More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1602 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1602  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 84 aa  166  8e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1712  50S ribosomal protein L27  89.29 
 
 		 84 aa  154  3e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.592545  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1509  50S ribosomal protein L27  87.95 
 
 		 84 aa  152  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00258122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1030  50S ribosomal protein L27  85.71 
 
 		 84 aa  149  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011666  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1899  50S ribosomal protein L27  84.34 
 
 		 84 aa  147  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.617273  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0863  50S ribosomal protein L27  84.52 
 
 		 85 aa  147  6e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0966779  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0833  50S ribosomal protein L27  89.16 
 
 		 84 aa  130  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.5816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0512  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 85 aa  114  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4217  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3276  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212602 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3674  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  111  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.99139  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2703  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 92 aa  110  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2575  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 92 aa  110  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2217  50S ribosomal protein L27  74.65 
 
 		 91 aa  110  9e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.856627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0838  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.34705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5485  50S ribosomal protein L27  73.91 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.132015  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1269  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000774064  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0750  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00233026 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0771  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 85 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0842  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 85 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.987021  normal  0.6635 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0497  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 90 aa  107  5e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000367607  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1120  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 87 aa  107  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.645406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1682  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 90 aa  107  6e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000249957  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3916  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 91 aa  107  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00853508 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0454  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 89 aa  107  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1617  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 82 aa  106  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000121175  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 92 aa  105  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 93 aa  105  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15461  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.120914  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05534  50S ribosomal protein L27  71.01 
 
 		 86 aa  105  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000340822  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3478  ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000653762  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2696  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 		 85 aa  104  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000136289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2002  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 85 aa  104  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.245442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3621  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  104  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000351057  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0195  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 86 aa  104  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000826463  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0213  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 86 aa  104  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.280528 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  57.14 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 85 aa  103  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0489  ribosomal protein L27  57.14 
 
 		 86 aa  103  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4883  ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 92 aa  103  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113157  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2218  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 85 aa  103  9e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000800329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2480  ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 100 aa  103  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.782187  normal  0.22295 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 84 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 84 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 84 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 86 aa  102  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 84 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 86 aa  102  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10120  LSU ribosomal protein L27P  63.86 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28486  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2128  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.861173  normal  0.607727 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0643  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.301948  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3737  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000346028  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  65.85 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  55.95 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3088  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1112  ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.55245  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4102  50S ribosomal protein L27  57.83 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4194  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 89 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 84 aa  101  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0794  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000203934  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3870  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 89 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.403314  normal  0.0137956 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 84 aa  101  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000110997  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0193  50S ribosomal protein L27  60.49 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.451706 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05401  50S ribosomal protein L27  61.63 
 
 		 88 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3218  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 84 aa  101  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 94 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1583  50S ribosomal protein L27  55.95 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15061  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 86 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.610968  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03730  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00000322672  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2006  ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 86 aa  101  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.962508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1526  50S ribosomal protein L27  55.95 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0896  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 84 aa  101  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3124  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 84 aa  101  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000107863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3359  ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421163  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2651  ribosomal protein L27  61.73 
 
 		 95 aa  100  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000469897  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2046  ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 93 aa  100  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1005  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 84 aa  100  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000876711  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2926  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 84 aa  100  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000309766  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3006  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 89 aa  100  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549132 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0474  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000537628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2828  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 84 aa  100  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000113295  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1461  50S ribosomal protein L27  57.14 
 
 		 89 aa  100  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0317862 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3105  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 86 aa  100  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17721  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 90 aa  100  8e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.106255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0916  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 90 aa  100  8e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1338  50S ribosomal protein L27  61.73 
 
 		 83 aa  100  8e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000532816  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1816  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 85 aa  100  8e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1348  50S ribosomal protein L27  61.73 
 
 		 83 aa  100  8e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00775897  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2665  ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 90 aa  100  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1443  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 86 aa  100  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15311  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 86 aa  100  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.854601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>