198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3731 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_3731  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
243 aa  504  1e-142  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01462  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  55.51 
 
 
233 aa  271  8e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1422  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.71 
 
 
235 aa  140  1e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.329688 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.06 
 
 
264 aa  139  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1473  hypothetical protein  33.19 
 
 
273 aa  128  8e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
278 aa  125  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.79 
 
 
231 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.5 
 
 
258 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.5 
 
 
263 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.5 
 
 
263 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.66 
 
 
261 aa  121  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.66 
 
 
261 aa  121  1e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.86 
 
 
282 aa  119  4e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1880  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.33 
 
 
338 aa  117  2e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850381  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.77 
 
 
265 aa  115  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.67 
 
 
269 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.08 
 
 
269 aa  115  9e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3204  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
259 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5411  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.47 
 
 
250 aa  111  8e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.746518 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1972  metal-dependent hydrolase  33.83 
 
 
338 aa  111  1e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0408  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.33 
 
 
1153 aa  110  2e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.47 
 
 
260 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.45 
 
 
242 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0870  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.51 
 
 
287 aa  106  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0344  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30 
 
 
248 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1524  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.49 
 
 
228 aa  100  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.76 
 
 
258 aa  99  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.24 
 
 
242 aa  98.2  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0359  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.73 
 
 
248 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.17 
 
 
242 aa  97.1  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0469  hypothetical protein  28.52 
 
 
248 aa  96.3  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744864  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6773  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.24 
 
 
271 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67063  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0997  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29.71 
 
 
285 aa  94  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1059  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29.71 
 
 
285 aa  94  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0432754  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1324  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.29 
 
 
285 aa  93.6  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  29.69 
 
 
245 aa  92.8  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.02 
 
 
266 aa  92.4  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0381  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.85 
 
 
251 aa  92  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853038  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3930  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.46 
 
 
247 aa  92  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.85 
 
 
253 aa  91.7  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.08 
 
 
328 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.24 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0420  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.61 
 
 
236 aa  91.3  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.72 
 
 
246 aa  90.5  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.69 
 
 
328 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5868  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.99 
 
 
271 aa  89.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.432007  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.31 
 
 
246 aa  89  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2562  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.1 
 
 
253 aa  89  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00774  hypothetical protein  34.1 
 
 
253 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0844  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.1 
 
 
253 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2394  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.76 
 
 
240 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0672115  normal  0.448912 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  30.08 
 
 
299 aa  87.8  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0813  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.1 
 
 
253 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0192282  normal  0.85473 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2853  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.1 
 
 
253 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00512011 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00757  predicted DNase  34.1 
 
 
253 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0846  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.67 
 
 
292 aa  88.2  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2852  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.1 
 
 
253 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.350943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0854  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.91 
 
 
253 aa  87  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0938  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.95 
 
 
253 aa  87  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3278  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.59 
 
 
261 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2520  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.76 
 
 
232 aa  85.9  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2515  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.63 
 
 
256 aa  85.5  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0442  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.58 
 
 
262 aa  85.5  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3767  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.63 
 
 
252 aa  84.7  1e-15  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4120  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.61 
 
 
250 aa  84.3  1e-15  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36680  hypothetical protein  26.27 
 
 
245 aa  84.3  1e-15  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21271  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0445  endonuclease / exonuclease / phosphatase family protein  27.78 
 
 
251 aa  84.3  2e-15  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.625659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3504  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.81 
 
 
237 aa  84  2e-15  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.40759  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3150  hypothetical protein  25.69 
 
 
245 aa  83.2  3e-15  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2216  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.2 
 
 
243 aa  82.8  4e-15  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0194229  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0472  hypothetical protein  28.76 
 
 
240 aa  83.2  4e-15  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2124  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.76 
 
 
240 aa  83.2  4e-15  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.908976 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0086  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.38 
 
 
257 aa  82.4  6e-15  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.49 
 
 
245 aa  82.4  6e-15  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0961  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.37 
 
 
252 aa  82.4  7e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0940  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.37 
 
 
252 aa  82.4  7e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00426171  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0848  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.37 
 
 
252 aa  82.4  7e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0876  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.37 
 
 
252 aa  82.4  7e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0908  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.37 
 
 
252 aa  82.4  7e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0916506  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.19 
 
 
837 aa  81.6  9e-15  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2238  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.15 
 
 
251 aa  81.3  1e-14  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0080  hypothetical protein  27.38 
 
 
302 aa  81.3  1e-14  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 
257 aa  80.9  2e-14  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5307  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.31 
 
 
244 aa  80.5  2e-14  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24830  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.58 
 
 
276 aa  80.5  3e-14  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0606  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.24 
 
 
250 aa  79.7  4e-14  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2284  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.64 
 
 
262 aa  79.7  4e-14  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0656369  hitchhiker  0.000754964 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2424  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.2 
 
 
253 aa  79.3  5e-14  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123297  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2132  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.09 
 
 
226 aa  79  6e-14  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.8 
 
 
283 aa  78.6  8e-14  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.19 
 
 
808 aa  78.2  1e-13  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3642  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.7 
 
 
249 aa  78.2  1e-13  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748827  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0048  hypothetical protein  32.2 
 
 
256 aa  78.2  1e-13  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00965819  normal  0.1661 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0692  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.72 
 
 
245 aa  77.4  2e-13  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221154  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1281  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.61 
 
 
253 aa  77  3e-13  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.74 
 
 
271 aa  77  3e-13  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2877  hypothetical protein  28.27 
 
 
277 aa  76.3  5e-13  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0013  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.11 
 
 
242 aa  75.9  6e-13  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.914403  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.4 
 
 
249 aa  75.5  7e-13  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.02 
 
 
249 aa  75.1  8e-13  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>