68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1183 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1183  membrane protein-like protein  100 
 
 		 433 aa  807    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.647049 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1182  membrane protein-like  65.1 
 
 		 433 aa  437  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1479  membrane protein-like protein  56.93 
 
 		 414 aa  381  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0309813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2707  membrane protein-like protein  55.32 
 
 		 426 aa  376  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0954887  normal  0.849841 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2187  membrane protein-like protein  54.57 
 
 		 426 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.946223  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2575  hypothetical protein  44.72 
 
 		 418 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.612396  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6201  hypothetical protein  64.47 
 
 		 236 aa  260  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2103  membrane protein  38.57 
 
 		 437 aa  253  4.0000000000000004e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1067  hypothetical protein  42.43 
 
 		 420 aa  251  1e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0595  membrane protein  40.83 
 
 		 425 aa  245  9e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0164312  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2513  membrane protein  40 
 
 		 424 aa  242  9e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196056  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1587  hypothetical protein  41.1 
 
 		 418 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0542  membrane protein  40.46 
 
 		 441 aa  229  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215324 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0047  hypothetical protein  42.75 
 
 		 417 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00550  hypothetical protein  41.09 
 
 		 469 aa  213  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0250309  normal  0.0752819 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002966  hypothetical protein  35.73 
 
 		 425 aa  203  4e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1783  hypothetical protein  38.9 
 
 		 420 aa  194  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00695684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1972  MgtC/SapB transporter  36.01 
 
 		 418 aa  193  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.315083 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3027  hypothetical protein  38.8 
 
 		 452 aa  186  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.678379  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1901  membrane protein  38.37 
 
 		 413 aa  186  8e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0813  hypothetical protein  37.63 
 
 		 426 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35240  hypothetical protein  42.57 
 
 		 419 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000669836  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2904  hypothetical protein  34.49 
 
 		 420 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157069  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0559  hypothetical protein  40.05 
 
 		 420 aa  176  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4823  membrane protein  36.82 
 
 		 423 aa  173  6.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4750  hypothetical protein  36.09 
 
 		 416 aa  170  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.237655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2082  hypothetical protein  33.73 
 
 		 448 aa  168  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.184363  normal  0.255559 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0922  MgtC family protein  37.59 
 
 		 427 aa  167  4e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.500077  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1984  membrane protein  33.17 
 
 		 420 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192525  normal  0.0203513 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2446  hypothetical protein  38.25 
 
 		 416 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385923  normal  0.422644 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5131  hypothetical protein  38.73 
 
 		 417 aa  157  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285021  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1487  hypothetical protein  31.73 
 
 		 411 aa  156  9e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0192315  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2305  hypothetical protein  35.7 
 
 		 427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0242022  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2212  membrane protein  35.16 
 
 		 423 aa  151  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.469144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0922  putative transmembrane protein  33.25 
 
 		 403 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.546528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2260  hypothetical protein  35.89 
 
 		 418 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1979  membrane protein  34.32 
 
 		 418 aa  146  8.000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.192986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2132  hypothetical protein  32 
 
 		 423 aa  144  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.524155  decreased coverage  0.0000326066 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1155  MgtC/SapB transporter  26.47 
 
 		 414 aa  143  5e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3343  transmembrane protein  34.16 
 
 		 416 aa  136  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0183  membrane protein-like protein  33.78 
 
 		 471 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.343877  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1799  putative transmembrane protein  35.49 
 
 		 417 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.37939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1097  hypothetical protein  34 
 
 		 426 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122525  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1865  putative transmembrane protein  35.23 
 
 		 417 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0998873  normal  0.757995 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1818  putative transmembrane protein  35.23 
 
 		 417 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0897  MgtC/SapB transporter  32.69 
 
 		 415 aa  124  4e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.615418 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0808  hypothetical protein  35.11 
 
 		 400 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.810338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1126  hypothetical protein  33.58 
 
 		 429 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2472  membrane protein-like protein  35.68 
 
 		 412 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.595236  normal  0.992981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1241  membrane protein-like protein  33.42 
 
 		 428 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1692  hypothetical protein  31.03 
 
 		 439 aa  119  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0333  magnesium transporter accessory protein  30.58 
 
 		 437 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.806096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0779  hypothetical protein  29.68 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3227  hypothetical protein  27.73 
 
 		 410 aa  106  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0623753  normal  0.0334284 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4436  membrane protein-like protein  33.42 
 
 		 481 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4569  membrane protein-like protein  33.42 
 
 		 481 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0206067  normal  0.209557 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2073  hypothetical protein  28.84 
 
 		 435 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0254302  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2978  MgtC/SapB transporter  28.27 
 
 		 439 aa  99.4  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0453  hypothetical protein  26.2 
 
 		 424 aa  98.6  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.281099 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2208  magnesium transporter accessory protein  30.27 
 
 		 422 aa  97.4  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  0.18363 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1172  putative transmembrane protein  34.26 
 
 		 414 aa  93.6  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0696977 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4934  magnesium transporter accessory protein  29.29 
 
 		 428 aa  90.9  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.936542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3492  putative transmembrane protein  30.38 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0708011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3663  hypothetical protein  28.9 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0504521  hitchhiker  0.0000127877 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0182  hypothetical protein  31.49 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0642458 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0484  hypothetical protein  30.37 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40682  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3710  hypothetical protein  30.67 
 
 		 419 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.387372 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1092  hypothetical protein  27.44 
 
 		 419 aa  66.2  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.160606  normal  0.0424364 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>