63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4168 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_4168  hypothetical protein  100 
 
 
367 aa  726    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3511  hypothetical protein  58.59 
 
 
375 aa  339  4e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1110  hypothetical protein  40.69 
 
 
379 aa  229  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0067  hypothetical protein  28.26 
 
 
364 aa  82.4  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396841  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26710  hypothetical protein  42.35 
 
 
450 aa  80.9  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.376533 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1033  hypothetical protein  28.01 
 
 
367 aa  80.1  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2315  hypothetical protein  39.58 
 
 
609 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973812  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0517  hypothetical protein  27.25 
 
 
363 aa  77  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1227  hypothetical protein  31.79 
 
 
534 aa  76.3  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2548  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  37.5 
 
 
691 aa  76.3  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.678112 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2959  hypothetical protein  28.57 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569097  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4048  hypothetical protein  27.46 
 
 
358 aa  73.6  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2501  hypothetical protein  26.69 
 
 
371 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0697497  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1987  putative integral membrane protein  32.06 
 
 
552 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.285044  hitchhiker  0.000714658 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0149  hypothetical protein  25.88 
 
 
375 aa  70.1  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1387  hypothetical protein  23.93 
 
 
357 aa  67  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669214  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3840  hypothetical protein  28.66 
 
 
376 aa  67  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30590  hypothetical protein  30.83 
 
 
369 aa  65.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2655  hypothetical protein  30.47 
 
 
650 aa  63.2  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0138  hypothetical protein  24.42 
 
 
375 aa  60.1  0.00000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0479408  normal  0.0468167 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2812  hypothetical protein  27.59 
 
 
363 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0873158  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0661  hypothetical protein  25.91 
 
 
361 aa  55.1  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.238233  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0582  hypothetical protein  24.58 
 
 
361 aa  55.1  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.43804  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0290  hypothetical protein  26.2 
 
 
351 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1375  hypothetical protein  25.34 
 
 
361 aa  54.7  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2703  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.78 
 
 
708 aa  53.5  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000297127  normal  0.375768 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1282  hypothetical protein  27.21 
 
 
632 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481957  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1312  hypothetical protein  33.6 
 
 
375 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1493  hypothetical protein  27.21 
 
 
632 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00418774  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2765  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.73 
 
 
738 aa  50.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.617524 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6076  membrane protein  29.19 
 
 
600 aa  50.1  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1365  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  32.19 
 
 
744 aa  49.7  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00298227 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2789  hypothetical protein  23.89 
 
 
372 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.278452  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3131  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.89 
 
 
738 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.861685  normal  0.88928 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  29.37 
 
 
746 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2889  hypothetical protein  27.27 
 
 
740 aa  47.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.777719  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0118  hypothetical protein  22.37 
 
 
367 aa  47.4  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1143  hypothetical protein  31.09 
 
 
352 aa  46.6  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.602769  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1096  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  29.5 
 
 
763 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0524683  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1096  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  29.5 
 
 
763 aa  46.6  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4321  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  29.5 
 
 
763 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3931  hypothetical protein  36.28 
 
 
629 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1612  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  29.37 
 
 
851 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719802  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1750  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.06 
 
 
806 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0916755  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2840  AraE family aromatic acid exporter  28.78 
 
 
883 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33409  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2090  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.28 
 
 
763 aa  43.9  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338513  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2531  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  26.62 
 
 
740 aa  43.5  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2466  hypothetical protein  24.44 
 
 
372 aa  43.5  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1518  hypothetical protein  26.28 
 
 
758 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1772  hypothetical protein  26.28 
 
 
758 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0697846  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  30.88 
 
 
695 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.423889  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3567  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.69 
 
 
746 aa  43.1  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  30.88 
 
 
695 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3772  hypothetical protein  30.94 
 
 
695 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.503591 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3738  integral membrane protein YccS/YhfK family  30.88 
 
 
695 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0105534 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1187  hypothetical protein  26.28 
 
 
758 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.775183  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0469  hypothetical protein  26.28 
 
 
758 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646757  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1387  hypothetical protein  26.28 
 
 
758 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1383  hypothetical protein  26.28 
 
 
758 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0683  hypothetical protein  26.28 
 
 
758 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3835  YccS/YhfK family integral membrane protein  30.88 
 
 
695 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3199  hypothetical protein  30.28 
 
 
345 aa  42.7  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2853  hypothetical protein  25.55 
 
 
758 aa  42.7  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>