74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4124 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4124  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00126127  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2065  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  66.67 
 
 		 132 aa  100  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5218  hypothetical protein  70.27 
 
 		 82 aa  94.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0877789  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1889  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  68.06 
 
 		 77 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0475  hypothetical protein  68.06 
 
 		 77 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284362  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0572  hypothetical protein  68.06 
 
 		 77 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.313492  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0883  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 77 aa  88.2  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1417  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 77 aa  88.2  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0975187  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2197  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 77 aa  88.2  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.725852  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1842  ferredoxin  58.67 
 
 		 84 aa  85.5  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4669  ferredoxin  53.85 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646461  normal  0.942381 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4445  ferredoxin  63.89 
 
 		 77 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.94814 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0876  putative ferredoxin-containing oxidase  58.11 
 
 		 98 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4224  ferredoxin  63.89 
 
 		 77 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117463  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4142  ferredoxin  63.89 
 
 		 77 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.390351  normal  0.0464627 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4562  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  53.25 
 
 		 591 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0998615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4033  ferredoxin  75.56 
 
 		 77 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.199758 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3552  ferredoxin  75.56 
 
 		 77 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1892  ferredoxin  73.33 
 
 		 77 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.457953 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3377  ferredoxin  73.33 
 
 		 77 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264604  normal  0.288176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0690  hypothetical protein  43.42 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0780442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2710  hypothetical protein  38.16 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.678347  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6614  hypothetical protein  40.79 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0572685 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6381  hypothetical protein  40.79 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1932  putative sarcosine oxidase alpha subunit  46.15 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3638  hypothetical protein  35.9 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0468705  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4935  hypothetical protein  44.59 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.254281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7054  hypothetical protein  44.87 
 
 		 113 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.385812 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1892  hypothetical protein  46.15 
 
 		 126 aa  52  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00275007  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3103  hydrogen cyanide synthase HcnA  42.11 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0827146  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000038  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  51.2  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0205  hypothetical protein  43.59 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.512826 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6212  hypothetical protein  39.47 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.56865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1687  hypothetical protein  37.84 
 
 		 102 aa  50.1  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.410801  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36330  hydrogen cyanide synthase HcnA  39.74 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.533947 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4725  FAD dependent oxidoreductase  40.26 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8314  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  46.97 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2707  hypothetical protein  46.05 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.861787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6587  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  37.66 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.29085 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0779  hypothetical protein  39.47 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.474685 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  45 
 
 		 960 aa  47.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4399  putative sarcosine oxidase alpha subunit  38.16 
 
 		 99 aa  47.8  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2501  sarcosine oxidase alpha subunit  40 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.295491  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1838  putative sarcosine oxidase alpha subunit  46.97 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227251  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3516  ferredoxin  37.84 
 
 		 108 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0641626  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2741  putative sarcosine oxidase alpha subunit  44.26 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00423187  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6499  hypothetical protein  37.18 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0050  hypothetical protein  41.03 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4415  hypothetical protein  40 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal  0.855895 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4375  hypothetical protein  42.31 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6004  hypothetical protein  44.87 
 
 		 120 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5072  ferredoxin  43.28 
 
 		 85 aa  44.3  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0253  hypothetical protein  33.77 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0926  hypothetical protein  43.28 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.99107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6007  hypothetical protein  37.97 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00459941  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3208  hypothetical protein  35.21 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1832  SoxA protein  34.62 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.537733 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0755  hypothetical protein  35.53 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0153  hypothetical protein  32.47 
 
 		 103 aa  42  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6549  hypothetical protein  41.56 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851972  normal  0.34224 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4428  hypothetical protein  33.77 
 
 		 128 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121041  normal  0.609909 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  36.84 
 
 		 983 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0305  hypothetical protein  32.89 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6627  hypothetical protein  35.53 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.511531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4391  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.5 
 
 		 886 aa  40.4  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.410335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01437  sarcosine oxidase alpha subunit  52.17 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.354445  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4523  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.5 
 
 		 886 aa  40.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.195662  normal  0.224956 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3944  hypothetical protein  45.83 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.260668  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2647  sarcosine oxidase subunit alpha, N-terminal  31.17 
 
 		 110 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0375869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2598  sarcosine oxidase, alpha subunit  31.17 
 
 		 110 aa  40  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5701  hypothetical protein  40.79 
 
 		 99 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6065  hypothetical protein  40.79 
 
 		 99 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0938  hypothetical protein  37.33 
 
 		 469 aa  40  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.903873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2844  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  31.17 
 
 		 110 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000266999 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>