68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2305 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2305  hypothetical protein  100 
 
 
427 aa  806    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0242022  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2132  hypothetical protein  40.62 
 
 
423 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.524155  decreased coverage  0.0000326066 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1587  hypothetical protein  39.14 
 
 
418 aa  229  7e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0813  hypothetical protein  40.91 
 
 
426 aa  209  8e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0047  hypothetical protein  41.88 
 
 
417 aa  203  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1972  MgtC/SapB transporter  34.31 
 
 
418 aa  199  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.315083 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2575  hypothetical protein  37.68 
 
 
418 aa  195  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.612396  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00550  hypothetical protein  40.76 
 
 
469 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0250309  normal  0.0752819 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1155  MgtC/SapB transporter  32.59 
 
 
414 aa  192  1e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2513  membrane protein  37.82 
 
 
424 aa  189  9e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196056  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1783  hypothetical protein  40.62 
 
 
420 aa  188  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00695684  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2082  hypothetical protein  34.19 
 
 
448 aa  183  4.0000000000000006e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.184363  normal  0.255559 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35240  hypothetical protein  40.9 
 
 
419 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000669836  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2103  membrane protein  34.68 
 
 
437 aa  180  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0595  membrane protein  35 
 
 
425 aa  177  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0164312  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1067  hypothetical protein  34.37 
 
 
420 aa  170  5e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0542  membrane protein  34.91 
 
 
441 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215324 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0922  MgtC family protein  36.27 
 
 
427 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.500077  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1487  hypothetical protein  37.37 
 
 
411 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0192315  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002966  hypothetical protein  33.5 
 
 
425 aa  163  6e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5131  hypothetical protein  36.43 
 
 
417 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285021  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1479  membrane protein-like protein  35.64 
 
 
414 aa  159  7e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0309813  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0559  hypothetical protein  35.96 
 
 
420 aa  158  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2707  membrane protein-like protein  36.14 
 
 
426 aa  156  8e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0954887  normal  0.849841 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0897  MgtC/SapB transporter  32.59 
 
 
415 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.615418 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1979  membrane protein  35.29 
 
 
418 aa  154  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.192986  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1183  membrane protein-like protein  35.77 
 
 
433 aa  152  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.647049 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1182  membrane protein-like  33.77 
 
 
433 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2904  hypothetical protein  32.24 
 
 
420 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157069  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2187  membrane protein-like protein  35.06 
 
 
426 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.946223  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1692  hypothetical protein  31.88 
 
 
439 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1984  membrane protein  32.78 
 
 
420 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192525  normal  0.0203513 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1901  membrane protein  37.21 
 
 
413 aa  144  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0808  hypothetical protein  35.44 
 
 
400 aa  143  7e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.810338  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3227  hypothetical protein  28.21 
 
 
410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0623753  normal  0.0334284 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4823  membrane protein  35.94 
 
 
423 aa  140  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0333  magnesium transporter accessory protein  30.5 
 
 
437 aa  139  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.806096  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4750  hypothetical protein  34.38 
 
 
416 aa  136  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.237655  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2978  MgtC/SapB transporter  31.88 
 
 
439 aa  135  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2073  hypothetical protein  28.36 
 
 
435 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0254302  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2212  membrane protein  32.44 
 
 
423 aa  130  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.469144  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3027  hypothetical protein  31.84 
 
 
452 aa  129  9.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.678379  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2472  membrane protein-like protein  32.78 
 
 
412 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.595236  normal  0.992981 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0922  putative transmembrane protein  30 
 
 
403 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.546528  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1126  hypothetical protein  34.75 
 
 
429 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341163  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2260  hypothetical protein  32.69 
 
 
418 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2208  magnesium transporter accessory protein  31.87 
 
 
422 aa  117  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  0.18363 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2446  hypothetical protein  33.25 
 
 
416 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385923  normal  0.422644 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1799  putative transmembrane protein  34.23 
 
 
417 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.37939  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1865  putative transmembrane protein  33.89 
 
 
417 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0998873  normal  0.757995 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1172  putative transmembrane protein  34.76 
 
 
414 aa  110  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0696977 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1818  putative transmembrane protein  33.89 
 
 
417 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3343  transmembrane protein  30.43 
 
 
416 aa  108  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0453  hypothetical protein  27.75 
 
 
424 aa  102  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.281099 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4934  magnesium transporter accessory protein  26.06 
 
 
428 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.936542  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0183  membrane protein-like protein  30.67 
 
 
471 aa  98.2  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.343877  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6201  hypothetical protein  37.45 
 
 
236 aa  97.4  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0779  hypothetical protein  29.14 
 
 
378 aa  90.9  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4569  membrane protein-like protein  30.48 
 
 
481 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0206067  normal  0.209557 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4436  membrane protein-like protein  30.48 
 
 
481 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3663  hypothetical protein  30.96 
 
 
324 aa  85.5  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0504521  hitchhiker  0.0000127877 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0182  hypothetical protein  33.02 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0642458 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1097  hypothetical protein  30.46 
 
 
426 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122525  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3492  putative transmembrane protein  31.39 
 
 
414 aa  79.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0708011  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1241  membrane protein-like protein  28.85 
 
 
428 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1092  hypothetical protein  29.33 
 
 
419 aa  75.1  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.160606  normal  0.0424364 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0484  hypothetical protein  30.87 
 
 
419 aa  63.2  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40682  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3710  hypothetical protein  31.13 
 
 
419 aa  60.8  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.387372 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>