More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0833 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0833  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 84 aa  167  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.5816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1602  50S ribosomal protein L27  89.16 
 
 		 84 aa  150  5e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1899  50S ribosomal protein L27  82.14 
 
 		 84 aa  143  9e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.617273  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1509  50S ribosomal protein L27  82.14 
 
 		 84 aa  142  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00258122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1712  50S ribosomal protein L27  80.95 
 
 		 84 aa  142  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.592545  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1030  50S ribosomal protein L27  77.38 
 
 		 84 aa  138  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011666  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0863  50S ribosomal protein L27  77.38 
 
 		 85 aa  135  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0966779  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1617  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 82 aa  110  6e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000121175  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2217  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 		 91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.856627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3674  50S ribosomal protein L27  75.36 
 
 		 85 aa  107  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.99139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4217  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 85 aa  107  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2703  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 92 aa  107  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2575  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 92 aa  107  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0512  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 85 aa  106  8.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5485  50S ribosomal protein L27  72.46 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.132015  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4194  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1223  ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 83 aa  105  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000141785 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3870  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.403314  normal  0.0137956 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4883  ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 92 aa  105  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113157  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 93 aa  105  3e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1120  50S ribosomal protein L27  69.57 
 
 		 87 aa  105  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.645406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1269  50S ribosomal protein L27  75.36 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000774064  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15461  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 86 aa  104  4e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.120914  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0454  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3276  50S ribosomal protein L27  72.46 
 
 		 85 aa  104  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212602 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3916  50S ribosomal protein L27  71.01 
 
 		 91 aa  104  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00853508 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10120  LSU ribosomal protein L27P  61.9 
 
 		 85 aa  104  5e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28486  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0771  50S ribosomal protein L27  73.91 
 
 		 85 aa  104  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0842  50S ribosomal protein L27  73.91 
 
 		 85 aa  104  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.987021  normal  0.6635 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  55.95 
 
 		 89 aa  103  6e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3006  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 89 aa  103  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549132 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05534  50S ribosomal protein L27  69.57 
 
 		 86 aa  103  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000340822  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0750  50S ribosomal protein L27  72.46 
 
 		 85 aa  103  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00233026 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0489  ribosomal protein L27  57.83 
 
 		 86 aa  102  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  57.83 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0838  50S ribosomal protein L27  73.91 
 
 		 85 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.34705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0643  50S ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 84 aa  102  1e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.301948  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0497  50S ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000367607  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1682  50S ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000249957  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 92 aa  102  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0180  ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00344183  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2480  ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 100 aa  101  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.782187  normal  0.22295 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15061  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 86 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.610968  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 86 aa  101  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4287  50S ribosomal protein L27  57.83 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.835773  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1112  ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 86 aa  101  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.55245  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1108  ribosomal protein L27  57.32 
 
 		 84 aa  100  5e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000226179  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3448  50S ribosomal protein L27  57.65 
 
 		 87 aa  100  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0232252  hitchhiker  0.00744788 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0510  50S ribosomal protein L27  58.82 
 
 		 87 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0309377  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3667  50S ribosomal protein L27  58.82 
 
 		 87 aa  100  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000345306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0100  50S ribosomal protein L27  58.82 
 
 		 87 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00352754  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0552  50S ribosomal protein L27  58.82 
 
 		 87 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000367957  normal  0.045539 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0485  50S ribosomal protein L27  58.82 
 
 		 87 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0162621  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0582  50S ribosomal protein L27  58.82 
 
 		 87 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00040366  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2696  50S ribosomal protein L27  60.76 
 
 		 85 aa  100  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000136289  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1326  50S ribosomal protein L27  57.32 
 
 		 84 aa  100  7e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019115  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2002  50S ribosomal protein L27  62.03 
 
 		 85 aa  100  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.245442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0916  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0896  ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 92 aa  100  7e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000144427  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3066  50S ribosomal protein L27  58.82 
 
 		 86 aa  100  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2218  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 85 aa  100  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000800329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17721  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.106255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 85 aa  100  7e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1137  50S ribosomal protein L27  57.32 
 
 		 84 aa  100  8e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00024272  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1749  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 83 aa  99.8  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000203988  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1338  50S ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 83 aa  99.4  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000532816  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0417  50S ribosomal protein L27  56.63 
 
 		 91 aa  99.4  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.302693 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 93 aa  99.4  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1583  50S ribosomal protein L27  54.12 
 
 		 85 aa  99.4  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1443  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 86 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1348  50S ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 83 aa  99.4  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00775897  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15311  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 86 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.854601  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0154  50S ribosomal protein L27  57.83 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0508  50S ribosomal protein L27  56.47 
 
 		 87 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868007  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2651  50S ribosomal protein L27  57.65 
 
 		 86 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1526  50S ribosomal protein L27  54.12 
 
 		 85 aa  99.4  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2656  50S ribosomal protein L27  59.3 
 
 		 86 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0134308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3478  ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 85 aa  99.4  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000653762  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  57.83 
 
 		 89 aa  99.8  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  58.82 
 
 		 85 aa  98.6  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  57.14 
 
 		 85 aa  98.6  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  71.01 
 
 		 85 aa  99  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2821  50S ribosomal protein L27  58.14 
 
 		 86 aa  99  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000571878  normal  0.308516 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0193  50S ribosomal protein L27  56.79 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.451706 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  71.01 
 
 		 85 aa  99  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 84 aa  99  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05401  50S ribosomal protein L27  58.62 
 
 		 88 aa  98.6  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03730  50S ribosomal protein L27  72.46 
 
 		 85 aa  98.6  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00000322672  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0247  50S ribosomal protein L27  57.83 
 
 		 89 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0588  50S ribosomal protein L27  57.83 
 
 		 90 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2046  ribosomal protein L27  58.02 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3737  50S ribosomal protein L27  72.46 
 
 		 85 aa  99  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000346028  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  56.63 
 
 		 95 aa  99.4  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4102  50S ribosomal protein L27  54.76 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 86 aa  98.6  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  58.82 
 
 		 85 aa  98.6  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 89 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 84 aa  98.6  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>