75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_13390 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_13390  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  252  9e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.694836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0093  hypothetical protein  71.03 
 
 		 481 aa  147  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5430  hypothetical protein  65.09 
 
 		 174 aa  134  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5592  PAAR  69.07 
 
 		 469 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53640  hypothetical protein  67.03 
 
 		 172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232155  hitchhiker  0.000303708 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3189  PAAR  47.66 
 
 		 179 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000563624  normal  0.0101045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3806  PAAR  57.28 
 
 		 165 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4633  hypothetical protein  46.88 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.53967  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3817  PAAR  58.43 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153298  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4551  PAAR repeat-containing protein  54.37 
 
 		 185 aa  100  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4128  PAAR  63.11 
 
 		 164 aa  99  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0685  PAAR  43.01 
 
 		 379 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3756  hypothetical protein  41.46 
 
 		 386 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.136459  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3827  PAAR repeat-containing protein  44.12 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1878  hypothetical protein  44.12 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0199793  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0943  hypothetical protein  44.12 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00127142  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01943  hypothetical protein  55.56 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.309937 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4801  hypothetical protein  51.92 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0636786  normal  0.750355 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000030  hypothetical protein  44.79 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1832  hypothetical protein  47.06 
 
 		 118 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2301  PAAR repeat-containing protein  50.98 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360683  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5509  hypothetical protein  50 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3775  helix-turn-helix, AraC type  38.38 
 
 		 540 aa  50.4  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2190  PAAR  50.91 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0699  PAAR repeat-containing protein  35.77 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2512  PAAR repeat-containing protein  42.72 
 
 		 461 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0056  PAAR repeat-containing protein  51.92 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  46.15 
 
 		 86 aa  48.9  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  38.04 
 
 		 466 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3928  PAAR repeat-containing protein  43.88 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00719724  normal  0.0225395 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3002  PAAR  40.62 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3115  PAAR repeat-containing protein  33.72 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  34.4 
 
 		 592 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3238  PAAR repeat-containing protein  33.72 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.198697  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2610  hypothetical protein  33.72 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408788  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1157  PAAR repeat-containing protein  41.43 
 
 		 100 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2824  PAAR repeat-containing protein  34.31 
 
 		 456 aa  44.7  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2854  hypothetical protein  37.65 
 
 		 85 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.561027  normal  0.0963885 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0130  PAAR motif-containing protein  40.74 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0103  PAAR motif-containing protein  40.74 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3156  PAAR repeat-containing protein  38.95 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0203  PAAR motif-containing protein  40.74 
 
 		 87 aa  43.9  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00559285  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0675  PAAR repeat-containing protein  42.71 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1693  PAAR motif-containing protein  40.74 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1612  PAAR motif-containing protein  40.74 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  32.12 
 
 		 855 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0316  hypothetical protein  39.39 
 
 		 453 aa  43.9  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1586  PAAR motif-containing protein  40.74 
 
 		 87 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5249  PAAR repeat-containing protein  41.05 
 
 		 96 aa  43.5  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000530651 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2358  PAAR repeat-containing protein  40.62 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4114  PAAR repeat-containing protein  41.3 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916002  hitchhiker  0.00152888 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2461  hypothetical protein  38.54 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3237  PAAR repeat-containing protein  37.25 
 
 		 456 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3018  PAAR repeat-containing protein  40.66 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.820198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6683  PAAR repeat-containing protein  39.56 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0657  PAAR motif-containing protein  43.64 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1603  PAAR motif-containing protein  43.64 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1577  PAAR motif-containing protein  43.64 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18435  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0500  hypothetical protein  43.64 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.714041  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1375  PAAR motif-containing protein  43.64 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.573546  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2255  hypothetical protein  45.28 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  43.94 
 
 		 1530 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4969  PAAR  41.82 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2706  PAAR motif-containing protein  43.64 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61171  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1765  PAAR motif-containing protein  43.64 
 
 		 88 aa  42  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.847105  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2662  PAAR repeat-containing protein  35.96 
 
 		 323 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4045  hypothetical protein  35.8 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3671  hypothetical protein  53.7 
 
 		 176 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7616  hypothetical protein  41.82 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0092  PAAR motif-containing protein  38.89 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0098  PAAR motif-containing protein  38.89 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.314734  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0119  hypothetical protein  52.73 
 
 		 175 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.435332  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3228  PAAR motif-containing protein  38.89 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3229  PAAR repeat-containing protein  50 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5205  PAAR repeat-containing protein  42 
 
 		 85 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000429039  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>