20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0049 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0049  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  100 
 
 
199 aa  408  1e-113  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0279  PaREP1 family protein  59.54 
 
 
185 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1379  PaREP8 domain-containing protein  59.23 
 
 
152 aa  159  3e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.611746  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1916  PaREP1 family protein  38.81 
 
 
155 aa  88.2  7e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.445823 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0097  PaREP8 domain-containing protein  36.5 
 
 
155 aa  85.9  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0114  PaREP1 domain-containing protein  34.87 
 
 
163 aa  86.3  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1582  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  38.79 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1160  PaREP1 domain-containing protein  32.12 
 
 
157 aa  77.8  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.612279  hitchhiker  0.00829062 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0294  PaREP1 protein  32.12 
 
 
160 aa  75.5  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0965823  normal  0.0513269 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0565  PaREP1 domain-containing protein  32.61 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0289  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  37.3 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0290  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  33.57 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1309  PaREP8 domain-containing protein  37.72 
 
 
192 aa  61.6  0.000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00105694  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1501  PaREP8 domain-containing protein  31.25 
 
 
162 aa  57  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0237073  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0878  PaREP1 domain-containing protein  43.75 
 
 
100 aa  56.2  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.927069  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1182  PaREP1 domain-containing protein  32.14 
 
 
124 aa  52  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.289921  normal  0.0477307 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2188  PaREP1 domain-containing protein  35.29 
 
 
151 aa  50.4  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.881035  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1414  PaREP8 domain-containing protein  27.68 
 
 
163 aa  50.4  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.199569  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0472  PaREP1 family protein  28.93 
 
 
162 aa  46.6  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.118636  hitchhiker  0.0000000247802 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0697  PaREP1 domain-containing protein  29.46 
 
 
157 aa  45.8  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0975506  normal  0.271276 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>