154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_68115 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_68115  predicted protein  100 
 
 
515 aa  1066    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06041  DUF185 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09740)  35.81 
 
 
504 aa  256  5e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.115857  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00510  conserved hypothetical protein  35.78 
 
 
449 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1412  hypothetical protein  31.5 
 
 
375 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00525557  normal  0.308753 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2261  hypothetical protein  32.93 
 
 
356 aa  209  7e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3094  hypothetical protein  31.59 
 
 
375 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4843  protein of unknown function DUF185  32.32 
 
 
379 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1764  hypothetical protein  30.34 
 
 
375 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526416  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2503  hypothetical protein  31.2 
 
 
390 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156222  normal  0.549612 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3876  hypothetical protein  31.91 
 
 
376 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234317  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0259  hypothetical protein  31.48 
 
 
353 aa  193  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.655158 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4165  hypothetical protein  31.08 
 
 
376 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.576249  normal  0.0725771 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2549  hypothetical protein  30.75 
 
 
368 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569612  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5254  protein of unknown function DUF185  31.68 
 
 
367 aa  187  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41366  predicted protein  34.47 
 
 
461 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.151662  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3534  hypothetical protein  28.64 
 
 
386 aa  183  8.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196392  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0231  hypothetical protein  29.88 
 
 
353 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2759  protein of unknown function DUF185  28.83 
 
 
366 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511112  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0619  hypothetical protein  31.31 
 
 
357 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2212  hypothetical protein  31.16 
 
 
355 aa  180  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2650  hypothetical protein  30.35 
 
 
363 aa  180  4.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0487  hypothetical protein  28.78 
 
 
356 aa  180  5.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2151  hypothetical protein  29.93 
 
 
358 aa  180  5.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5412  hypothetical protein  30.52 
 
 
356 aa  179  7e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2884  hypothetical protein  30.22 
 
 
361 aa  177  5e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3022  protein of unknown function DUF185  29.7 
 
 
366 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.838138  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3110  protein of unknown function DUF185  30.05 
 
 
361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.922104  normal  0.232642 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3172  hypothetical protein  29.88 
 
 
377 aa  175  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0778857  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0760  hypothetical protein  29.64 
 
 
366 aa  171  3e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.562403 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2253  hypothetical protein  29.78 
 
 
367 aa  169  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262355  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0717  hypothetical protein  31.39 
 
 
349 aa  168  2e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3007  protein of unknown function DUF185  29.98 
 
 
362 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1579  hypothetical protein  30.14 
 
 
351 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1638  hypothetical protein  28.75 
 
 
363 aa  164  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3334  hypothetical protein  31.41 
 
 
371 aa  164  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1134  protein of unknown function DUF185  28.24 
 
 
369 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0347191 
 
 
-
 
NC_004310  BR1529  hypothetical protein  28.25 
 
 
365 aa  160  6e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0995  hypothetical protein  30.67 
 
 
366 aa  160  7e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199095  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1478  hypothetical protein  28 
 
 
365 aa  158  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00590219  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1230  hypothetical protein  28.67 
 
 
351 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.369365  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3290  hypothetical protein  28.46 
 
 
367 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0642  hypothetical protein  30.87 
 
 
364 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175347  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0762  hypothetical protein  30.95 
 
 
335 aa  151  3e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.244362  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0679  hypothetical protein  27.36 
 
 
351 aa  146  8.000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0313  hypothetical protein  30.08 
 
 
335 aa  144  3e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.368023  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1092  protein of unknown function DUF185  26.8 
 
 
339 aa  143  6e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.192418  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0673  hypothetical protein  27.61 
 
 
402 aa  140  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0424  hypothetical protein  27.64 
 
 
324 aa  139  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  26.59 
 
 
393 aa  132  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0601  hypothetical protein  27.25 
 
 
323 aa  122  1.9999999999999998e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.434393  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15641  predicted protein  30 
 
 
349 aa  121  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  26.23 
 
 
398 aa  117  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  22.48 
 
 
386 aa  94.7  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2793  protein of unknown function DUF185  24.28 
 
 
386 aa  93.2  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.425322  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  23.97 
 
 
370 aa  92.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3044  protein of unknown function DUF185  26.33 
 
 
387 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1649  protein of unknown function DUF185  23 
 
 
386 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0325386  hitchhiker  0.0000000752417 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2524  hypothetical protein  23.9 
 
 
403 aa  91.7  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4813  hypothetical protein  25.62 
 
 
397 aa  89.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1418  protein of unknown function DUF185  24.78 
 
 
385 aa  89.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1815  hypothetical protein  26.64 
 
 
394 aa  89  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.520553  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  24.12 
 
 
384 aa  88.2  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0337  hypothetical protein  25.11 
 
 
424 aa  87.4  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0943  hypothetical protein  25.73 
 
 
385 aa  87.4  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000189258  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2330  hypothetical protein  24.14 
 
 
394 aa  86.7  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  23.75 
 
 
387 aa  85.5  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0224  hypothetical protein  26.71 
 
 
400 aa  85.1  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  25.12 
 
 
384 aa  84.7  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  22.78 
 
 
417 aa  84.7  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2027  hypothetical protein  22.8 
 
 
388 aa  84.7  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3084  hypothetical protein  26.32 
 
 
385 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4393  hypothetical protein  24.92 
 
 
370 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4280  hypothetical protein  23.76 
 
 
370 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4011  hypothetical protein  23.76 
 
 
370 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.188919  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2351  protein of unknown function DUF185  24.18 
 
 
410 aa  80.1  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0104  hypothetical protein  22.86 
 
 
404 aa  79.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3820  protein of unknown function DUF185  24.07 
 
 
377 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3870  protein of unknown function DUF185  24.07 
 
 
377 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4162  hypothetical protein  23.9 
 
 
370 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0783755  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4001  hypothetical protein  23.35 
 
 
370 aa  79  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3886  hypothetical protein  22.78 
 
 
394 aa  79.3  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.643173  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0697  protein of unknown function DUF185  24.36 
 
 
391 aa  78.6  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4484  hypothetical protein  23.9 
 
 
368 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.444169  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2374  protein of unknown function DUF185  25.83 
 
 
380 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4113  hypothetical protein  25.21 
 
 
370 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0476  hypothetical protein  23.56 
 
 
386 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0155  hypothetical protein  24.36 
 
 
397 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621796  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4340  hypothetical protein  24.32 
 
 
368 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2997  hypothetical protein  21.46 
 
 
396 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04309  hypothetical protein  24.82 
 
 
394 aa  77  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.954099  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0602  protein of unknown function DUF185  25.75 
 
 
398 aa  76.3  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.758537  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2895  hypothetical protein  22.39 
 
 
397 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15581  hypothetical protein  22.37 
 
 
405 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.540295 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0048  protein of unknown function DUF185  24.22 
 
 
397 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  22.77 
 
 
397 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0199  protein of unknown function DUF185  25.53 
 
 
377 aa  74.3  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  23.47 
 
 
393 aa  74.3  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07541  hypothetical protein  26.33 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2702  hypothetical protein  22.93 
 
 
384 aa  73.2  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.588204  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  22.91 
 
 
404 aa  73.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0693377 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>