68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_00550 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0047  hypothetical protein  95.3 
 
 
417 aa  666  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00550  hypothetical protein  100 
 
 
469 aa  893  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0250309  normal  0.0752819 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35240  hypothetical protein  66.75 
 
 
419 aa  427  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000669836  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1783  hypothetical protein  57.89 
 
 
420 aa  400  1e-110  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00695684  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0595  membrane protein  45.86 
 
 
425 aa  302  7e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0164312  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1587  hypothetical protein  44.22 
 
 
418 aa  280  5e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2513  membrane protein  43.99 
 
 
424 aa  272  9e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196056  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2575  hypothetical protein  47.18 
 
 
418 aa  266  6e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.612396  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1067  hypothetical protein  41.69 
 
 
420 aa  261  2e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2103  membrane protein  41.48 
 
 
437 aa  261  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0542  membrane protein  41.1 
 
 
441 aa  243  7e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215324 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002966  hypothetical protein  38.73 
 
 
425 aa  236  8e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1183  membrane protein-like protein  41.33 
 
 
433 aa  215  1e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.647049 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1479  membrane protein-like protein  38.78 
 
 
414 aa  210  6e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0309813  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2187  membrane protein-like protein  37.32 
 
 
426 aa  209  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.946223  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2904  hypothetical protein  36.04 
 
 
420 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157069  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2707  membrane protein-like protein  37.19 
 
 
426 aa  204  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0954887  normal  0.849841 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1182  membrane protein-like  40.79 
 
 
433 aa  204  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2305  hypothetical protein  41.36 
 
 
427 aa  200  4e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0242022  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1984  membrane protein  36.34 
 
 
420 aa  199  1e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192525  normal  0.0203513 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1901  membrane protein  39.49 
 
 
413 aa  198  2e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2132  hypothetical protein  36.1 
 
 
423 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.524155  decreased coverage  3.26066e-05 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4823  membrane protein  39.14 
 
 
423 aa  193  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2082  hypothetical protein  32.94 
 
 
448 aa  186  1e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.184363  normal  0.255559 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0813  hypothetical protein  35.42 
 
 
426 aa  186  1e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1972  MgtC/SapB transporter  34.78 
 
 
418 aa  181  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.315083 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1487  hypothetical protein  33.77 
 
 
411 aa  176  7e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0192315  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2446  hypothetical protein  38.14 
 
 
416 aa  167  3e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385923  normal  0.422644 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1155  MgtC/SapB transporter  29.41 
 
 
414 aa  166  1e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5131  hypothetical protein  37.22 
 
 
417 aa  165  2e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285021  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4750  hypothetical protein  35.43 
 
 
416 aa  160  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.237655  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2260  hypothetical protein  35.35 
 
 
418 aa  158  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3027  hypothetical protein  33.51 
 
 
452 aa  158  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.678379  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2212  membrane protein  32.28 
 
 
423 aa  149  1e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.469144  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0922  MgtC family protein  36.19 
 
 
427 aa  148  2e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.500077  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6201  hypothetical protein  41.1 
 
 
236 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0922  putative transmembrane protein  33.74 
 
 
403 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.546528  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1979  membrane protein  33.25 
 
 
418 aa  147  5e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.192986  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0808  hypothetical protein  37.66 
 
 
400 aa  145  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.810338  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0559  hypothetical protein  34.91 
 
 
420 aa  137  3e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3343  transmembrane protein  31.04 
 
 
416 aa  127  4e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2472  membrane protein-like protein  34.51 
 
 
412 aa  122  2e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.595236  normal  0.992981 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1126  hypothetical protein  33.09 
 
 
429 aa  121  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341163  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0897  MgtC/SapB transporter  29.35 
 
 
415 aa  120  7e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.615418 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1799  putative transmembrane protein  35.12 
 
 
417 aa  115  2e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.37939  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1818  putative transmembrane protein  34.78 
 
 
417 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1865  putative transmembrane protein  34.78 
 
 
417 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0998873  normal  0.757995 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1692  hypothetical protein  30.3 
 
 
439 aa  112  1e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2073  hypothetical protein  27.03 
 
 
435 aa  111  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0254302  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4934  magnesium transporter accessory protein  28.28 
 
 
428 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.936542  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3227  hypothetical protein  27.91 
 
 
410 aa  109  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0623753  normal  0.0334284 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4569  membrane protein-like protein  32.46 
 
 
481 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0206067  normal  0.209557 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4436  membrane protein-like protein  32.46 
 
 
481 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1241  membrane protein-like protein  31.44 
 
 
428 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1172  putative transmembrane protein  32.91 
 
 
414 aa  102  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0696977 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1097  hypothetical protein  31.87 
 
 
426 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122525  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2978  MgtC/SapB transporter  29.76 
 
 
439 aa  100  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0183  membrane protein-like protein  28.95 
 
 
471 aa  101  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.343877  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2208  magnesium transporter accessory protein  30.55 
 
 
422 aa  97.4  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  0.18363 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0182  hypothetical protein  34.32 
 
 
374 aa  95.9  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0642458 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0333  magnesium transporter accessory protein  25.78 
 
 
437 aa  94.4  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.806096  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0453  hypothetical protein  26.08 
 
 
424 aa  90.5  6e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.281099 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3492  putative transmembrane protein  30.66 
 
 
414 aa  82.4  2e-14  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0708011  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1092  hypothetical protein  26.87 
 
 
419 aa  81.3  3e-14  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.160606  normal  0.0424364 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0484  hypothetical protein  35.1 
 
 
419 aa  80.1  7e-14  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40682  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3710  hypothetical protein  35.1 
 
 
419 aa  80.5  7e-14  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.387372 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0779  hypothetical protein  27.24 
 
 
378 aa  72.4  2e-11  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3663  hypothetical protein  30.42 
 
 
324 aa  67  7e-10  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0504521  hitchhiker  1.27877e-05 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>