More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3631 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3631  transcriptional regulator of ArsR family protein  100 
 
 		 103 aa  209  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  55.32 
 
 		 102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05708  hypothetical protein  62.07 
 
 		 97 aa  110  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  51.58 
 
 		 105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0132  transcriptional regulator, TrmB  45.92 
 
 		 107 aa  93.6  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0240  ArsR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2316  transcriptional regulator, TrmB  42.86 
 
 		 107 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.66279  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 94 aa  87  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4139  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 107 aa  87  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 122 aa  86.7  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  44.94 
 
 		 97 aa  85.9  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 101 aa  84.7  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5567  transcriptional regulator, ArsR family  40.43 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0020  regulatory protein, ArsR  46.07 
 
 		 101 aa  82  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2570  transcriptional regulator, ArsR family  40.7 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  43.62 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  42.55 
 
 		 101 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  44.32 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 116 aa  80.5  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1145  regulatory protein ArsR  45.92 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1304  transcriptional regulator, TrmB  45.92 
 
 		 112 aa  80.1  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  37.89 
 
 		 116 aa  80.1  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 96 aa  80.1  0.000000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 101 aa  79  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  40.23 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2719  ArsR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.567725  normal  0.990238 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  40.21 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 101 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  44.83 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 101 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  35.87 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2370  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000192814  hitchhiker  0.0000168087 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 98 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 102 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  42.55 
 
 		 102 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  39.56 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  40.45 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  42.55 
 
 		 102 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 102 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  44.32 
 
 		 102 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  42.55 
 
 		 102 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1190  ArsR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 98 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00010661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0023  ArsR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124872  hitchhiker  0.000733869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000364753  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  42.05 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  40.45 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1937  ArsR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  47.56 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  42.39 
 
 		 98 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1619  regulatory protein ArsR  36.73 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  47.56 
 
 		 98 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0210  transcriptional activator HlyU  40.48 
 
 		 85 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000976206  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1877  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.42284  hitchhiker  0.00584724 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3538  transcriptional regulator HlyU  42.39 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3239  transcriptional regulator, ArsR family  42.39 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00078895  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  42.39 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3214  transcriptional regulator, ArsR family  37 
 
 		 99 aa  74.3  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1050  regulatory protein, ArsR  42.39 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000242354  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1151  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000355977  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2961  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318119  normal  0.703465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3043  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000176438  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3141  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  41.05 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  42.39 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4718  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4102  transcriptional regulator ArsR family  41.77 
 
 		 90 aa  73.6  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00250446  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0205  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2308  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126004  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  36.56 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02523  predicted DNA-binding transcriptional regulator  37 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1016  transcriptional regulator, ArsR family  37 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  38.89 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2947  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3418  ArsR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00835555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4035  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.137887 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2752  transcriptional regulator, TrmB  45.57 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2802  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1039  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02487  hypothetical protein  37 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  42.05 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  36.17 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2787  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 		 99 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.255483 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2292  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 99 aa  72  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.863307  hitchhiker  0.000000172581 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  40.91 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0793  regulatory protein, ArsR  37.23 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>