More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_04741 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_04741  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
492 aa  1008    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.633658  normal  0.679149 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06791  glutamyl-tRNA synthetase  64.08 
 
 
476 aa  664    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1719  glutamyl-tRNA synthetase  62.11 
 
 
477 aa  641    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0641  glutamyl-tRNA synthetase  62.74 
 
 
477 aa  644    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05291  glutamyl-tRNA synthetase  61.18 
 
 
492 aa  638    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0717874 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1806  glutamyl-tRNA synthetase  61.13 
 
 
476 aa  624  1e-177  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2393  glutamyl-tRNA synthetase  57.62 
 
 
481 aa  580  1e-164  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0156972  hitchhiker  0.00526056 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05371  glutamyl-tRNA synthetase  55.49 
 
 
493 aa  570  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04981  glutamyl-tRNA synthetase  57.93 
 
 
476 aa  564  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.475242  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  57.97 
 
 
481 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3196  glutamyl-tRNA synthetase  55.83 
 
 
482 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0473  glutamyl-tRNA synthetase  56.09 
 
 
479 aa  555  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.138189  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05281  glutamyl-tRNA synthetase  57.08 
 
 
476 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  55.42 
 
 
481 aa  554  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  55 
 
 
881 aa  549  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2309  glutamyl-tRNA synthetase  56.4 
 
 
483 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3060  glutamyl-tRNA synthetase  54.58 
 
 
481 aa  543  1e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000448328  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  56.2 
 
 
483 aa  538  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 
477 aa  354  2e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 
485 aa  342  1e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 
485 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 
482 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 
479 aa  325  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 
486 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4369  glutamyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 
471 aa  319  7.999999999999999e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  39.25 
 
 
481 aa  318  1e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 
488 aa  317  2e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 
464 aa  318  2e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 
494 aa  317  3e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 
484 aa  317  4e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  39 
 
 
470 aa  316  7e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 
488 aa  315  9e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 
485 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 
466 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 
471 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 
471 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 
483 aa  313  4.999999999999999e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  38.65 
 
 
466 aa  313  5.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  39.61 
 
 
464 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 
469 aa  312  7.999999999999999e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 
471 aa  311  1e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 
469 aa  311  1e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 
484 aa  310  2.9999999999999997e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  37.78 
 
 
491 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 
468 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 
484 aa  310  2.9999999999999997e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  38.23 
 
 
475 aa  310  2.9999999999999997e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 
488 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  36.48 
 
 
466 aa  310  4e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  36.48 
 
 
466 aa  310  4e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
471 aa  309  8e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2798  glutamyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 
472 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0783891  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1191  glutamyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 
471 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 
490 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01271  glutamyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 
475 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3084  glutamyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 
471 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00745356  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 
471 aa  307  3e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  35.89 
 
 
466 aa  306  6e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 
470 aa  306  7e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 
470 aa  306  8.000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1984  glutamyl-tRNA synthetase  36.93 
 
 
469 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434285  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 
464 aa  305  9.000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 
491 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  37.55 
 
 
546 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
509 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4681  glutamyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 
474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 
490 aa  305  1.0000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2350  glutamyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 
474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2779  glutamyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 
471 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00021769  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  36.74 
 
 
469 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 
467 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 
480 aa  303  3.0000000000000004e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 
472 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5036  glutamyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 
474 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 
485 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 
474 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2649  glutamyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 
471 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000633167  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2607  glutamyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 
471 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00191122  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2673  glutamyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 
471 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2558  glutamyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 
471 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000165684  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  35.7 
 
 
467 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 
468 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 
471 aa  302  7.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000112104  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02306  glutamyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 
471 aa  302  8.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 
471 aa  302  8.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000107097  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2689  glutamyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 
471 aa  302  8.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000585345  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2537  glutamyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 
471 aa  302  8.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.81823e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02267  hypothetical protein  38.1 
 
 
471 aa  302  8.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000211719  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3632  glutamyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 
471 aa  302  8.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000908657  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 
471 aa  302  9e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172763  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 
478 aa  301  1e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 
470 aa  302  1e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1793  glutamyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 
484 aa  302  1e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0101164  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1272  glutamyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 
471 aa  301  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000352174  hitchhiker  0.00569831 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 
467 aa  301  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5223  glutamyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 
474 aa  301  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142944  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  37.21 
 
 
490 aa  301  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2207  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 
469 aa  301  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000288711  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0145  glutamyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 
462 aa  300  3e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.092829  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0647  glutamyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 
474 aa  300  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>