50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0048 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0048  putative lipoprotein  100 
 
 
228 aa  466  1e-130  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00570  putative lipoprotein  98.68 
 
 
228 aa  459  1e-128  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27192  normal  0.120076 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1250  CsgG family protein  81.53 
 
 
227 aa  374  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01776  lipoprotein  82.94 
 
 
227 aa  371  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00673998  normal  0.858527 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5339  CsgG family protein  83.09 
 
 
224 aa  367  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1457  curli production assembly/transport component CsgG  83.33 
 
 
225 aa  358  4e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1390  curli production assembly/transport component CsgG  74.32 
 
 
223 aa  343  1e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4012  Curli production assembly/transport component CsgG  73.87 
 
 
223 aa  340  7e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.767014  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4221  Curli production assembly/transport component CsgG  72.97 
 
 
223 aa  338  5e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4279  Curli production assembly/transport component CsgG  71.62 
 
 
223 aa  335  3e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4600  Curli production assembly/transport component CsgG  73.93 
 
 
223 aa  334  5e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2723  curli production assembly/transport component CsgG  77.07 
 
 
244 aa  332  2e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1449  curli production assembly/transport component CsgG  76.59 
 
 
223 aa  331  5e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1337  curli production assembly/transport component CsgG  76.59 
 
 
223 aa  331  5e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.919367  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3562  curli production assembly/transport component CsgG  72.4 
 
 
224 aa  330  8e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167044  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3970  csgG family protein  71.36 
 
 
225 aa  322  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3889  csgG family protein  71.36 
 
 
225 aa  322  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.816763  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3082  putative curli production assembly/transport component CsgG  71.17 
 
 
301 aa  322  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.601979  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1651  putative curli production assembly/transport component CsgG  71.17 
 
 
301 aa  322  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3467  putative curli production assembly/transport component CsgG  71.17 
 
 
301 aa  322  3e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0109  CsgG family protein  70.91 
 
 
225 aa  320  1e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136515  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5407  curli production assembly/transport component CsgG  70.91 
 
 
226 aa  315  5e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2999  curli production assembly/transport component CsgG  74.02 
 
 
225 aa  312  2e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2891  curli production assembly/transport component CsgG, putative  74.38 
 
 
207 aa  311  5e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3206  curli production assembly/transport component CsgG, putative  73.89 
 
 
207 aa  311  8e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2914  curli production assembly/transport component CsgG  73.3 
 
 
225 aa  308  4e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49802  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3024  curli production assembly/transport component CsgG  73.4 
 
 
225 aa  307  7e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3005  curli production assembly/transport component CsgG  72.91 
 
 
253 aa  306  2e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2391  twin-arginine translocation pathway signal  72.91 
 
 
253 aa  306  2e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2759  Curli production assembly/transport component CsgG  69.63 
 
 
226 aa  305  3e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0880  outer membrane lipoprotein  62.9 
 
 
224 aa  289  3e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1493  outer membrane lipoprotein  61.71 
 
 
219 aa  272  3e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0503324  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1131  curli production assembly/transport component CsgG subfamily protein  59.82 
 
 
222 aa  271  5e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00305065  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4121  curli production assembly/transport component CsgG  33.78 
 
 
323 aa  125  7e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1763  putative curli production assembly/transport component CsgG  32.63 
 
 
324 aa  124  9e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281584  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0420  Curli production assembly/transport component CsgG  37.08 
 
 
321 aa  120  2e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690548  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0419  Curli production assembly/transport component CsgG  37.08 
 
 
321 aa  120  2e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0391  curli production assembly/transport component CsgG  37.64 
 
 
320 aa  119  4e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4674  curli production assembly/transport component CsgG  30.67 
 
 
337 aa  104  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.501006  normal  0.0721593 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3425  putative lipoprotein  60.49 
 
 
100 aa  97.1  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05526  hypothetical protein  32.16 
 
 
322 aa  97.4  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3786  hypothetical protein  29.78 
 
 
321 aa  86.7  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0180472  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1195  hypothetical protein  27.15 
 
 
315 aa  62.8  5e-09  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00195714  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1286  Curli production assembly/transport component CsgG  26.47 
 
 
260 aa  57.4  2e-07  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.47736  normal  0.229082 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1695  hypothetical protein  27.37 
 
 
332 aa  48.5  9e-05  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1457  CsgG family protein, putative  27.92 
 
 
330 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3644  curli production assembly/transport component CsgG  24.84 
 
 
340 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8014  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4187  hypothetical protein  27.94 
 
 
574 aa  43.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0666  curli production assembly/transport component CsgG  26.37 
 
 
490 aa  43.5  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0033  hypothetical protein  25.58 
 
 
422 aa  42.4  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>