More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0041 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0041  aminotransferase class V  100 
 
 
389 aa  804  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1092  Cysteine desulfurase  74.87 
 
 
388 aa  612  1e-174  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1063  aminotransferase class V  74.87 
 
 
388 aa  610  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  74.74 
 
 
388 aa  605  1e-172  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3449  cysteine desulfurase  71.54 
 
 
389 aa  588  1e-167  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  69.9 
 
 
389 aa  569  1e-161  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  69.19 
 
 
399 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  57.74 
 
 
417 aa  454  1e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2558  cysteine desulfurase NifS  58.44 
 
 
388 aa  452  1e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.947611  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  54.97 
 
 
405 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  53.93 
 
 
403 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  54.19 
 
 
403 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  54.19 
 
 
436 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  54.88 
 
 
405 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  54.19 
 
 
436 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  54.62 
 
 
407 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  54.88 
 
 
407 aa  425  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0410  cysteine desulfurase  54.88 
 
 
422 aa  422  1e-117  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  54.62 
 
 
407 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  54.88 
 
 
407 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  54.88 
 
 
403 aa  422  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  54.76 
 
 
407 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  54.5 
 
 
407 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  53.83 
 
 
406 aa  418  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  54.62 
 
 
407 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  54.62 
 
 
407 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  54.76 
 
 
407 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  54.62 
 
 
407 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  54.62 
 
 
407 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  55.12 
 
 
507 aa  420  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  55.03 
 
 
407 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  55.03 
 
 
407 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  55.03 
 
 
407 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  54.5 
 
 
407 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  53.83 
 
 
405 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  53.83 
 
 
405 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  54.09 
 
 
405 aa  421  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  54.62 
 
 
407 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0808  cysteine desulfurase IscS  54.86 
 
 
405 aa  416  1e-115  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  7.72731e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  53.35 
 
 
395 aa  417  1e-115  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1487  cysteine desulfurase IscS  53.52 
 
 
406 aa  416  1e-115  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000124631  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0629  cysteine desulfurase  54.88 
 
 
410 aa  417  1e-115  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  53.83 
 
 
407 aa  417  1e-115  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  53.83 
 
 
407 aa  415  1e-115  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  54.74 
 
 
407 aa  415  1e-115  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  54.62 
 
 
405 aa  418  1e-115  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  55.26 
 
 
408 aa  415  1e-115  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  54.74 
 
 
421 aa  415  1e-115  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  56.52 
 
 
403 aa  416  1e-115  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  55.15 
 
 
403 aa  414  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  8.59331e-07 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2262  cysteine desulfurase  55.77 
 
 
406 aa  411  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2317  cysteine desulfurase  53.4 
 
 
404 aa  413  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.459864  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1132  cysteine desulfurase  54.35 
 
 
404 aa  412  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2059  cysteine desulfurase IscS  53.4 
 
 
407 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0733618  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  53.4 
 
 
405 aa  412  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01356  cysteine desulfurase  54.79 
 
 
388 aa  414  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.350506  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2178  cysteine desulfurase IscS  53.7 
 
 
405 aa  414  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000963732  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1950  cysteine desulfurase IscS  55.04 
 
 
405 aa  414  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  8.43977e-09  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_002978  WD0997  cysteine desulfurase  52.89 
 
 
415 aa  409  1e-113  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2177  cysteine desulfurase IscS  53.17 
 
 
430 aa  410  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0830  cysteine desulfurase IscS  53.14 
 
 
407 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.184128 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1351  aminotransferase class V  53.02 
 
 
384 aa  405  1e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  5.67164e-12 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1776  cysteine desulfurase  53 
 
 
404 aa  406  1e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.743071  hitchhiker  4.39392e-05 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0281  cysteine desulfurase  52.48 
 
 
404 aa  407  1e-112  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.910551  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0717  cysteine desulfurase  51.7 
 
 
406 aa  405  1e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1638  cysteine desulfurase IscS  53.44 
 
 
406 aa  405  1e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2264  cysteine desulfurase  52.62 
 
 
404 aa  402  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  52.74 
 
 
404 aa  404  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2144  cysteine desulfurase IscS  53.17 
 
 
406 aa  402  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124025 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1458  cysteine desulfurase  51.83 
 
 
404 aa  404  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2373  cysteine desulfurase IscS  52.91 
 
 
406 aa  404  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.934758  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2142  cysteine desulfurase IscS  53.17 
 
 
406 aa  403  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1047  cysteine desulfurase IscS  52.65 
 
 
411 aa  402  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2871  cysteine desulfurase  52.36 
 
 
404 aa  400  1e-110  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  3.28828e-08 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1488  cysteine desulfurase  52.09 
 
 
404 aa  400  1e-110  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.645778  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2443  cysteine desulfurase IscS  53.17 
 
 
406 aa  401  1e-110  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  51.96 
 
 
404 aa  398  1e-110  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1164  cysteine desulfurase IscS  55.19 
 
 
402 aa  400  1e-110  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000196201  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85588  predicted protein  52.76 
 
 
493 aa  399  1e-110  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.464986  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  52.09 
 
 
404 aa  399  1e-110  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3027  cysteine desulfurase  51.7 
 
 
404 aa  398  1e-110  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0576674  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1238  cysteine desulfurase IscS  52.22 
 
 
407 aa  401  1e-110  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.01856  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1293  cysteine desulfurase  52.62 
 
 
404 aa  398  1e-110  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0405061 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3999  cysteine desulfurase IscS  53.7 
 
 
406 aa  401  1e-110  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102036  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  51.96 
 
 
404 aa  400  1e-110  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  51.96 
 
 
404 aa  400  1e-110  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  51.96 
 
 
404 aa  400  1e-110  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  51.96 
 
 
404 aa  400  1e-110  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  51.96 
 
 
404 aa  400  1e-110  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  51.44 
 
 
404 aa  400  1e-110  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05560  cysteine desulfhydrase, putative  52.97 
 
 
502 aa  398  1e-110  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0637  cysteine desulfurase  52.43 
 
 
404 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.273964 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0247  cysteine desulfurase  53.68 
 
 
403 aa  397  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  52.22 
 
 
404 aa  397  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  51.7 
 
 
404 aa  395  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1493  cysteine desulfurase IscS  51.59 
 
 
419 aa  397  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  51.7 
 
 
404 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2280  cysteine desulfurase  52.36 
 
 
404 aa  396  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0344556  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2424  cysteine desulfurase  51.31 
 
 
404 aa  396  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  51.7 
 
 
404 aa  395  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>