109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1735 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  90.95 
 
 		 210 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  73.68 
 
 		 211 aa  314  8e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  67.62 
 
 		 210 aa  288  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  69.52 
 
 		 210 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  72.08 
 
 		 200 aa  275  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  70 
 
 		 210 aa  274  7e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  70.53 
 
 		 212 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  65.71 
 
 		 210 aa  264  7e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  62.81 
 
 		 199 aa  240  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1759  DSBA oxidoreductase  68.34 
 
 		 199 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  48.97 
 
 		 207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  41.06 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  43.63 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  42.36 
 
 		 221 aa  145  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  44.83 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  41.38 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  33.99 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  37.98 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  38.1 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  40.84 
 
 		 259 aa  121  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  33.51 
 
 		 242 aa  116  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  33.51 
 
 		 238 aa  116  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6828  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold protein  37.56 
 
 		 210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.391464 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22500  protein-disulfide isomerase  35.18 
 
 		 244 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000773657  hitchhiker  0.0000178225 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0545  hypothetical protein  32.8 
 
 		 200 aa  108  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  33.68 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  30.85 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  29.61 
 
 		 242 aa  95.1  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  27.37 
 
 		 206 aa  89  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  28.65 
 
 		 209 aa  89.4  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  31.41 
 
 		 222 aa  89  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  28.8 
 
 		 206 aa  89  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  27.89 
 
 		 206 aa  88.6  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  29.25 
 
 		 209 aa  88.6  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  34.85 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  34.83 
 
 		 231 aa  85.5  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  26.84 
 
 		 206 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  36.92 
 
 		 233 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  30.6 
 
 		 208 aa  84.7  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  34.29 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  27.45 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  31.16 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  29.74 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1753  hypothetical protein  29.73 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  28.73 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  29.12 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3629  hypothetical protein  33.16 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  36.18 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00700  hypothetical protein  35.2 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  32.45 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  29.25 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  28.3 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2523  DSBA oxidoreductase  26.89 
 
 		 300 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2293  hypothetical protein  31.63 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  31.63 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  30.73 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0966  hypothetical protein  31.63 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02994  protein-disulfide isomerase  26.9 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3255  hypothetical protein  31.63 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101602  hitchhiker  0.0000000123908 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1019  hypothetical protein  31.63 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3490  hypothetical protein  30.73 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  26.46 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2391  dithiol-disulfide isomerase  24.12 
 
 		 319 aa  65.5  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1805  thioredoxin  30.68 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.379307  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1372  hypothetical protein  31.94 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0623516  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2460  protein-disulfide isomerase  31.94 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161957  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0358  hypothetical protein  31.94 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.496177  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0636  hypothetical protein  31.94 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1267  hypothetical protein  31.94 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.42251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1193  hypothetical protein  31.94 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0935  hypothetical protein  31.94 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  26.98 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1561  DSBA oxidoreductase  29.38 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000756973  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6472  hypothetical protein  30.82 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4159  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  24.37 
 
 		 328 aa  62  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  24.61 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1542  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  35.04 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1089  putative protein-disulfide isomerase  29.47 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  25.41 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3475  hypothetical protein  30.53 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2050  DSBA oxidoreductase  21.83 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1089  putative protein-disulfide isomerase  29.23 
 
 		 217 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1155  putative protein-disulfide isomerase  29.23 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1475  DSBA oxidoreductase  34.44 
 
 		 220 aa  52  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  24.09 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1205  putative protein-disulfide isomerase  27.62 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.090867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3166  putative protein-disulfide isomerase  27.07 
 
 		 230 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3309  putative protein-disulfide isomerase  27.07 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2376  DSBA oxidoreductase  29.78 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248957  normal  0.930115 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2784  putative protein-disulfide isomerase  26.82 
 
 		 233 aa  48.5  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0238093  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  32.39 
 
 		 221 aa  48.1  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0963  DSBA oxidoreductase  28.06 
 
 		 230 aa  47.4  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0391729  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3165  putative protein-disulfide isomerase  27.37 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1625  hypothetical protein  24.42 
 
 		 297 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3785  DSBA oxidoreductase  33.72 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400426  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5568  DSBA oxidoreductase  31.93 
 
 		 198 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.433092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2566  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  33.85 
 
 		 203 aa  45.1  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.901141  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1351  protein-disulfide isomerase-like protein  30.61 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485662  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>