209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_30466 on replicon NC_011691
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011691  PHATRDRAFT_30466  predicted protein  100 
 
 		 361 aa  750    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.51 
 
 		 310 aa  295  6e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.08 
 
 		 309 aa  285  9e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.82 
 
 		 310 aa  285  1.0000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  44.04 
 
 		 313 aa  281  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.44 
 
 		 311 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.77 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  43.29 
 
 		 313 aa  265  1e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  38.15 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08371  putative mRNA binding protein  38.46 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499278  normal  0.0509544 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  40.13 
 
 		 301 aa  219  5e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  39.87 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  39.69 
 
 		 341 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09641  putative mRNA binding protein  34.4 
 
 		 323 aa  206  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.513424  hitchhiker  0.0042312 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  34.75 
 
 		 306 aa  204  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  35.18 
 
 		 306 aa  203  5e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  34.1 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  33.87 
 
 		 306 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43121  predicted protein  30.33 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.154535 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43341  predicted protein  30.33 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0269246 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43169  predicted protein  27.43 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0856686  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.22 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.6 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.33 
 
 		 328 aa  75.9  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.89 
 
 		 336 aa  74.7  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0557769  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.63 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.23 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.84 
 
 		 329 aa  72.8  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.76 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.91 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.82 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.760567  normal  0.885082 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.12 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0625265  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.84 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.22 
 
 		 336 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.26 
 
 		 342 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.194967  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5628  hypothetical protein  29.9 
 
 		 290 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5128  hypothetical protein  28.57 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1303  methyltransferase FkbM  28.85 
 
 		 619 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2035  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.91 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.91 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.3 
 
 		 346 aa  62  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5580  hypothetical protein  28.08 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5542  hypothetical protein  28.57 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.449911 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5301  hypothetical protein  28.57 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5697  hypothetical protein  28.57 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5572  hypothetical protein  27.32 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.37 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5143  hypothetical protein  29.06 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.673361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8736  hypothetical protein  25.69 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1182  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  21.39 
 
 		 337 aa  57  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.139241  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5377  hypothetical protein  26.29 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00568321  normal  0.0173928 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.71 
 
 		 345 aa  57  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117402  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.43 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390546  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.97 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4700  NAD dependent epimerase/dehydratase family  28.96 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.45 
 
 		 330 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0228  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  23.84 
 
 		 310 aa  55.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.194906  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0263  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.74 
 
 		 338 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.86 
 
 		 306 aa  56.2  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.77 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.24 
 
 		 337 aa  54.7  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.472972 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.74 
 
 		 350 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1066  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.73 
 
 		 321 aa  54.7  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.3 
 
 		 315 aa  53.9  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.72 
 
 		 368 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2638  UDP-glucuronate 5'-epimerase  21.96 
 
 		 336 aa  53.5  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  19.53 
 
 		 337 aa  53.1  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.681243  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1400  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  19.88 
 
 		 337 aa  52.8  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2499  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.71 
 
 		 337 aa  52.8  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.85 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.15 
 
 		 316 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2545  putative mRNA-binding protein  22.26 
 
 		 327 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0962067  hitchhiker  0.000986877 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2854  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 		 349 aa  52.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.98 
 
 		 346 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0492299  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  19.35 
 
 		 340 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  23.05 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.8 
 
 		 328 aa  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8770  NAD dependent epimerase/dehydratase family  28.57 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  17.86 
 
 		 341 aa  51.2  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.35 
 
 		 335 aa  51.2  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein/3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  25 
 
 		 330 aa  50.8  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0199  hypothetical protein  23.41 
 
 		 317 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 		 324 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0974176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.27 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3036  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.05 
 
 		 334 aa  50.8  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  23.34 
 
 		 334 aa  50.8  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.93 
 
 		 317 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.8 
 
 		 314 aa  50.8  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1601  UDP-glucose 4-epimerase  29.01 
 
 		 337 aa  50.4  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383307  normal  0.0692735 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  18.82 
 
 		 336 aa  50.4  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3737  NADH dehydrogenase  23.02 
 
 		 317 aa  50.1  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.288709  normal  0.886457 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.87 
 
 		 324 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.07 
 
 		 339 aa  49.7  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.626876  normal  0.709829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.41 
 
 		 341 aa  49.7  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0430992  normal  0.16765 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  23.34 
 
 		 328 aa  49.7  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.41 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3810  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.35 
 
 		 345 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.98 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6794  NAD dependent epimerase/dehydratase family  37.5 
 
 		 331 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>