71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0310 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0310  putative cytosine/adenosine deaminase  100 
 
 		 221 aa  457  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.6846099999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2452  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  41.36 
 
 		 195 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0209474  normal  0.0162871 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1534  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.76 
 
 		 183 aa  88.2  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.88198  normal  0.312131 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3110  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.91 
 
 		 186 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.473399  normal  0.927067 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1744  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.33 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.52 
 
 		 183 aa  53.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285833  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6871  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  32.11 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.385283 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1249  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.82 
 
 		 155 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.48 
 
 		 157 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1413  tRNA-adenosine deaminase  32 
 
 		 156 aa  50.1  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1655  guanine deaminase  26.89 
 
 		 298 aa  50.1  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1229  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.03 
 
 		 156 aa  49.3  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  29.41 
 
 		 193 aa  49.3  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01142  hypothetical protein  30.61 
 
 		 164 aa  49.3  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0107  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.78 
 
 		 163 aa  48.9  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0710056 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3003  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.06 
 
 		 168 aa  48.9  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.160793  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1071  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.51 
 
 		 187 aa  48.9  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.45442  normal  0.648956 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2788  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  26.99 
 
 		 158 aa  48.9  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0654304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4066  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.65 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0645  tRNA-adenosine deaminase  27.33 
 
 		 167 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954109  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0103  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.55 
 
 		 161 aa  48.1  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0612  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  29.46 
 
 		 153 aa  47.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2436  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  22.83 
 
 		 301 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0205  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  28.1 
 
 		 157 aa  47.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1686  hypothetical protein  25.79 
 
 		 149 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  29.09 
 
 		 154 aa  46.6  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3540  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.52 
 
 		 162 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955446 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0025  tRNA-adenosine deaminase  26.67 
 
 		 150 aa  46.6  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000596631  hitchhiker  0.00000110312 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1211  cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding protein  26.19 
 
 		 148 aa  46.2  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0208856  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.2 
 
 		 155 aa  46.2  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3440  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  25.79 
 
 		 152 aa  46.2  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0184  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  28.1 
 
 		 204 aa  45.8  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0748  tRNA-specific adenosine deaminase  23.53 
 
 		 177 aa  45.8  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  25.42 
 
 		 182 aa  45.8  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  27.54 
 
 		 156 aa  45.8  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4004  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.46 
 
 		 159 aa  45.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0207982  hitchhiker  0.00540331 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1685  hypothetical protein  25.32 
 
 		 149 aa  45.4  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3035  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.17 
 
 		 173 aa  45.4  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0501  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.36 
 
 		 149 aa  45.1  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0839  tRNA-adenosine deaminase  33.88 
 
 		 151 aa  44.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  28.78 
 
 		 160 aa  44.7  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28 
 
 		 160 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0700  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.25 
 
 		 157 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192591  normal  0.865877 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4636  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  25.4 
 
 		 146 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2828  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  27.62 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0739962  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32340  putative deaminase  28.21 
 
 		 151 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1093  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.25 
 
 		 181 aa  43.9  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00512356  hitchhiker  0.0000000000228725 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  44.12 
 
 		 156 aa  43.5  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.174881  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  25.48 
 
 		 158 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2395  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  22.12 
 
 		 143 aa  43.5  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3669  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  25.58 
 
 		 182 aa  43.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408377  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3417  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  29.6 
 
 		 158 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49782  predicted protein  21.25 
 
 		 227 aa  43.5  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4793  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26 
 
 		 160 aa  43.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.758133  normal  0.45937 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3230  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.95 
 
 		 146 aa  42.7  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00262263 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2498  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  28.18 
 
 		 197 aa  43.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.23 
 
 		 158 aa  42.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1856  tRNA-adenosine deaminase  26.67 
 
 		 168 aa  42.4  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.489212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0741  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  24.63 
 
 		 177 aa  42.7  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3095  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.57 
 
 		 147 aa  42.7  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.786655  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0888  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  24.63 
 
 		 177 aa  42.7  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3121  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  27.74 
 
 		 177 aa  42.4  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0158  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.91 
 
 		 190 aa  42.7  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49924  predicted protein  36.21 
 
 		 564 aa  42.4  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5383  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  29.52 
 
 		 152 aa  42.4  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8570  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.81 
 
 		 157 aa  42.4  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00354903  normal  0.0468884 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0223  tRNA-adenosine deaminase  31.25 
 
 		 151 aa  42  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3332  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.65 
 
 		 153 aa  42.4  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0498  cytosine deaminase, putative  30.19 
 
 		 153 aa  42  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.490204 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  27.89 
 
 		 176 aa  42  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3172  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  28.57 
 
 		 148 aa  41.6  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0411701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>