32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49843 on replicon NC_011693
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011693  PHATRDRAFT_49843  predicted protein  100 
 
 		 675 aa  1387    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28091  MOP(MATE) family transporter  27.77 
 
 		 504 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0057098  normal  0.084674 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54598  predicted protein  26.8 
 
 		 530 aa  111  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.954409  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44222  enhanced disease susceptibility 5-like protein  33.74 
 
 		 564 aa  95.1  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44112  predicted protein  32.24 
 
 		 757 aa  77  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44111  predicted protein  25.95 
 
 		 597 aa  62.4  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002151  DNA-damage-inducible protein F  26.55 
 
 		 449 aa  54.3  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.539092  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0247  MATE efflux family protein  23.65 
 
 		 447 aa  53.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3792  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 456 aa  51.6  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2891  multidrug efflux pump  26.67 
 
 		 443 aa  52  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0144  MATE efflux family protein  25.81 
 
 		 455 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4191  MATE efflux family protein  25.81 
 
 		 456 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00266  multidrug efflux pump  26.37 
 
 		 423 aa  50.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4322  MATE efflux family protein  25.81 
 
 		 455 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4123  MATE efflux family protein  25.81 
 
 		 455 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23253  multi antimicrobial extrusion family protein  31.19 
 
 		 492 aa  48.5  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332151  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2965  MATE efflux family protein  25.09 
 
 		 446 aa  48.5  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4617  DNA-damage-inducible protein F  25 
 
 		 455 aa  48.1  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3875  MATE efflux family protein  24.58 
 
 		 456 aa  48.1  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3802  MATE efflux family protein  25.45 
 
 		 455 aa  47.8  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4001  MATE efflux family protein  23.58 
 
 		 455 aa  47.4  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  29.21 
 
 		 434 aa  47  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4009  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 443 aa  47  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0110  MATE efflux family protein  23.19 
 
 		 469 aa  46.2  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.372068  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  27.55 
 
 		 449 aa  45.8  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0180  MATE efflux family protein  27.7 
 
 		 445 aa  45.8  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31926  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  24.17 
 
 		 461 aa  45.8  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  32.58 
 
 		 471 aa  45.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1452  MATE efflux family protein  27.87 
 
 		 442 aa  45.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  23.35 
 
 		 448 aa  45.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0107  MATE efflux family protein  26.85 
 
 		 448 aa  44.7  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4844  DNA-damage-inducible protein F  26.27 
 
 		 446 aa  43.9  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>