More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_14535 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_14535  predicted protein  100 
 
 
102 aa  197  3e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.377266  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29904  Putative mitochondrial ribosomal protein L24  44.33 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  49.49 
 
 
102 aa  75.9  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04510  50S ribosomal protein L24  46 
 
 
105 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0040022  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  47 
 
 
105 aa  74.7  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  48.48 
 
 
112 aa  74.3  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  47.96 
 
 
102 aa  74.3  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  47.96 
 
 
106 aa  73.6  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  46.46 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  46.46 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  46.46 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  46.46 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  46.46 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  46.46 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2158  ribosomal protein L24  45.54 
 
 
104 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0775088  normal  0.23262 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  46.46 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  46.46 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  46.46 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  46.46 
 
 
103 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1754  50S ribosomal protein L24  44.55 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277856  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  45.1 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  43.56 
 
 
106 aa  71.6  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  46.08 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  45.1 
 
 
103 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  45.45 
 
 
105 aa  71.2  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 
105 aa  70.9  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 
105 aa  70.9  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0505  50S ribosomal protein L24  40.2 
 
 
110 aa  70.1  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0612161  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  45 
 
 
106 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  44.12 
 
 
103 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  44.55 
 
 
104 aa  68.2  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  44.33 
 
 
109 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  41.41 
 
 
108 aa  67.8  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0334  ribosomal protein L24  41.58 
 
 
107 aa  67.8  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000366107  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 
105 aa  67.4  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0444  50S ribosomal protein L24  40.2 
 
 
105 aa  67  0.00000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0162317  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  41.58 
 
 
105 aa  67  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5776  ribosomal protein L24  41 
 
 
118 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0501804  normal  0.536525 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  43.69 
 
 
105 aa  65.5  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0970  50S ribosomal protein L24  42.42 
 
 
105 aa  65.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000143141  hitchhiker  0.000000947265 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0290  50S ribosomal protein L24  44.55 
 
 
105 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000794802  hitchhiker  0.00000184934 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  42.72 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000585684  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  39.6 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0469  50S ribosomal protein L24  37.62 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4925  ribosomal protein L24  41.38 
 
 
93 aa  63.9  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0021231  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  42 
 
 
106 aa  63.9  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1173  ribosomal protein L24  41.58 
 
 
107 aa  63.5  0.0000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0344247  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1843  50S ribosomal protein L24  37 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0348  50S ribosomal protein L24  37 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000772359  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2246  50S ribosomal protein L24  41.58 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00124934  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  40.4 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0699  50S ribosomal protein L24  41.03 
 
 
123 aa  63.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1000  50S ribosomal protein L24  41.18 
 
 
104 aa  62.8  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00244473  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0330  50S ribosomal protein L24  42.72 
 
 
106 aa  62  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.5069e-23  unclonable  0.0000000479114 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  43.43 
 
 
104 aa  62  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  40.59 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3938  50S ribosomal protein L24  42.42 
 
 
105 aa  61.2  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0416  50S ribosomal protein L24P  43.18 
 
 
107 aa  61.2  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000110454  normal  0.227235 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2054  50S ribosomal protein L24  40.21 
 
 
107 aa  61.2  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00180393  normal  0.0527176 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  39.22 
 
 
105 aa  61.2  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0767  50S ribosomal protein L24  42.42 
 
 
105 aa  61.2  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0158392  normal  0.0806837 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1856  50S ribosomal protein L24  44.66 
 
 
115 aa  61.2  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.368803  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  39.39 
 
 
106 aa  60.8  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2914  50S ribosomal protein L24  41 
 
 
116 aa  60.8  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1626  ribosomal protein L24  41.75 
 
 
112 aa  60.8  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0342  50S ribosomal protein L24  39.77 
 
 
105 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  42 
 
 
103 aa  60.8  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  42.42 
 
 
112 aa  60.5  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1375  50S ribosomal protein L24  46.08 
 
 
104 aa  60.5  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  39 
 
 
107 aa  60.5  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2153  50S ribosomal protein L24  45.54 
 
 
104 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  42.72 
 
 
106 aa  60.5  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1033  50S ribosomal protein L24  36 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000385068  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2635  50S ribosomal protein L24  38.38 
 
 
101 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253933  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3168  50S ribosomal protein L24  44.44 
 
 
102 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000000400105  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2207  50S ribosomal protein L24  43.56 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0090  50S ribosomal protein L24  40.59 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0661954 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2896  ribosomal protein L24  38.14 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2313  50S ribosomal protein L24  40.59 
 
 
105 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.103377  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2964  50S ribosomal protein L24  44.25 
 
 
119 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00916066  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  38.14 
 
 
106 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0486  50S ribosomal protein L24  41 
 
 
106 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000769902  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1556  50S ribosomal protein L24  44 
 
 
104 aa  58.2  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0638  ribosomal protein L24  41.28 
 
 
113 aa  58.2  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3306  50S ribosomal protein L24  43.56 
 
 
102 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000014944  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5135  ribosomal protein L24  41.41 
 
 
101 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.403421 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2361  50S ribosomal protein L24  36.73 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.449778  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0508  50S ribosomal protein L24  39 
 
 
106 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.000000000313767 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  38.38 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2190  50S ribosomal protein L24  41.58 
 
 
104 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2468  50S ribosomal protein L24  41.58 
 
 
104 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167187  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0338  50S ribosomal protein L24  39 
 
 
106 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.530632  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0384  50S ribosomal protein L24  40.59 
 
 
106 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000110242  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  38.78 
 
 
106 aa  57.8  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4354  ribosomal protein L24  40 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000283369  normal  0.0433971 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2763  50S ribosomal protein L24  40 
 
 
109 aa  57.8  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154774  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0392  50S ribosomal protein L24  40.59 
 
 
106 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0277402  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0500  50S ribosomal protein L24  35.35 
 
 
105 aa  57.4  0.00000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000146538  decreased coverage  0.00101346 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2306  50S ribosomal protein L24  42 
 
 
104 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0131397  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  41.24 
 
 
112 aa  57.4  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>