More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3091 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3091  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
263 aa  527  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000546581  normal  0.020085 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2636  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  58.75 
 
 
256 aa  299  3e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5405  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56 
 
 
252 aa  291  6e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1505  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.9 
 
 
257 aa  287  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2052  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.94 
 
 
266 aa  278  5e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.754921 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2059  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.07 
 
 
252 aa  276  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6616  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.03 
 
 
258 aa  268  8.999999999999999e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0293079 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4641  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.98 
 
 
262 aa  264  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2385  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.79 
 
 
252 aa  256  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.10506  normal  0.665855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2619  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.81 
 
 
257 aa  251  6e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923758  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0457  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.73 
 
 
249 aa  218  1e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000204102  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3275  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  43.4 
 
 
254 aa  194  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413424  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3863  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.22 
 
 
258 aa  192  7e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707668  hitchhiker  0.0000644403 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0289  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.35 
 
 
239 aa  191  8e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00797828  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.39 
 
 
504 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2286  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.3 
 
 
258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2337  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.3 
 
 
258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1481  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.37 
 
 
258 aa  189  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1689  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.46 
 
 
239 aa  188  8e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0240  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.55 
 
 
242 aa  187  2e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2922  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.04 
 
 
260 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.215743  normal  0.0409844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1175  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.73 
 
 
252 aa  187  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0224859 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1989  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.42 
 
 
246 aa  186  3e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.519237  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0789  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.62 
 
 
239 aa  186  4e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194909  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.5 
 
 
502 aa  186  4e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.45 
 
 
528 aa  186  4e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  41.88 
 
 
554 aa  185  5e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3559  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.88 
 
 
261 aa  185  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.895893  normal  0.323938 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.08 
 
 
259 aa  185  8e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2610  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.56 
 
 
265 aa  185  8e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0897375 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1335  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.49 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1308  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.49 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.91 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00230836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1445  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.49 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.51628  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.49 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58633e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1549  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.62 
 
 
258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1668  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.25 
 
 
271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.228653  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1587  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.49 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1349  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.95 
 
 
258 aa  182  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.758533  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  40.82 
 
 
520 aa  182  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1371  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.17 
 
 
502 aa  183  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.5 
 
 
504 aa  183  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1682  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.77 
 
 
264 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.577733 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0211  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.19 
 
 
239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.283358 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1309  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.08 
 
 
258 aa  182  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3751  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.08 
 
 
282 aa  181  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.35 
 
 
463 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.07 
 
 
519 aa  181  8.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2189  uroporphyrin-III C-methyltransferase, putative  42.37 
 
 
259 aa  181  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  39.74 
 
 
462 aa  181  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.17 
 
 
463 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  40.6 
 
 
465 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1148  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.95 
 
 
258 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.660594  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.31 
 
 
480 aa  180  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  41.42 
 
 
516 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  40.17 
 
 
465 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1687  uroporphyrinogen-III methyltransferase/synthase  42.06 
 
 
492 aa  179  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0805383  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.74 
 
 
464 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  38.4 
 
 
474 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  41.03 
 
 
464 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1421  uroporphyrinogen-III methyltransferase/synthase  40.24 
 
 
492 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16426  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.11 
 
 
508 aa  179  5.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  39.32 
 
 
493 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0608  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  41.88 
 
 
245 aa  178  7e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.807775  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.45 
 
 
487 aa  178  8e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.93 
 
 
463 aa  178  8e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.92 
 
 
464 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2131  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.67 
 
 
507 aa  177  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0860734  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.68 
 
 
276 aa  176  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  38.8 
 
 
464 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.83 
 
 
244 aa  177  2e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.155668  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.39 
 
 
250 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  40.17 
 
 
464 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0051  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.65 
 
 
245 aa  176  3e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0142442  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40 
 
 
497 aa  176  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000345374  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  37.6 
 
 
489 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0899  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  40.74 
 
 
276 aa  176  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0862  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  40.74 
 
 
276 aa  176  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  38.62 
 
 
457 aa  176  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.58 
 
 
482 aa  176  4e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0319  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.42 
 
 
497 aa  176  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.45 
 
 
480 aa  176  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1712  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  40.6 
 
 
464 aa  176  5e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44 
 
 
491 aa  176  5e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1346  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.28 
 
 
511 aa  175  7e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.694338  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.25 
 
 
505 aa  175  8e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1324  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.93 
 
 
309 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.867605  normal  0.902463 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.75 
 
 
479 aa  174  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3073  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  40.33 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.419877  normal  0.821671 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1023  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.33 
 
 
493 aa  174  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  38.89 
 
 
458 aa  173  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.83 
 
 
512 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0581  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.43 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.66 
 
 
482 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2321  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.48 
 
 
405 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0687  hypothetical protein  41.95 
 
 
505 aa  172  3.9999999999999995e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.943133  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2528  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  39.57 
 
 
493 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2558  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.1 
 
 
250 aa  172  5e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1744  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.03 
 
 
263 aa  172  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3062  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.24 
 
 
512 aa  172  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>