223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_39151 on replicon NC_011686
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011686  PHATRDRAFT_39151  predicted protein  100 
 
 
481 aa  992    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0075  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.43 
 
 
446 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0678  thymidine phosphorylase  42.06 
 
 
433 aa  313  5.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1101  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.96 
 
 
438 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06970  thymidine phosphorylase  39.86 
 
 
434 aa  310  4e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2054  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  41.19 
 
 
438 aa  310  4e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  41.92 
 
 
433 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4182  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.17 
 
 
434 aa  305  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1775  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  37.69 
 
 
441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1625  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.53 
 
 
437 aa  302  9e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2275  thymidine phosphorylase  41.46 
 
 
435 aa  301  2e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178657  hitchhiker  0.000000323962 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1471  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  38.91 
 
 
434 aa  301  2e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.606282  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0147  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  38.97 
 
 
441 aa  301  2e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1750  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  38.96 
 
 
440 aa  300  3e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0662  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.51 
 
 
434 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.132104  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1176  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  41.5 
 
 
434 aa  298  1e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.246422  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2254  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  38.79 
 
 
433 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1138  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  41.27 
 
 
434 aa  297  2e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000122674  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0409  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  39.65 
 
 
431 aa  296  7e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2191  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  41.61 
 
 
443 aa  293  3e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6093  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.46 
 
 
438 aa  294  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0759218  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2172  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  39.1 
 
 
433 aa  294  3e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2210  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  39.1 
 
 
433 aa  294  3e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1744  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  38.21 
 
 
433 aa  293  4e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1357  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.16 
 
 
424 aa  293  6e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3447  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.98 
 
 
430 aa  293  7e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2784  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  38.2 
 
 
434 aa  291  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1280  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.99 
 
 
441 aa  291  1e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1734  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  37.47 
 
 
433 aa  291  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000258964  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1754  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  37.47 
 
 
433 aa  291  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000169733  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1897  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  37.47 
 
 
431 aa  291  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000548599  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0113  thymidine phosphorylase  40 
 
 
432 aa  291  2e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000787887  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1977  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  37.47 
 
 
433 aa  290  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0131887  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1756  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  37.47 
 
 
433 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.212389  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1705  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  37.47 
 
 
433 aa  290  3e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324396  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3449  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  37.47 
 
 
433 aa  290  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0452293  hitchhiker  9.91695e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3916  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  37.75 
 
 
434 aa  290  3e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1894  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  37.47 
 
 
433 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000430221  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0651  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  44.37 
 
 
435 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1929  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  37.47 
 
 
433 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03249e-46 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0737  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  39.18 
 
 
582 aa  290  3e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1042  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  37.98 
 
 
434 aa  290  4e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00204257  decreased coverage  0.0000153983 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4195  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  37.98 
 
 
434 aa  290  4e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00109232  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2004  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  39.29 
 
 
433 aa  290  4e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441016  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3842  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  37.75 
 
 
434 aa  288  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00792291  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4109  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  37.75 
 
 
434 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.99872e-53 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0651  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.92 
 
 
435 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3238  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  41.78 
 
 
435 aa  288  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4218  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  37.75 
 
 
434 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000180142  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4154  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  37.75 
 
 
434 aa  288  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00147082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3995  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  37.75 
 
 
434 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0822094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3826  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  37.75 
 
 
434 aa  288  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000962839  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4307  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  37.75 
 
 
434 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00037416  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0370  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  39.46 
 
 
439 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1840  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.05 
 
 
434 aa  285  9e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.166082  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1488  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  39.24 
 
 
434 aa  285  2.0000000000000002e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.023549  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0829  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.61 
 
 
431 aa  285  2.0000000000000002e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.829074  normal  0.764393 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1776  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  38.66 
 
 
433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1665  thymidine phosphorylase  40.36 
 
 
444 aa  283  3.0000000000000004e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.477565  normal  0.134735 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2062  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  38.66 
 
 
433 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1780  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  41.81 
 
 
437 aa  281  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.187256  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0617  thymidine phosphorylase  43.92 
 
 
435 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.640469  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3535  thymidine phosphorylase  40.58 
 
 
428 aa  281  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00606286  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1531  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  39.25 
 
 
430 aa  280  3e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.291461  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0039  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  39.01 
 
 
433 aa  280  5e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0183104  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2180  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  38.34 
 
 
435 aa  277  3e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.571226 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25710  thymidine phosphorylase  42.82 
 
 
440 aa  276  8e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302747 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0999  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.14 
 
 
432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.182708  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4730  thymidine phosphorylase  40.17 
 
 
433 aa  274  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0877  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  36.73 
 
 
441 aa  274  3e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0834684  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4177  thymidine phosphorylase  41.15 
 
 
435 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0969  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  41.13 
 
 
432 aa  272  9e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880368  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0682  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.4 
 
 
428 aa  272  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.390934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0756  thymidine phosphorylase  41.26 
 
 
426 aa  271  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1142  thymidine phosphorylase  43.73 
 
 
440 aa  270  4e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.698076  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1274  Thymidine phosphorylase  39.61 
 
 
426 aa  270  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0787  thymidine phosphorylase  41.65 
 
 
429 aa  270  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3497  thymidine phosphorylase  37.17 
 
 
440 aa  269  8e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3626  thymidine phosphorylase  37.17 
 
 
440 aa  269  8e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5934  thymidine phosphorylase  40.13 
 
 
444 aa  269  8e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0130951 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0812  thymidine phosphorylase  41.12 
 
 
426 aa  269  8.999999999999999e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.376923 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08120  thymidine phosphorylase  42.34 
 
 
433 aa  268  1e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.80887  normal  0.487259 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4890  thymidine phosphorylase  40 
 
 
440 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00649353  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4924  thymidine phosphorylase  40 
 
 
440 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.118094  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4822  thymidine phosphorylase  40 
 
 
440 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.524384  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4983  thymidine phosphorylase  40 
 
 
440 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.615857  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1215  thymidine phosphorylase  43.07 
 
 
443 aa  268  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000539787 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0265  thymidine phosphorylase  37.28 
 
 
439 aa  267  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0830  thymidine phosphorylase  36.96 
 
 
471 aa  267  2.9999999999999995e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0542  thymidine phosphorylase  37.93 
 
 
440 aa  267  2.9999999999999995e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.492482  normal  0.113052 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04258  thymidine phosphorylase  39.76 
 
 
440 aa  266  4e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5897  thymidine phosphorylase  39.76 
 
 
440 aa  266  4e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4929  thymidine phosphorylase  39.76 
 
 
440 aa  266  4e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4981  thymidine phosphorylase  39.76 
 
 
440 aa  266  4e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3674  thymidine phosphorylase  39.76 
 
 
440 aa  266  4e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.104507 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4931  thymidine phosphorylase  39.76 
 
 
440 aa  266  4e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04224  hypothetical protein  39.76 
 
 
440 aa  266  4e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.894595  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl119  thymidine phosphorylase  38.77 
 
 
434 aa  266  5e-70  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4617  thymidine phosphorylase  39.76 
 
 
440 aa  266  5e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4976  thymidine phosphorylase  39.76 
 
 
440 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.718604  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>