More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0478 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0478  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
371 aa  726  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0138  glycosyl transferase family protein  56.72 
 
 
389 aa  381  1e-104  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.15479  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0462  glycosyl transferase family protein  57.57 
 
 
388 aa  336  4e-91  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.215189  hitchhiker  7.73119e-07 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1727  glycosyl transferase family protein  42.49 
 
 
329 aa  238  2e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.350304  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0341  glycosyl transferase family protein  42.57 
 
 
302 aa  224  2e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1970  glycosyl transferase family protein  38.05 
 
 
305 aa  185  1e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.804516 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  37.41 
 
 
315 aa  169  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  38 
 
 
303 aa  169  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2490  glycosyl transferase family 2  37.92 
 
 
344 aa  168  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0696  glycosyl transferase family 2  37.63 
 
 
310 aa  167  4e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.646152  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0916  glycosyl transferase family 2  34.64 
 
 
336 aa  159  9e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1662  glycosyl transferase family protein  36.16 
 
 
308 aa  157  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0596  dolichol-phosphate mannosyltransferase  34.9 
 
 
305 aa  155  7e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2780  glycosyl transferase family 2  33.12 
 
 
319 aa  149  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1292  hypothetical protein  33.1 
 
 
309 aa  147  2e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1495  glycosyl transferase family protein  33 
 
 
308 aa  146  5e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.025805  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1802  glycosyl transferase family protein  32.78 
 
 
307 aa  145  9e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.319238  normal  0.13058 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0778  glycosyl transferase family protein  35.66 
 
 
305 aa  140  4e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.703306  normal  0.211437 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1537  glycosyl transferase family 2  32.55 
 
 
308 aa  137  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  35.78 
 
 
221 aa  125  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  32.62 
 
 
298 aa  119  7e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  32.79 
 
 
374 aa  112  1e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1245  glycosyl transferase family 2  33.45 
 
 
324 aa  112  1e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  2.19954e-08  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  29.93 
 
 
304 aa  112  1e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1866  glycosyl transferase family 2  37.44 
 
 
250 aa  110  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  30.1 
 
 
307 aa  109  7e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  30.96 
 
 
394 aa  107  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1737  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
312 aa  105  9e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4238  glycosyl transferase family protein  30.72 
 
 
332 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.440412  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2272  glycosyl transferase family 2  36.89 
 
 
236 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.632375  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  34.25 
 
 
410 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0164  glycosyl transferase family 2  36.89 
 
 
262 aa  105  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.858664  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  33.18 
 
 
410 aa  104  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  34.23 
 
 
410 aa  103  5e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  32.19 
 
 
411 aa  103  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2259  putative glycosyl transferase  27.24 
 
 
313 aa  103  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
346 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 
414 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.45 
 
 
382 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1189  glycosyltransferase, group 2 family protein  32.99 
 
 
310 aa  101  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  32.62 
 
 
420 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2299  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 
332 aa  99.8  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705135  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0043  glycosyl transferase family protein  29.19 
 
 
231 aa  99  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.803192  hitchhiker  0.000270685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  31.38 
 
 
394 aa  97.4  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  30.92 
 
 
293 aa  97.1  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 
378 aa  94.7  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5602  glycosyl transferase family 2  29.8 
 
 
412 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.922712  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  29.26 
 
 
314 aa  92.8  8e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0866  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 
327 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4187  glycosyl transferase family 2  30.95 
 
 
386 aa  91.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0256  glycosyl transferase family protein  29.56 
 
 
317 aa  89.4  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.0678648 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  31.12 
 
 
336 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4209  glycosyl transferase family 2  26.9 
 
 
346 aa  89.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.220629 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  30.13 
 
 
272 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  32.07 
 
 
287 aa  87.8  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4593  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
230 aa  87.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  29.89 
 
 
448 aa  87.4  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1566  cell wall membrane glycosyltransferase  28.78 
 
 
314 aa  87.4  4e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.901523  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3172  family 2 glycosyl transferase  28.74 
 
 
412 aa  86.7  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
230 aa  85.9  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0549  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 
321 aa  85.5  1e-15  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  2.33931e-06  normal  0.956589 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0021  glycosyl transferase family 2  27.46 
 
 
330 aa  85.5  1e-15  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
227 aa  84.7  2e-15  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1856  glycosyl transferase family protein  30.42 
 
 
559 aa  84.7  2e-15  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0355886  decreased coverage  0.0028209 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8285  glycosyl transferase family 2  34.87 
 
 
694 aa  84.3  3e-15  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.493669 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4066  glycosyl transferase family protein  34.88 
 
 
257 aa  84  4e-15  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766809  normal  0.229172 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  30.12 
 
 
430 aa  83.6  5e-15  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4546  glycosyl transferase family 2  27.05 
 
 
335 aa  83.2  6e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947898  normal  0.992745 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16010  Glycosyl transferase, family 2  27.12 
 
 
322 aa  83.2  7e-15  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  6.47727e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1057  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 
259 aa  83.2  7e-15  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1400  glycosyltransferase-like protein  27.24 
 
 
317 aa  82.8  8e-15  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0276  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.32 
 
 
245 aa  82.4  1e-14  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.50271  decreased coverage  2.66916e-05 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4281  glycosyl transferase family 2  26.75 
 
 
335 aa  82.4  1e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
230 aa  82.8  1e-14  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
227 aa  81.3  2e-14  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0173  glycosyl transferase family 2  34.03 
 
 
325 aa  81.6  2e-14  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3061  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 
480 aa  80.9  3e-14  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0151807  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2940  glycosyl transferase family protein  29.76 
 
 
318 aa  80.5  4e-14  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5467  glycosyl transferase family 2  28.74 
 
 
418 aa  80.9  4e-14  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66803  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1494  glycosyl transferase family protein  31.42 
 
 
310 aa  80.5  4e-14  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  29.89 
 
 
285 aa  80.9  4e-14  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2922  glycosyl transferase family 2  34.45 
 
 
217 aa  80.1  6e-14  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.895357  hitchhiker  0.00151129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8623  dolichol-p-glucose synthetase  27.13 
 
 
406 aa  79.3  1e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3976  glycosyl transferase family protein  26.36 
 
 
514 aa  79  1e-13  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0217  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
283 aa  79  1e-13  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860122  normal  0.275888 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2676  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 
282 aa  78.2  2e-13  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4474  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 
235 aa  78.6  2e-13  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3114  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
334 aa  78.2  2e-13  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.482779  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2755  glycosyl transferase family protein  35.08 
 
 
224 aa  77.8  3e-13  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0370264  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05405  putative glycosyltransferase  30.88 
 
 
231 aa  77.8  3e-13  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.507881  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
305 aa  77  4e-13  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0345  dolichol-phosphate mannosyltransferase  29.15 
 
 
266 aa  77  5e-13  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.855294  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4987  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
235 aa  77  5e-13  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278061  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 
414 aa  76.6  6e-13  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0979  glycosyl transferase family protein  34.85 
 
 
226 aa  76.3  8e-13  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457196  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0490  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 
230 aa  75.9  9e-13  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.49136  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  29.63 
 
 
276 aa  75.5  1e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0734  glycosyl transferase family protein  27.92 
 
 
230 aa  75.9  1e-12  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0939265  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0335  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 
476 aa  75.9  1e-12  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2413  glycosyl transferase family 2  29.35 
 
 
243 aa  75.1  2e-12  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.367693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>