33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0087 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0087  protein tyrosine/serine phosphatase  100 
 
 		 214 aa  448  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13660  hypothetical protein  55.14 
 
 		 218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.615476  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2473  protein tyrosine/serine phosphatase  53.41 
 
 		 226 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.668648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1223  hypothetical protein  55.56 
 
 		 218 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0552  protein tyrosine/serine phosphatase  36.7 
 
 		 194 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2841  hypothetical protein  39.29 
 
 		 693 aa  119  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2034  protein tyrosine/serine phosphatase  34.27 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000196792  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0208  protein tyrosine/serine phosphatase  32.09 
 
 		 189 aa  86.7  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3179  protein tyrosine/serine phosphatase  27.93 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1524  protein tyrosine/serine phosphatase  29.75 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0085  protein tyrosine/serine phosphatase  31.4 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000064897  hitchhiker  0.000366859 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0048  protein tyrosine/serine phosphatase  29.27 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04426  tyrosine phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G07000)  27.56 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.197924  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03075  putative tyrosine specific protein phosphatase  46.3 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2257  protein tyrosine/serine phosphatase  35.51 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1518  protein tyrosine/serine phosphatase  28 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0803  dual specificity protein phosphatase  30.56 
 
 		 182 aa  52.4  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.265228  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1148  protein of unknown function DUF442  28.21 
 
 		 164 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000013727  hitchhiker  0.0000203259 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2078  hypothetical protein  23.81 
 
 		 241 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2352  protein tyrosine/serine phosphatase  23.81 
 
 		 241 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.297898  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2038  protein tyrosine/serine phosphatase  23.81 
 
 		 241 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.288846 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3651  protein tyrosine/serine phosphatase  24.49 
 
 		 241 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58142  putative tyrosine phosphatase  25.95 
 
 		 172 aa  45.4  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.973876  normal  0.993909 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0043  protein tyrosine/serine phosphatase  32.43 
 
 		 197 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3507  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2901  protein tyrosine/serine phosphatase  30 
 
 		 241 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352749  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0813  hypothetical protein  25.83 
 
 		 165 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2662  protein tyrosine/serine phosphatase  31.18 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.037734  normal  0.190371 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10780  phosphoinositide phosphatase Pten/Tep1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11990)  39.29 
 
 		 603 aa  43.5  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.622195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61269  tyrosine phosphatase  26.83 
 
 		 242 aa  43.1  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.115232  normal  0.236513 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0444  hypothetical protein  34.48 
 
 		 242 aa  42.7  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.149194  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2528  Dual specificity protein phosphatase  38.82 
 
 		 156 aa  42.4  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1017  protein tyrosine/serine phosphatase  26.74 
 
 		 229 aa  42  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2494  dual specificity protein phosphatase  32.18 
 
 		 156 aa  42  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>