68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2082 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2082  hypothetical protein  100 
 
 		 448 aa  875    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.184363  normal  0.255559 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1587  hypothetical protein  36.5 
 
 		 418 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2103  membrane protein  35.22 
 
 		 437 aa  206  9e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2132  hypothetical protein  36.48 
 
 		 423 aa  196  7e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.524155  decreased coverage  0.0000326066 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2513  membrane protein  37.07 
 
 		 424 aa  196  7e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196056  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1972  MgtC/SapB transporter  35 
 
 		 418 aa  182  7e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.315083 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0595  membrane protein  35.24 
 
 		 425 aa  182  7e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0164312  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0542  membrane protein  34.1 
 
 		 441 aa  181  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215324 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2575  hypothetical protein  34.8 
 
 		 418 aa  178  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.612396  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1067  hypothetical protein  33.08 
 
 		 420 aa  177  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2904  hypothetical protein  33.66 
 
 		 420 aa  177  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157069  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1155  MgtC/SapB transporter  31.85 
 
 		 414 aa  170  5e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00550  hypothetical protein  35.06 
 
 		 469 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0250309  normal  0.0752819 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002966  hypothetical protein  36.27 
 
 		 425 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1487  hypothetical protein  32.47 
 
 		 411 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0192315  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0047  hypothetical protein  34.63 
 
 		 417 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35240  hypothetical protein  35.75 
 
 		 419 aa  161  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000669836  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2707  membrane protein-like protein  32.08 
 
 		 426 aa  161  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0954887  normal  0.849841 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1479  membrane protein-like protein  34.11 
 
 		 414 aa  159  7e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0309813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2187  membrane protein-like protein  32.08 
 
 		 426 aa  159  9e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.946223  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2305  hypothetical protein  34.19 
 
 		 427 aa  159  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0242022  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0559  hypothetical protein  34.92 
 
 		 420 aa  158  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1984  membrane protein  33.91 
 
 		 420 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192525  normal  0.0203513 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1182  membrane protein-like  33.91 
 
 		 433 aa  157  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2212  membrane protein  32.41 
 
 		 423 aa  151  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.469144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1979  membrane protein  32.32 
 
 		 418 aa  150  5e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.192986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0813  hypothetical protein  33.08 
 
 		 426 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1183  membrane protein-like protein  33.99 
 
 		 433 aa  146  6e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.647049 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1783  hypothetical protein  34.23 
 
 		 420 aa  144  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00695684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0922  MgtC family protein  35.19 
 
 		 427 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.500077  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4823  membrane protein  32.9 
 
 		 423 aa  138  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5131  hypothetical protein  31.52 
 
 		 417 aa  137  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285021  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1901  membrane protein  32.28 
 
 		 413 aa  136  9e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3027  hypothetical protein  33.33 
 
 		 452 aa  134  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.678379  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0808  hypothetical protein  33.5 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.810338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0183  membrane protein-like protein  30.08 
 
 		 471 aa  111  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.343877  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0333  magnesium transporter accessory protein  26.16 
 
 		 437 aa  110  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.806096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0897  MgtC/SapB transporter  26.25 
 
 		 415 aa  107  6e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.615418 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2260  hypothetical protein  30.46 
 
 		 418 aa  107  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1097  hypothetical protein  28.64 
 
 		 426 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122525  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3227  hypothetical protein  26.59 
 
 		 410 aa  101  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0623753  normal  0.0334284 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0922  putative transmembrane protein  29.38 
 
 		 403 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.546528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6201  hypothetical protein  30.71 
 
 		 236 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0779  hypothetical protein  27.44 
 
 		 378 aa  96.7  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0453  hypothetical protein  25.18 
 
 		 424 aa  95.9  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.281099 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4750  hypothetical protein  28.07 
 
 		 416 aa  94.4  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.237655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1818  putative transmembrane protein  32.83 
 
 		 417 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1865  putative transmembrane protein  32.83 
 
 		 417 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0998873  normal  0.757995 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1799  putative transmembrane protein  32.83 
 
 		 417 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.37939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2073  hypothetical protein  25.37 
 
 		 435 aa  93.2  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0254302  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1692  hypothetical protein  26.56 
 
 		 439 aa  93.2  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2208  magnesium transporter accessory protein  29.74 
 
 		 422 aa  92.8  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  0.18363 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2978  MgtC/SapB transporter  27.27 
 
 		 439 aa  90.5  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1172  putative transmembrane protein  38.52 
 
 		 414 aa  89  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0696977 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1241  membrane protein-like protein  31.85 
 
 		 428 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2472  membrane protein-like protein  27.13 
 
 		 412 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.595236  normal  0.992981 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2446  hypothetical protein  28.28 
 
 		 416 aa  83.2  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385923  normal  0.422644 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1126  hypothetical protein  27.72 
 
 		 429 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3343  transmembrane protein  25.66 
 
 		 416 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4934  magnesium transporter accessory protein  23.28 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.936542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4569  membrane protein-like protein  29.7 
 
 		 481 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0206067  normal  0.209557 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4436  membrane protein-like protein  29.7 
 
 		 481 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3663  hypothetical protein  31.93 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0504521  hitchhiker  0.0000127877 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1092  hypothetical protein  24.07 
 
 		 419 aa  57  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.160606  normal  0.0424364 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3492  putative transmembrane protein  25.26 
 
 		 414 aa  55.1  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0708011  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0182  hypothetical protein  32.57 
 
 		 374 aa  55.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0642458 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0484  hypothetical protein  28.09 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40682  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3710  hypothetical protein  28.09 
 
 		 419 aa  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.387372 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>