More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1613 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  100 
 
 		 322 aa  668    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7121  thioredoxin reductase  72.47 
 
 		 327 aa  488  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1778  thioredoxin-disulfide reductase  72.26 
 
 		 315 aa  467  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246241  decreased coverage  0.00675935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  68.08 
 
 		 314 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0086  thioredoxin reductase  67.83 
 
 		 320 aa  448  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  67.94 
 
 		 323 aa  449  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  68.83 
 
 		 326 aa  437  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1354  thioredoxin reductase  65.92 
 
 		 313 aa  429  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0199  thioredoxin reductase  63.67 
 
 		 315 aa  414  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0015  thioredoxin reductase  61.64 
 
 		 315 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  58.58 
 
 		 334 aa  384  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  57.28 
 
 		 314 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  57.28 
 
 		 314 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1134  thioredoxin reductase  57.37 
 
 		 313 aa  370  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.788555 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  56.45 
 
 		 314 aa  363  3e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  54.75 
 
 		 319 aa  360  2e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  57.93 
 
 		 314 aa  358  8e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  57.61 
 
 		 314 aa  354  1e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  55.59 
 
 		 319 aa  352  4e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  54.14 
 
 		 345 aa  349  3e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  53.21 
 
 		 323 aa  347  1e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  55.77 
 
 		 460 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  53.21 
 
 		 323 aa  347  1e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  54.87 
 
 		 311 aa  345  8e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2342  thioredoxin reductase oxidoreductase protein  54.72 
 
 		 318 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1092  thioredoxin reductase  54.25 
 
 		 324 aa  342  5e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2145  thioredoxin reductase  55.13 
 
 		 314 aa  342  7e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1221  thioredoxin reductase  54.25 
 
 		 324 aa  340  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  53.67 
 
 		 324 aa  339  4e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  53.92 
 
 		 324 aa  339  4e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01260  thioredoxin-disulfide reductase, putative  53.46 
 
 		 371 aa  338  5e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0703  thioredoxin reductase  53.38 
 
 		 321 aa  339  5e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0791  thioredoxin reductase  53.38 
 
 		 321 aa  338  5e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  53.42 
 
 		 325 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  53.85 
 
 		 311 aa  338  8e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  56.03 
 
 		 456 aa  338  9e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  52.84 
 
 		 311 aa  337  9.999999999999999e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59792  Thioredoxin reductase  52.05 
 
 		 319 aa  337  1.9999999999999998e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  53.85 
 
 		 311 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  52.13 
 
 		 321 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1762  thioredoxin reductase  53.04 
 
 		 317 aa  335  3.9999999999999995e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.422622  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  52.92 
 
 		 311 aa  335  5.999999999999999e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  53.46 
 
 		 320 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1694  thioredoxin-disulfide reductase  52.55 
 
 		 317 aa  334  1e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  54.52 
 
 		 311 aa  334  1e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0056  thioredoxin reductase  53.25 
 
 		 326 aa  334  1e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5827  thioredoxin reductase  54.05 
 
 		 325 aa  333  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0638947  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5364  thioredoxin reductase  52.73 
 
 		 337 aa  333  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1560  thioredoxin-disulfide reductase  54.02 
 
 		 320 aa  333  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2303  thioredoxin reductase  51.74 
 
 		 317 aa  332  4e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  52.16 
 
 		 311 aa  332  4e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  52.58 
 
 		 324 aa  332  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4304  thioredoxin reductase  53.67 
 
 		 335 aa  332  5e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1037  thioredoxin reductase  52.73 
 
 		 333 aa  332  8e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.526099 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0803  thioredoxin reductase  51.43 
 
 		 318 aa  331  8e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3442  thioredoxin reductase  53.38 
 
 		 333 aa  331  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  54.43 
 
 		 332 aa  330  1e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2047  thioredoxin reductase  51.42 
 
 		 317 aa  331  1e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000827938  hitchhiker  0.00204856 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1248  thioredoxin reductase  53.05 
 
 		 324 aa  330  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2424  thioredoxin reductase  53.38 
 
 		 320 aa  330  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  51.13 
 
 		 326 aa  329  3e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  51.13 
 
 		 313 aa  329  3e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1959  thioredoxin reductase  51.1 
 
 		 317 aa  330  3e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000155114  normal  0.552411 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4077  thioredoxin reductase  53.05 
 
 		 346 aa  329  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3139  thioredoxin-disulfide reductase  53.35 
 
 		 338 aa  329  4e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1932  thioredoxin reductase  51.71 
 
 		 323 aa  329  4e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1982  thioredoxin reductase  52.08 
 
 		 328 aa  329  4e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.343784  normal  0.438815 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0634  thioredoxin reductase  51.89 
 
 		 333 aa  329  4e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2017  thioredoxin reductase  51.1 
 
 		 317 aa  329  4e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000213161  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2153  thioredoxin reductase  51.74 
 
 		 318 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.969122  normal  0.900366 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02606  thioredoxin reductase  52.06 
 
 		 319 aa  328  5.0000000000000004e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0834  thioredoxin reductase  52.73 
 
 		 346 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0935  thioredoxin reductase  52.73 
 
 		 320 aa  328  6e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0495  thioredoxin reductase  52.73 
 
 		 320 aa  328  6e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0846  thioredoxin reductase  52.73 
 
 		 320 aa  328  6e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0974  thioredoxin reductase  52.73 
 
 		 320 aa  328  6e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  52.26 
 
 		 324 aa  328  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1360  thioredoxin reductase  52.26 
 
 		 332 aa  328  7e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2762  thioredoxin-disulfide reductase  52.7 
 
 		 315 aa  327  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117857  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  54.67 
 
 		 310 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2557  thioredoxin reductase  51.42 
 
 		 318 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2014  thioredoxin reductase  51.1 
 
 		 317 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000856982  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2591  thioredoxin reductase 1  51.12 
 
 		 316 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1713  thioredoxin reductase  51.74 
 
 		 317 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000742143  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4061  thioredoxin reductase  52.27 
 
 		 453 aa  327  2.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0563  thioredoxin reductase  53.09 
 
 		 326 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0552475  normal  0.0148693 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  49.84 
 
 		 331 aa  327  2.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  52.09 
 
 		 321 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2721  thioredoxin reductase  51.43 
 
 		 317 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.49521  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1932  thioredoxin reductase  51.42 
 
 		 317 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000520435  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1016  thioredoxin reductase  51.91 
 
 		 320 aa  326  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0763  thioredoxin reductase  51.45 
 
 		 319 aa  326  3e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1838  thioredoxin reductase  51.59 
 
 		 321 aa  326  3e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3686  thioredoxin reductase  51.76 
 
 		 316 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000489943  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  50.81 
 
 		 317 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0684  thioredoxin reductase  51.59 
 
 		 317 aa  325  4.0000000000000003e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00860267  normal  0.703249 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2486  thioredoxin reductase  51.09 
 
 		 318 aa  325  4.0000000000000003e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000100803  hitchhiker  0.0000245724 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2326  thioredoxin reductase  50.47 
 
 		 317 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000028573  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2123  thioredoxin-disulfide reductase  52.73 
 
 		 320 aa  325  5e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3078  thioredoxin-disulfide reductase  52.73 
 
 		 320 aa  325  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>