68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1811 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1811  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 225 aa  471  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01060  Phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  51.79 
 
 		 222 aa  231  8.000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2859  phosphoglycerate mutase  39.56 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5275  phosphoglycerate mutase  42.92 
 
 		 236 aa  184  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4339  phosphoglycerate mutase  42.47 
 
 		 224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5047  phosphoglycerate mutase  44.69 
 
 		 225 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3039  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  42.67 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3217  phosphoglycerate mutase  42.92 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3636  Phosphoglycerate mutase  44.75 
 
 		 224 aa  178  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4713  Phosphoglycerate mutase  44.75 
 
 		 224 aa  178  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119868  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5020  phosphoglycerate mutase  41.1 
 
 		 224 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.706116  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5077  phosphoglycerate mutase  41.55 
 
 		 236 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5840  phosphoglycerate mutase  41.1 
 
 		 224 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3912  putative phosphoglycerate / bisphosphoglycerate mutase  41.41 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554732  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3612  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  38.33 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1791  Phosphoglycerate mutase  39.3 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0396  phosphoglycerate mutase  41.05 
 
 		 222 aa  152  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4443  phosphoglycerate mutase  38.26 
 
 		 224 aa  146  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769879 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3124  Phosphoglycerate mutase  37 
 
 		 223 aa  143  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3851  phosphoglycerate mutase  37 
 
 		 223 aa  143  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0365  phosphoglycerate mutase  37.72 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3732  phosphoglycerate mutase  38.89 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0591  phosphoglycerate mutase  36.91 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4246  phosphoglycerate mutase  32.85 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5438  Phosphoglycerate mutase  33.63 
 
 		 230 aa  121  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0736619 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2072  phosphoglycerate mutase  30.08 
 
 		 244 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2201  phosphoglycerate mutase  33.19 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295745  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0109  phosphoglycerate mutase  34.5 
 
 		 218 aa  108  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0633  phosphoglycerate mutase  29.26 
 
 		 234 aa  104  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2459  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.09 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00611929  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2531  phosphoglycerate mutase  31.33 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.186608  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3115  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.12 
 
 		 236 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27570  fructose-2,6-bisphosphatase  31.12 
 
 		 238 aa  102  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13480  fructose-2,6-bisphosphatase  33.33 
 
 		 220 aa  101  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3212  phosphoglycerate mutase  33.76 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3557  phosphoglycerate mutase  32.5 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.370519  normal  0.395273 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4560  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 223 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2217  phosphoglycerate mutase  31.91 
 
 		 235 aa  99.8  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0522  phosphoglycerate mutase family protein  28.64 
 
 		 229 aa  99  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2726  hypothetical protein  30.29 
 
 		 236 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1912  phosphoglycerate mutase  32.66 
 
 		 288 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3923  phosphoglycerate mutase  32.51 
 
 		 236 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0493015 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0280  phosphoglycerate mutase family protein  29.41 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.852489  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2652  phosphoglycerate mutase family protein  29.41 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1624  phosphoglycerate mutase family protein  29.41 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1427  phosphoglycerate mutase family protein  29.41 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0244  phosphoglycerate mutase family protein  29.41 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2514  phosphoglycerate mutase family protein  28.64 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0407111  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0945  phosphoglycerate mutase family protein  28.64 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40850  hypothetical protein  29.66 
 
 		 236 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1922  phosphoglycerate mutase  30.7 
 
 		 236 aa  95.1  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165977  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3465  hypothetical protein  29.24 
 
 		 236 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.940841  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2516  phosphoglycerate mutase  29 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0470  phosphoglycerate mutase  27.85 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1187  phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.115538  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1584  Phosphoglycerate mutase  28.24 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4516  Phosphoglycerate mutase  24.47 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  24.43 
 
 		 223 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5140  Phosphoglycerate mutase  23.6 
 
 		 214 aa  49.7  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  27.53 
 
 		 230 aa  49.3  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  25.7 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  25.34 
 
 		 208 aa  46.6  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  22.94 
 
 		 207 aa  45.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  23.98 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  24.2 
 
 		 200 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  25.22 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  25.22 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  25.22 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>