More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_44070 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3765  type II citrate synthase  89.25 
 
 
429 aa  818  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0679988  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0106  citrate synthase I  69.86 
 
 
426 aa  639  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0638  type II citrate synthase  69.98 
 
 
427 aa  654  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1212  citrate synthase  73.07 
 
 
428 aa  681  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  1.71793e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01350  type II citrate synthase  72.43 
 
 
429 aa  681  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2189  type II citrate synthase  71.73 
 
 
445 aa  648  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00268971  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2513  type II citrate synthase  71.96 
 
 
428 aa  645  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.56312e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2111  citrate synthase  74.13 
 
 
454 aa  687  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000226419  normal  0.855626 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2520  type II citrate synthase  71.96 
 
 
428 aa  645  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0560239  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0790  type II citrate synthase  69.48 
 
 
427 aa  652  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.148883  normal  0.115118 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0854  type II citrate synthase  69.48 
 
 
427 aa  652  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  5.51297e-05 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2886  type II citrate synthase  69.74 
 
 
426 aa  647  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.5086e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1600  citrate synthase  71.98 
 
 
433 aa  634  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0887  type II citrate synthase  69.48 
 
 
427 aa  652  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.304459 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0764  type II citrate synthase  69.48 
 
 
427 aa  652  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0825  type II citrate synthase  69.48 
 
 
427 aa  652  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0841  type II citrate synthase  71.96 
 
 
429 aa  674  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0768  type II citrate synthase  69.98 
 
 
427 aa  654  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0747  type II citrate synthase  69.98 
 
 
427 aa  654  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2973  type II citrate synthase  69.74 
 
 
426 aa  647  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00618343  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2935  type II citrate synthase  69.98 
 
 
427 aa  654  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115815  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0732  type II citrate synthase  69.98 
 
 
427 aa  654  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.482725  normal  0.945982 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1705  type II citrate synthase  71.26 
 
 
428 aa  643  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.668035 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3517  type II citrate synthase  88.79 
 
 
429 aa  812  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2257  citrate synthase I  68.22 
 
 
431 aa  642  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.19804  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1379  type II citrate synthase  69.74 
 
 
426 aa  647  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.15607e-07  normal  0.279105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44070  type II citrate synthase  100 
 
 
428 aa  898  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1149  citrate synthase I  74.88 
 
 
424 aa  680  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2348  type II citrate synthase  70.09 
 
 
428 aa  636  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.729565  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1705  type II citrate synthase  71.26 
 
 
428 aa  643  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00232802  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1630  type II citrate synthase  71.26 
 
 
428 aa  642  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.01465  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1678  type II citrate synthase  71.5 
 
 
431 aa  674  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0407476  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2633  type II citrate synthase  71.96 
 
 
428 aa  645  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000579193  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1422  type II citrate synthase  72.2 
 
 
428 aa  669  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  6.89188e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1262  type II citrate synthase  69.88 
 
 
430 aa  646  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.728692  normal  0.31118 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0810  type II citrate synthase  69.98 
 
 
427 aa  654  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.659455  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  71.73 
 
 
432 aa  638  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2274  type II citrate synthase  71.5 
 
 
428 aa  645  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  3.58341e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2508  type II citrate synthase  90.65 
 
 
436 aa  823  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.636436  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3105  type II citrate synthase  71.16 
 
 
428 aa  659  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.510334  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2194  citrate synthase I  89.25 
 
 
429 aa  818  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1231  type II citrate synthase  71.39 
 
 
428 aa  660  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00669  hypothetical protein  69.98 
 
 
427 aa  654  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2214  citrate synthase I  68.69 
 
 
428 aa  640  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.525644  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0097  citrate synthase  69.86 
 
 
426 aa  637  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0802276  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2004  type II citrate synthase  88.79 
 
 
429 aa  816  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719341  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1139  type II citrate synthase  71.7 
 
 
428 aa  668  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1926  type II citrate synthase  71.03 
 
 
428 aa  641  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  89.46 
 
 
427 aa  820  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4194  type II citrate synthase  89.25 
 
 
429 aa  818  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0867349  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1221  type II citrate synthase  69.27 
 
 
427 aa  650  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233861  normal  0.0870629 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2805  citrate synthase I  74.7 
 
 
427 aa  685  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359876  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1609  type II citrate synthase  90.19 
 
 
429 aa  823  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.706948  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2919  type II citrate synthase  72.45 
 
 
428 aa  664  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2916  citrate synthase I  69.98 
 
 
427 aa  654  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349648  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1831  type II citrate synthase  71.96 
 
 
428 aa  645  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  1.79965e-06  normal  0.249033 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0260  citrate synthase I  70.79 
 
 
426 aa  643  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.419168  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1660  type II citrate synthase  89.02 
 
 
429 aa  815  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004117  citrate synthase (si)  72.43 
 
 
429 aa  680  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00680  citrate synthase  69.98 
 
 
427 aa  654  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3694  type II citrate synthase  99.3 
 
 
428 aa  893  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2819  type II citrate synthase  70.33 
 
 
428 aa  631  1e-180  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0484944  normal  0.528181 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1832  type II citrate synthase  71.33 
 
 
430 aa  630  1e-179  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0111193  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2545  citrate synthase I  68.93 
 
 
431 aa  630  1e-179  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1646  type II citrate synthase  68.84 
 
 
429 aa  629  1e-179  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0982845  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2032  citrate synthase  69 
 
 
428 aa  630  1e-179  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808291  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01870  Citrate synthase  67.84 
 
 
425 aa  629  1e-179  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0061  citrate synthase  67.06 
 
 
430 aa  625  1e-178  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0890712  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6851  type II citrate synthase  67.44 
 
 
433 aa  625  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.622921 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1794  citrate synthase I  68.24 
 
 
426 aa  627  1e-178  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  8.80013e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1783  type II citrate synthase  69.63 
 
 
429 aa  626  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0004224  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2890  type II citrate synthase  67.67 
 
 
433 aa  626  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  67.37 
 
 
438 aa  624  1e-177  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1148  type II citrate synthase  68.14 
 
 
430 aa  623  1e-177  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4366  type II citrate synthase  66.98 
 
 
433 aa  621  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2798  type II citrate synthase  69.12 
 
 
436 aa  621  1e-177  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.242965 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2320  type II citrate synthase  67.91 
 
 
433 aa  622  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1650  type II citrate synthase  69.63 
 
 
428 aa  622  1e-177  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  4.81967e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1106  type II citrate synthase  68.14 
 
 
435 aa  624  1e-177  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2860  citrate synthase  68.53 
 
 
432 aa  622  1e-177  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2481  type II citrate synthase  67.91 
 
 
433 aa  623  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523496  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1366  citrate synthase  68.17 
 
 
423 aa  623  1e-177  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1370  citrate synthase  67.93 
 
 
423 aa  621  1e-177  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2288  type II citrate synthase  69.12 
 
 
436 aa  621  1e-177  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  67.91 
 
 
430 aa  621  1e-177  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2467  type II citrate synthase  67.21 
 
 
433 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00536833  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1626  type II citrate synthase  67.21 
 
 
433 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00616613  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0504  type II citrate synthase  67.21 
 
 
433 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405584  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1834  type II citrate synthase  67.21 
 
 
433 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3212  citrate synthase  68.42 
 
 
427 aa  619  1e-176  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4425  citrate synthase I  67.84 
 
 
436 aa  620  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224643  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4643  type II citrate synthase  67.44 
 
 
433 aa  618  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  67.21 
 
 
433 aa  619  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  67.21 
 
 
433 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2329  type II citrate synthase  67.21 
 
 
433 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1132  citrate synthase  68.62 
 
 
431 aa  618  1e-176  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6352  type II citrate synthase  69.25 
 
 
433 aa  618  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0645718  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1744  type II citrate synthase  67.21 
 
 
433 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.676143  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1596  type II citrate synthase  68.37 
 
 
429 aa  619  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218131  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2147  type II citrate synthase  66.98 
 
 
433 aa  616  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787035  normal  0.703076 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>