331  Ppx/GppA phosphatase  56.05 
 
 		 389 aa  324  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0142  Ppx/GppA phosphatase  50.68 
 
 		 360 aa  323  5e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279399  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2151  Ppx/GppA phosphatase  51.83 
 
 		 355 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2210  Ppx/GppA phosphatase  51.37 
 
 		 375 aa  317  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0781544  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1170  Ppx/GppA phosphatase  49.85 
 
 		 373 aa  316  6e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.854732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0246  Ppx/GppA phosphatase  52.91 
 
 		 399 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944048  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2489  Ppx/GppA phosphatase  49.72 
 
 		 355 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552862  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2550  Ppx/GppA phosphatase  53.66 
 
 		 331 aa  309  6.999999999999999e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0473  Ppx/GppA phosphatase  51.33 
 
 		 435 aa  307  3e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4719  Ppx/GppA phosphatase  51.12 
 
 		 355 aa  293  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0584151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2258  Ppx/GppA phosphatase  50.91 
 
 		 325 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.613366 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3197  Ppx/GppA phosphatase  51.52 
 
 		 358 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.366219  normal  0.365881 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3989  Ppx/GppA phosphatase  43.01 
 
 		 374 aa  284  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1183  Ppx/GppA phosphatase  44.44 
 
 		 370 aa  279  8e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2753  Ppx/GppA phosphatase  50 
 
 		 363 aa  278  1e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2012  Ppx/GppA phosphatase  48.51 
 
 		 364 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1031  Ppx/GppA phosphatase  44.71 
 
 		 378 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1980  Ppx/GppA phosphatase  42.55 
 
 		 393 aa  273  4.0000000000000004e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.307298 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1413  Ppx/GppA phosphatase  44.41 
 
 		 378 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.899781  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2771  putative exopolyphosphatase  44.41 
 
 		 378 aa  272  7e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.571811  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1673  phosphatase  41.62 
 
 		 393 aa  266  4e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.131499  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0093  Ppx/GppA phosphatase  46.35 
 
 		 377 aa  254  3e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0904257  normal  0.209158 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2154  Ppx/GppA phosphatase  35.71 
 
 		 300 aa  144  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2062  Ppx/GppA phosphatase  35.09 
 
 		 300 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  30.77 
 
 		 549 aa  134  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00540  Exopolyphosphatase  30.25 
 
 		 305 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000336687  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5822  Ppx/GppA phosphatase  33.64 
 
 		 321 aa  131  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0810  Ppx/GppA phosphatase  33.04 
 
 		 318 aa  130  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1851  Ppx/GppA phosphatase  34.16 
 
 		 311 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210768  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8578  Ppx/GppA phosphatase  31.75 
 
 		 319 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32210  Ppx/GppA phosphatase  33.92 
 
 		 318 aa  126  8.000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1741  Ppx/GppA family phosphatase  35.37 
 
 		 307 aa  126  9e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193404  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0132  Ppx/GppA phosphatase  31.58 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  29.19 
 
 		 513 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2679  Ppx/GppA phosphatase  34.43 
 
 		 327 aa  124  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  31.99 
 
 		 510 aa  124  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3129  Ppx/GppA phosphatase  34.85 
 
 		 311 aa  123  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal  0.0109976 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1828  Ppx/GppA phosphatase  34.39 
 
 		 304 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.707842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  31.88 
 
 		 511 aa  121  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0667  Ppx/GppA phosphatase family protein  30.83 
 
 		 568 aa  120  6e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0810  Ppx/GppA phosphatase  29.39 
 
 		 305 aa  120  6e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.11092  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  30.43 
 
 		 513 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  27.38 
 
 		 507 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2137  Ppx/GppA phosphatase  32.1 
 
 		 303 aa  117  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00893545  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1022  Ppx/GppA phosphatase  36.11 
 
 		 319 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45924  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  27.89 
 
 		 570 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1779  Ppx/GppA phosphatase  30.65 
 
 		 311 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  29.18 
 
 		 502 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0912  Ppx/GppA phosphatase  33.89 
 
 		 330 aa  114  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.694762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1566  polyPpx/GppA family phosphatase  28.7 
 
 		 308 aa  113  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258002  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0238  Ppx/GppA phosphatase  26.79 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.218725  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  27.68 
 
 		 545 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  27.68 
 
 		 545 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0090  Ppx/GppA phosphatase  28.92 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0772  exopolyphosphatase  30.33 
 
 		 333 aa  110  5e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0923  Ppx/GppA phosphatase  31.02 
 
 		 323 aa  110  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  29.41 
 
 		 501 aa  110  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0244  exopolyphosphatase  26.81 
 
 		 321 aa  110  5e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  26.35 
 
 		 550 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0153  Ppx/GppA phosphatase  31.83 
 
 		 318 aa  110  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1039  Ppx/GppA phosphatase  30.46 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  26.05 
 
 		 301 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2990  Ppx/GppA phosphatase  27.47 
 
 		 519 aa  107  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2578  Ppx/GppA phosphatase  27.33 
 
 		 506 aa  108  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  30.06 
 
 		 502 aa  106  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07880  Ppx/GppA phosphatase  30.26 
 
 		 353 aa  106  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.605483  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5209  Ppx/GppA phosphatase  31.69 
 
 		 310 aa  106  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1920  Ppx/GppA phosphatase  32.69 
 
 		 328 aa  106  8e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0702  Ppx/GppA phosphatase  31.14 
 
 		 307 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.176002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1955  Ppx/GppA phosphatase  27.38 
 
 		 523 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0431  Ppx/GppA phosphatase  30.47 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0724245  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0894  Ppx/GppA phosphatase  33.13 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0829909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  29.69 
 
 		 500 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0123  Ppx/GppA phosphatase  27.64 
 
 		 296 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0501  Ppx/GppA phosphatase  27.38 
 
 		 519 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0338  Ppx/GppA phosphatase  28.53 
 
 		 323 aa  105  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0074  Ppx/GppA phosphatase  30.55 
 
 		 326 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10959  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1573  Ppx/GppA phosphatase  30 
 
 		 505 aa  105  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  27.69 
 
 		 544 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0675  Ppx/GppA phosphatase  33.01 
 
 		 320 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  27.69 
 
 		 544 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0154  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  28.61 
 
 		 500 aa  104  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>