More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04356 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  602  1.0000000000000001e-171  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  71.15 
 
 		 318 aa  413  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  69.87 
 
 		 320 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  69.87 
 
 		 320 aa  396  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  47.18 
 
 		 321 aa  252  6e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  44.59 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  44.44 
 
 		 317 aa  228  7e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  42.3 
 
 		 314 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  42.62 
 
 		 314 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  42.3 
 
 		 314 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  44.26 
 
 		 313 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  42.81 
 
 		 313 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  41.31 
 
 		 314 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  41.31 
 
 		 314 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  40.46 
 
 		 316 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  43.77 
 
 		 310 aa  209  4e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  41.86 
 
 		 306 aa  208  9e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  40.79 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  39.47 
 
 		 316 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  43.54 
 
 		 322 aa  201  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  39.8 
 
 		 315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  40.58 
 
 		 319 aa  192  4e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  39.22 
 
 		 315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0592  hypothetical protein  35.91 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  40 
 
 		 314 aa  177  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  40.27 
 
 		 316 aa  175  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  38.08 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  36.69 
 
 		 325 aa  171  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  34.53 
 
 		 317 aa  166  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1618  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.32 
 
 		 199 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0210  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  44.32 
 
 		 212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0218369  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  35.33 
 
 		 329 aa  146  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  33.44 
 
 		 329 aa  142  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  33.44 
 
 		 329 aa  142  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1996  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 		 352 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.42027  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE, putative  44.33 
 
 		 196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0287  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  45.6 
 
 		 196 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0878  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  45.6 
 
 		 196 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1467  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  45.6 
 
 		 209 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1664  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  45.6 
 
 		 209 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0319  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  45.6 
 
 		 209 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2440  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  45.6 
 
 		 209 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363141  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2576  thiamine monophosphate synthase  45.6 
 
 		 209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3747  thiamine monophosphate synthase  42.86 
 
 		 194 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.907624  normal  0.127935 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0984  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase protein  38.92 
 
 		 198 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.462651 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5573  thiamine monophosphate synthase  41.27 
 
 		 194 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4895  thiamine monophosphate synthase  40.74 
 
 		 194 aa  116  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166292 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2246  thiamine monophosphate synthase  39.68 
 
 		 194 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0548714 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3677  thiamine monophosphate synthase  39.68 
 
 		 194 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.62971  normal  0.140239 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4514  thiamine monophosphate synthase  39.68 
 
 		 194 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3850  thiamine monophosphate synthase  39.68 
 
 		 194 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  47.9 
 
 		 132 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  47.06 
 
 		 128 aa  102  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  47.93 
 
 		 334 aa  102  7e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  46.22 
 
 		 142 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  47.11 
 
 		 347 aa  101  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  44.17 
 
 		 151 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  46.22 
 
 		 137 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  45.38 
 
 		 132 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  46.22 
 
 		 136 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  44.92 
 
 		 129 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  46.61 
 
 		 135 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  40.17 
 
 		 132 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  40.17 
 
 		 132 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  40.17 
 
 		 132 aa  100  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  44.54 
 
 		 132 aa  99.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  44.54 
 
 		 132 aa  99.8  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  44.54 
 
 		 132 aa  99.8  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.38 
 
 		 135 aa  99  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  37.61 
 
 		 133 aa  98.2  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  46.61 
 
 		 137 aa  98.6  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  41.23 
 
 		 130 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  42.5 
 
 		 134 aa  98.6  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  40.35 
 
 		 130 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  40.35 
 
 		 130 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  33.2 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.38 
 
 		 135 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  44.92 
 
 		 150 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.88 
 
 		 134 aa  97.1  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  43.22 
 
 		 138 aa  96.7  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  40.18 
 
 		 128 aa  96.7  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20801  adenine glycosylase  39.17 
 
 		 384 aa  97.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.24 
 
 		 128 aa  96.3  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.24 
 
 		 128 aa  96.3  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.24 
 
 		 128 aa  96.3  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  37.29 
 
 		 129 aa  95.9  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  37.61 
 
 		 129 aa  95.9  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  38.46 
 
 		 131 aa  95.9  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  42.11 
 
 		 132 aa  95.5  9e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.24 
 
 		 138 aa  95.5  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.24 
 
 		 138 aa  95.5  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  43.22 
 
 		 138 aa  95.1  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  38.46 
 
 		 130 aa  95.5  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  41.18 
 
 		 142 aa  95.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  44.54 
 
 		 144 aa  95.1  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.1 
 
 		 138 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  39.5 
 
 		 131 aa  95.5  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  43.22 
 
 		 138 aa  95.1  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  40.52 
 
 		 135 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1205  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.33 
 
 		 384 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>