More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1656 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1656  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 435 aa  895    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.554535  normal  0.968546 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003848  histidinol dehydrogenase  66.2 
 
 		 430 aa  591  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0703  histidinol dehydrogenase  64.97 
 
 		 431 aa  581  1.0000000000000001e-165  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01831  histidinol dehydrogenase  64.87 
 
 		 436 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1134  histidinol dehydrogenase  64.87 
 
 		 431 aa  572  1.0000000000000001e-162  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2429  histidinol dehydrogenase  61.03 
 
 		 443 aa  539  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3170  histidinol dehydrogenase  61.03 
 
 		 443 aa  539  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.992848 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2526  histidinol dehydrogenase  61.03 
 
 		 443 aa  539  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1744  histidinol dehydrogenase  59.76 
 
 		 442 aa  522  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0770175  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2011  histidinol dehydrogenase  60 
 
 		 442 aa  524  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.862973  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2330  histidinol dehydrogenase  59.58 
 
 		 436 aa  521  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0874985  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3890  histidinol dehydrogenase  60.42 
 
 		 434 aa  511  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.150271  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1615  histidinol dehydrogenase  60.24 
 
 		 435 aa  514  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.217176 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2228  histidinol dehydrogenase  60.74 
 
 		 436 aa  513  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156171  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2881  histidinol dehydrogenase  60.09 
 
 		 438 aa  510  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2410  histidinol dehydrogenase  58.35 
 
 		 434 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.426978  hitchhiker  0.000337345 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2298  histidinol dehydrogenase  58.35 
 
 		 434 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.219652  normal  0.0600324 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1637  Histidinol dehydrogenase  57.65 
 
 		 434 aa  498  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140746  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2251  histidinol dehydrogenase  58.35 
 
 		 434 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.849877  normal  0.226426 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2300  histidinol dehydrogenase  58.12 
 
 		 434 aa  498  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0711798 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2632  histidinol dehydrogenase  56.71 
 
 		 434 aa  498  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2197  histidinol dehydrogenase  58.35 
 
 		 434 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01908  hypothetical protein  57.65 
 
 		 434 aa  495  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2953  histidinol dehydrogenase  58.12 
 
 		 434 aa  496  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.525891  hitchhiker  0.00000000725252 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2311  histidinol dehydrogenase  57.41 
 
 		 434 aa  496  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.6226  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1212  histidinol dehydrogenase  57.65 
 
 		 434 aa  497  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1040  histidinol dehydrogenase  57.41 
 
 		 434 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.204161 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2159  histidinol dehydrogenase  57.18 
 
 		 434 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1622  histidinol dehydrogenase  57.18 
 
 		 434 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.426183 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01117  Histidinol dehydrogenase  56.88 
 
 		 434 aa  494  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01922  histidinol dehydrogenase  58.68 
 
 		 413 aa  484  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0404  histidinol dehydrogenase  57.55 
 
 		 437 aa  486  1e-136  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1719  histidinol dehydrogenase  56.24 
 
 		 429 aa  483  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1942  histidinol dehydrogenase  55.61 
 
 		 435 aa  476  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1617  histidinol dehydrogenase  55.48 
 
 		 438 aa  475  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2091  histidinol dehydrogenase  55.84 
 
 		 433 aa  472  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.538657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2542  histidinol dehydrogenase  53.95 
 
 		 439 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.348533  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2073  histidinol dehydrogenase  54.92 
 
 		 438 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1770  histidinol dehydrogenase  56.78 
 
 		 428 aa  463  1e-129  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.381654  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1951  histidinol dehydrogenase  56.78 
 
 		 428 aa  463  1e-129  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0222803  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1585  histidinol dehydrogenase  56.54 
 
 		 428 aa  462  1e-129  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1799  histidinol dehydrogenase  56.35 
 
 		 433 aa  464  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2198  histidinol dehydrogenase  54.42 
 
 		 443 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0308106 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2426  histidinol dehydrogenase  55.32 
 
 		 433 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2178  histidinol dehydrogenase  55.09 
 
 		 433 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2419  histidinol dehydrogenase  54.86 
 
 		 433 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2537  histidinol dehydrogenase  55.09 
 
 		 433 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1853  histidinol dehydrogenase  55.09 
 
 		 433 aa  457  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.553413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1932  histidinol dehydrogenase  54.86 
 
 		 433 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2457  histidinol dehydrogenase  53.02 
 
 		 442 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2179  histidinol dehydrogenase  54.27 
 
 		 433 aa  449  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0098  histidinol dehydrogenase  53.97 
 
 		 426 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000736266  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1141  histidinol dehydrogenase  50.96 
 
 		 422 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.517537  normal  0.0197724 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1784  histidinol dehydrogenase  50.48 
 
 		 429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3192  histidinol dehydrogenase  47.92 
 
 		 430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.405899 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13980  predicted protein  49.88 
 
 		 429 aa  404  1e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332062  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00797  hypothetical histidine biosynthesis trifunctional protein (Eurofung)  49.76 
 
 		 867 aa  400  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.342936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1818  histidinol dehydrogenase  50.72 
 
 		 429 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09011  putative histidinol dehydrogenase  47.11 
 
 		 429 aa  398  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1861  histidinol dehydrogenase  49.04 
 
 		 428 aa  398  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181634 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1757  histidinol dehydrogenase  48.48 
 
 		 431 aa  383  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.338237  normal  0.0340923 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2877  histidinol dehydrogenase  46.51 
 
 		 427 aa  381  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.612016  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06120  histidinol dehydrogenase, putative  48.05 
 
 		 852 aa  377  1e-103  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00833  histidinol dehydrogenase  48.83 
 
 		 431 aa  375  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104597  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89228  Histidine biosynthesis trifunctional protein  46.62 
 
 		 867 aa  374  1e-102  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.145236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09670  histidinol dehydrogenase  47.55 
 
 		 439 aa  370  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0576344  normal  0.0399309 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1201  histidinol dehydrogenase  45.56 
 
 		 431 aa  368  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0715  histidinol dehydrogenase  44.88 
 
 		 429 aa  366  1e-100  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000324572 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1352  histidinol dehydrogenase  48.96 
 
 		 431 aa  367  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1419  histidinol dehydrogenase  48.72 
 
 		 431 aa  363  2e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1207  histidinol dehydrogenase  44.86 
 
 		 431 aa  363  5.0000000000000005e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0461  histidinol dehydrogenase  47.42 
 
 		 403 aa  349  6e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0659  histidinol dehydrogenase  44.16 
 
 		 433 aa  349  7e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  43.4 
 
 		 433 aa  344  2e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  45.37 
 
 		 437 aa  342  5e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  43.56 
 
 		 436 aa  342  5.999999999999999e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  44.88 
 
 		 434 aa  342  7e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2531  histidinol dehydrogenase  44.7 
 
 		 442 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.742259 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1103  histidinol dehydrogenase  43.26 
 
 		 426 aa  340  4e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000289644  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  44.42 
 
 		 429 aa  338  8e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  41.12 
 
 		 424 aa  338  9.999999999999999e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1876  histidinol dehydrogenase  45.2 
 
 		 416 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.963985  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  45.27 
 
 		 424 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  44.63 
 
 		 434 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  45.31 
 
 		 445 aa  335  1e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  43.42 
 
 		 436 aa  333  3e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  43.78 
 
 		 429 aa  333  3e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0979  histidinol dehydrogenase  45.12 
 
 		 438 aa  333  5e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.968374 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  44.39 
 
 		 434 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  43.42 
 
 		 429 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  43.26 
 
 		 430 aa  332  7.000000000000001e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  43.53 
 
 		 429 aa  332  9e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  43.58 
 
 		 427 aa  330  4e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0966  histidinol dehydrogenase  42.41 
 
 		 441 aa  328  9e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  43.53 
 
 		 429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1005  histidinol dehydrogenase  42.41 
 
 		 441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.866219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  43.28 
 
 		 429 aa  327  3e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  44.34 
 
 		 431 aa  327  3e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  42.65 
 
 		 429 aa  326  6e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  43.36 
 
 		 429 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>