66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1989 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1989  cytochrome c, class II  100 
 
 		 155 aa  312  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.13994  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02251  cytochrome c  51.63 
 
 		 170 aa  162  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.536111  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2799  cytochrome c'  50.64 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.340153  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2738  cytochrome c, class II  41.18 
 
 		 149 aa  110  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000239572  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1134  cytochrome c, class II  39.22 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1223  cytochrome c, class II  40.52 
 
 		 149 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000308946  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3090  cytochrome c prime  40.52 
 
 		 149 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000689857  normal  0.0144373 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1300  cytochrome c prime  41.18 
 
 		 149 aa  103  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000571925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1267  cytochrome c class II  40.52 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000308815  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3420  cytochrome c'  39.35 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1205  cytochrome c, class II  38.56 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000342907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1135  cytochrome c, class II  38.56 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000323618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2910  cytochrome c, class II  38.06 
 
 		 149 aa  96.3  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.963403  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1062  cytochrome c class II  37.12 
 
 		 153 aa  88.2  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.251364  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1075  cytochrome c, class II  37.59 
 
 		 153 aa  87.4  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000870281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0462  cytochrome c'  34.01 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1266  cytochrome c prime  35.29 
 
 		 153 aa  84.7  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1171  cytochrome c, class II  35.9 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3135  cytochrome c prime  33.07 
 
 		 172 aa  77  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0590  cytochrome c class II  34.56 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0404  cytochrome c prime  35.77 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1340  cytochrome c prime  29.03 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000194758 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0901  cytochrome c, class II  33.33 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.502133 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0291  cytochrome c, class II  31.39 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000294803 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1236  cytochrome C-556  32.47 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2744  cytochrome c, class II  30.97 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4700  cytochrome c, class II  36.89 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.311415  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0286  cytochrome c prime  31.39 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0933227  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1277  cytochrome c, class II  33.33 
 
 		 151 aa  67  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.593485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0474  cytochrome c, class II  26.62 
 
 		 150 aa  67  0.00000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.731529  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3537  cytochrome c prime  27.45 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0147332 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0216  cytochrome c, class II  29.85 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1614  cytochrome c, class II  33.33 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.290263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2868  cytochrome c  34.18 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0269  cytochrome c, class II  32.09 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1325  cytochrome c, class II  29.49 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1106  cytochrome c, class II  28.48 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00108735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2126  cytochrome c, class II  36.97 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0972  cytochrome c prime  33.05 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1123  cytochrome c prime  26.14 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000239105  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2695  cytochrome c class II  29.81 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.618119  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2544  cytochrome c, class II  32.8 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0600  cytochrome c, class II  30.52 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2557  cytochrome c prime  30.13 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524451  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0474  cytochrome c'  36.13 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1043  cytochrome c, class II  31.13 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2785  cytochrome c-554  29.8 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336484  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2229  cytochrome c, class II  29.49 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1427  cytochrome c, class II  29.14 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.466816  normal  0.0348813 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2396  cytochrome c, class II  32.81 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00865436  normal  0.433653 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4496  cytochrome c prime  27.52 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.609438  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4122  hypothetical protein  25.81 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22167  normal  0.119493 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5606  cytochrome c, class II  27.03 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.325565 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1225  cytochrome c prime  24.68 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.239177 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1625  cytochrome c, class II  26.67 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.574438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1455  cytochrome c, class II  25.34 
 
 		 153 aa  48.1  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1785  cytochrome c prime  26.27 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.849922  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1440  cytochrome c, class II  27.36 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0451  cytochrome c556-like protein  29.17 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.870649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0041  cytochrome c, class II  28.57 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.417622  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07030  putative cytochrome c'  22.31 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0644  putative lipoprotein  24.39 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.773212  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0850  cytochrome c prime  31.62 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.990375 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49090  Cytochrome C, class II  24.39 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.472535  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2083  hypothetical protein  31.67 
 
 		 145 aa  41.2  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3283  cytochrome c, class II  30.65 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00438456  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>