More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3815 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3815  SNARE associated Golgi protein-related protein  100 
 
 		 256 aa  509  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3626  SNARE associated Golgi protein  92.19 
 
 		 256 aa  456  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0732  SNARE associated Golgi protein  68.75 
 
 		 256 aa  352  2e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0579  SNARE associated Golgi protein  69.5 
 
 		 255 aa  348  3e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0431109  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3545  SNARE associated Golgi protein  65.23 
 
 		 255 aa  335  5.999999999999999e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3417  hypothetical protein  65.23 
 
 		 255 aa  335  5.999999999999999e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2946  hypothetical protein  65.23 
 
 		 255 aa  335  5.999999999999999e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56313 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0067  hypothetical protein  66.02 
 
 		 254 aa  328  6e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00067  conserved inner membrane protein  66.27 
 
 		 254 aa  327  8e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00066  hypothetical protein  66.27 
 
 		 254 aa  327  8e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0615  SNARE associated Golgi protein  67.57 
 
 		 255 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0069  hypothetical protein  65.88 
 
 		 254 aa  326  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820004  normal  0.658906 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3534  SNARE associated Golgi protein-like protein  65.88 
 
 		 254 aa  326  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3592  SNARE associated Golgi protein  65.88 
 
 		 254 aa  326  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.305226  hitchhiker  0.000000281733 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0069  hypothetical protein  65.88 
 
 		 254 aa  326  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0070  hypothetical protein  65.49 
 
 		 254 aa  325  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0612  hypothetical protein  63.92 
 
 		 255 aa  324  9e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.833845  normal  0.0113808 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0057  hypothetical protein  65.49 
 
 		 254 aa  323  1e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0109  inner membrane protein YabI  63.53 
 
 		 255 aa  308  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0116  inner membrane protein YabI  63.53 
 
 		 255 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0531924 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0111  hypothetical protein  63.14 
 
 		 255 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.277229 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0112  inner membrane protein YabI  63.14 
 
 		 255 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.372252 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0116  inner membrane protein YabI  63.14 
 
 		 255 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.21 
 
 		 438 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3851  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.2 
 
 		 671 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294206  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.09 
 
 		 668 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  33.33 
 
 		 681 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.59 
 
 		 664 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1513  secretion system protein Y  34.76 
 
 		 678 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4371  DedA:phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.28 
 
 		 438 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.447762 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1470  secretion system protein Y  34.83 
 
 		 678 aa  106  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4831  PAP2 superfamily protein/DedA family protein  37.87 
 
 		 438 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735581  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0055  DedA family protein  34.13 
 
 		 641 aa  104  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.381333  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1415  PAP2 domain-containing protein  32.39 
 
 		 682 aa  103  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00547522  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1352  phosphatase  32.39 
 
 		 682 aa  103  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.304549  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2766  SNARE associated Golgi protein  34.78 
 
 		 176 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0807  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.09 
 
 		 664 aa  103  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.568795  normal  0.843348 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0557  DedA family protein  29.38 
 
 		 232 aa  102  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.565091  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0537  DedA family protein  32.23 
 
 		 211 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1293  dedA family protein  30.54 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  33.01 
 
 		 437 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3981  hypothetical protein  35.67 
 
 		 176 aa  99.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1333  dedA family protein  30.24 
 
 		 220 aa  99.4  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.914504  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0500  SNARE associated Golgi protein  31.86 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249861  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  32.06 
 
 		 437 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0497  hypothetical protein  33.75 
 
 		 239 aa  97.1  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1652  hypothetical protein  37.88 
 
 		 176 aa  96.3  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.276221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2315  hypothetical protein  37.12 
 
 		 176 aa  95.5  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681701  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.77 
 
 		 676 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2977  hypothetical protein  31.07 
 
 		 176 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08340  Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase superfamily  36.63 
 
 		 439 aa  94  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7566  hypothetical protein  32.35 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02300  PAP2 superfamily protein  28.08 
 
 		 695 aa  93.6  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2826  hypothetical protein  33.74 
 
 		 176 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0614452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1538  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.87 
 
 		 469 aa  92.4  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.819522  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4976  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  37.76 
 
 		 438 aa  92  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135729  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0246  DedA family protein  36.31 
 
 		 176 aa  91.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.10117 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4813  PAP2 family protein/DedA family protein  33.72 
 
 		 438 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.609495 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1851  SNARE associated Golgi protein  32.77 
 
 		 220 aa  90.1  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0608  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.88 
 
 		 438 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5208  SNARE associated Golgi protein  28.92 
 
 		 241 aa  88.6  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1183  DedA family protein  31.21 
 
 		 677 aa  88.2  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157357  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4688  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.3 
 
 		 438 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4866  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.72 
 
 		 438 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2485  DedA family integral membrane protein  34.64 
 
 		 176 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143825 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2420  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.57 
 
 		 483 aa  84.3  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4038  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.08 
 
 		 662 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1019  DedA/PAP2 family phospholipid acid phosphatase  34.19 
 
 		 502 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0242  hypothetical protein  30 
 
 		 684 aa  81.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0212  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.38 
 
 		 684 aa  80.9  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0540  hypothetical protein  35.29 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0306  hypothetical protein  28.93 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5332  DedA family membrane protein  31.29 
 
 		 672 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.239608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1821  uncharacterized membrane-associated protein  28.66 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.274709 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0188  hypothetical protein  28.66 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0587064  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2791  hypothetical protein  34.25 
 
 		 173 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  29.07 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3105  hypothetical protein  30.38 
 
 		 686 aa  75.9  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3597  DedA family membrane protein  32.65 
 
 		 672 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2669  hypothetical protein  35.51 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.618552 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2896  hypothetical protein  35.51 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0774242 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3203  SNARE associated Golgi protein  35.66 
 
 		 174 aa  74.7  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.473398  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1457  hypothetical protein  28.47 
 
 		 179 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6468  hypothetical protein  29.71 
 
 		 173 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.379701  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1146  SNARE associated Golgi protein  35.04 
 
 		 173 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3501  DedA family membrane protein  31.29 
 
 		 672 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0300275 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3299  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.59 
 
 		 664 aa  72.8  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0269  DedA family protein  36.49 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.867407  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3643  hypothetical protein  36.49 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3947  hypothetical protein  36.49 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  27.61 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1058  hypothetical protein  30.72 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  30.77 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  26.57 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1430  hypothetical protein  34.06 
 
 		 173 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.87219 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  33.79 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  31.58 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  32.47 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4526  hypothetical protein  28.93 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  26.98 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>