62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0779 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0779  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  756    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0453  hypothetical protein  32.74 
 
 		 424 aa  174  1.9999999999999998e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.281099 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1097  hypothetical protein  35.16 
 
 		 426 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122525  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0183  membrane protein-like protein  31.2 
 
 		 471 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.343877  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1241  membrane protein-like protein  36.45 
 
 		 428 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1182  membrane protein-like  29.93 
 
 		 433 aa  106  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2082  hypothetical protein  28.83 
 
 		 448 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.184363  normal  0.255559 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0595  membrane protein  27.44 
 
 		 425 aa  101  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0164312  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1183  membrane protein-like protein  30.86 
 
 		 433 aa  98.2  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.647049 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1972  MgtC/SapB transporter  28.31 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.315083 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2513  membrane protein  27.53 
 
 		 424 aa  95.1  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196056  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2707  membrane protein-like protein  27.92 
 
 		 426 aa  92  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0954887  normal  0.849841 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1479  membrane protein-like protein  29.39 
 
 		 414 aa  91.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0309813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1818  putative transmembrane protein  31.84 
 
 		 417 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1865  putative transmembrane protein  31.84 
 
 		 417 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0998873  normal  0.757995 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2187  membrane protein-like protein  27.57 
 
 		 426 aa  90.1  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.946223  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1799  putative transmembrane protein  31.84 
 
 		 417 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.37939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2132  hypothetical protein  29.68 
 
 		 423 aa  89.7  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.524155  decreased coverage  0.0000326066 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1067  hypothetical protein  27.88 
 
 		 420 aa  89.4  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2575  hypothetical protein  27.13 
 
 		 418 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.612396  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0813  hypothetical protein  29.55 
 
 		 426 aa  88.6  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3227  hypothetical protein  25.22 
 
 		 410 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0623753  normal  0.0334284 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2305  hypothetical protein  30.24 
 
 		 427 aa  87.8  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0242022  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1587  hypothetical protein  26.49 
 
 		 418 aa  87.8  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1155  MgtC/SapB transporter  24.01 
 
 		 414 aa  86.3  9e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4934  magnesium transporter accessory protein  26.84 
 
 		 428 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.936542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1901  membrane protein  28.9 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1487  hypothetical protein  27.04 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0192315  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0559  hypothetical protein  28.71 
 
 		 420 aa  83.6  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2103  membrane protein  24.85 
 
 		 437 aa  83.6  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002966  hypothetical protein  22.99 
 
 		 425 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4823  membrane protein  24.7 
 
 		 423 aa  80.9  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1783  hypothetical protein  28.57 
 
 		 420 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00695684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0047  hypothetical protein  28.9 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3027  hypothetical protein  26.73 
 
 		 452 aa  76.3  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.678379  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0922  putative transmembrane protein  30.39 
 
 		 403 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.546528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4750  hypothetical protein  28.64 
 
 		 416 aa  75.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.237655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6201  hypothetical protein  29.52 
 
 		 236 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0542  membrane protein  21.95 
 
 		 441 aa  74.7  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215324 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0922  MgtC family protein  29.57 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.500077  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0333  magnesium transporter accessory protein  26.47 
 
 		 437 aa  69.3  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.806096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0897  MgtC/SapB transporter  26.32 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.615418 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2073  hypothetical protein  26.78 
 
 		 435 aa  67  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0254302  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2904  hypothetical protein  22.99 
 
 		 420 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157069  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00550  hypothetical protein  27.27 
 
 		 469 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0250309  normal  0.0752819 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1692  hypothetical protein  26.38 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2260  hypothetical protein  26.32 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1984  membrane protein  24.4 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192525  normal  0.0203513 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0808  hypothetical protein  27.6 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.810338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1979  membrane protein  25.31 
 
 		 418 aa  59.7  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.192986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2212  membrane protein  25.81 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.469144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2472  membrane protein-like protein  27.44 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.595236  normal  0.992981 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3343  transmembrane protein  25.97 
 
 		 416 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1126  hypothetical protein  28.19 
 
 		 429 aa  54.3  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35240  hypothetical protein  27.6 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000669836  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1172  putative transmembrane protein  28.57 
 
 		 414 aa  51.6  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0696977 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2978  MgtC/SapB transporter  27.91 
 
 		 439 aa  51.6  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2208  magnesium transporter accessory protein  28 
 
 		 422 aa  50.4  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  0.18363 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5131  hypothetical protein  24.48 
 
 		 417 aa  50.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285021  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3492  putative transmembrane protein  30.12 
 
 		 414 aa  47.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0708011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3663  hypothetical protein  32.47 
 
 		 324 aa  43.5  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0504521  hitchhiker  0.0000127877 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2446  hypothetical protein  27.71 
 
 		 416 aa  43.1  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385923  normal  0.422644 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>