27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1832 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1832  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  650  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.596397  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1923  Spore coat U domain protein  47.24 
 
 
168 aa  91.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1920  Spore coat U domain protein  30.59 
 
 
342 aa  75.1  2e-12  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03044  lipoprotein signal peptide  28.16 
 
 
325 aa  66.2  6e-10  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0900773  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1829  putative signal peptide protein  36.99 
 
 
172 aa  64.7  2e-09  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  27.64 
 
 
344 aa  60.5  4e-08  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1269  Spore coat U domain protein  33.1 
 
 
339 aa  57  4e-07  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4397  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  39.66 
 
 
165 aa  54.7  2e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1270  Spore coat U domain protein  41.82 
 
 
174 aa  55.1  2e-06  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  0.0373463 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4690  spore coat U domain-containing protein  35 
 
 
165 aa  52.4  1e-05  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2338  spore coat U domain-containing protein  27.09 
 
 
331 aa  51.2  2e-05  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156142 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5756  secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  24.72 
 
 
333 aa  50.4  4e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2472  spore coat U domain-containing protein  27.09 
 
 
331 aa  49.3  8e-05  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169797  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2696  signal peptide protein  35.66 
 
 
167 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4394  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  25.51 
 
 
320 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2994  hypothetical protein  38.18 
 
 
164 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212407  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1064  spore coat protein  38.18 
 
 
172 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1071  pilus biogenesis protein  38.18 
 
 
172 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03041  signal peptide protein  31.68 
 
 
173 aa  47  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667718  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1605  hypothetical protein  38.18 
 
 
164 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2291  hypothetical protein  38.18 
 
 
164 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1223  spore coat protein U precursor  37.27 
 
 
185 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1963  spore coat U domain-containing protein  25.37 
 
 
323 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0837976 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2290  hypothetical protein  25.4 
 
 
336 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1604  putative lipoprotein  25.4 
 
 
336 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2995  putative lipoprotein  25.4 
 
 
336 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0724  putative lipoprotein  25.4 
 
 
329 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>