68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2575 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2575  hypothetical protein  100 
 
 		 418 aa  811    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.612396  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1067  hypothetical protein  50.24 
 
 		 420 aa  369  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2513  membrane protein  47.95 
 
 		 424 aa  333  4e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196056  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0595  membrane protein  46.73 
 
 		 425 aa  332  1e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0164312  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0542  membrane protein  49.11 
 
 		 441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215324 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2103  membrane protein  45.41 
 
 		 437 aa  321  9.999999999999999e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1587  hypothetical protein  45.43 
 
 		 418 aa  319  6e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002966  hypothetical protein  46.29 
 
 		 425 aa  315  8e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0047  hypothetical protein  47.15 
 
 		 417 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00550  hypothetical protein  47.41 
 
 		 469 aa  272  7e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0250309  normal  0.0752819 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1783  hypothetical protein  45.36 
 
 		 420 aa  264  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00695684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1183  membrane protein-like protein  44.72 
 
 		 433 aa  258  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.647049 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35240  hypothetical protein  47.94 
 
 		 419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000669836  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2187  membrane protein-like protein  41.19 
 
 		 426 aa  246  6.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.946223  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1479  membrane protein-like protein  40.55 
 
 		 414 aa  245  9e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0309813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2707  membrane protein-like protein  41.13 
 
 		 426 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0954887  normal  0.849841 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1182  membrane protein-like  43.12 
 
 		 433 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4823  membrane protein  39.29 
 
 		 423 aa  234  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2904  hypothetical protein  35.84 
 
 		 420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157069  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1901  membrane protein  40.41 
 
 		 413 aa  216  5e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4750  hypothetical protein  41.36 
 
 		 416 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.237655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1984  membrane protein  35.29 
 
 		 420 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192525  normal  0.0203513 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2305  hypothetical protein  38.55 
 
 		 427 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0242022  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0813  hypothetical protein  33.75 
 
 		 426 aa  201  3e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1972  MgtC/SapB transporter  35.28 
 
 		 418 aa  199  6e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.315083 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3027  hypothetical protein  36.94 
 
 		 452 aa  194  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.678379  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2132  hypothetical protein  35.42 
 
 		 423 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.524155  decreased coverage  0.0000326066 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2082  hypothetical protein  35.06 
 
 		 448 aa  189  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.184363  normal  0.255559 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2446  hypothetical protein  38.71 
 
 		 416 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385923  normal  0.422644 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6201  hypothetical protein  48.25 
 
 		 236 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0559  hypothetical protein  38.52 
 
 		 420 aa  184  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1155  MgtC/SapB transporter  32.99 
 
 		 414 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2260  hypothetical protein  37.8 
 
 		 418 aa  180  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0922  MgtC family protein  37.87 
 
 		 427 aa  176  5e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.500077  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1487  hypothetical protein  35.54 
 
 		 411 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0192315  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5131  hypothetical protein  37.6 
 
 		 417 aa  171  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285021  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0808  hypothetical protein  35.53 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.810338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1979  membrane protein  34.19 
 
 		 418 aa  158  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.192986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2212  membrane protein  33.69 
 
 		 423 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.469144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0897  MgtC/SapB transporter  29.87 
 
 		 415 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.615418 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0922  putative transmembrane protein  32.92 
 
 		 403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.546528  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0453  hypothetical protein  27.97 
 
 		 424 aa  140  6e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.281099 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1692  hypothetical protein  33.16 
 
 		 439 aa  136  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2978  MgtC/SapB transporter  31.28 
 
 		 439 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1126  hypothetical protein  31.31 
 
 		 429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1241  membrane protein-like protein  33.24 
 
 		 428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3343  transmembrane protein  30.92 
 
 		 416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2208  magnesium transporter accessory protein  31.44 
 
 		 422 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  0.18363 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0333  magnesium transporter accessory protein  28.73 
 
 		 437 aa  120  6e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.806096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1097  hypothetical protein  31.45 
 
 		 426 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122525  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2472  membrane protein-like protein  31.38 
 
 		 412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.595236  normal  0.992981 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3227  hypothetical protein  25.07 
 
 		 410 aa  110  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0623753  normal  0.0334284 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4934  magnesium transporter accessory protein  28.45 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.936542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0183  membrane protein-like protein  28.2 
 
 		 471 aa  108  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.343877  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1799  putative transmembrane protein  32.7 
 
 		 417 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.37939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1818  putative transmembrane protein  32.39 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1865  putative transmembrane protein  32.39 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0998873  normal  0.757995 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2073  hypothetical protein  27.6 
 
 		 435 aa  103  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0254302  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4436  membrane protein-like protein  30.46 
 
 		 481 aa  97.1  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4569  membrane protein-like protein  30.46 
 
 		 481 aa  97.1  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0206067  normal  0.209557 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1172  putative transmembrane protein  31.5 
 
 		 414 aa  93.6  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0696977 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0779  hypothetical protein  26.6 
 
 		 378 aa  89.4  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3492  putative transmembrane protein  28.82 
 
 		 414 aa  87  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0708011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1092  hypothetical protein  30.38 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.160606  normal  0.0424364 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3710  hypothetical protein  31.02 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.387372 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0484  hypothetical protein  30.21 
 
 		 419 aa  73.2  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40682  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3663  hypothetical protein  28.29 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0504521  hitchhiker  0.0000127877 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0182  hypothetical protein  29.07 
 
 		 374 aa  62  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0642458 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>