56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3199 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3199  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  655    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0517  hypothetical protein  43.14 
 
 		 363 aa  222  6e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0290  hypothetical protein  44.61 
 
 		 351 aa  188  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4048  hypothetical protein  36.12 
 
 		 358 aa  146  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3840  hypothetical protein  35.69 
 
 		 376 aa  132  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30590  hypothetical protein  33.23 
 
 		 369 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2959  hypothetical protein  26.05 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1387  hypothetical protein  39 
 
 		 357 aa  66.6  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0067  hypothetical protein  26.82 
 
 		 364 aa  63.5  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396841  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2548  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  36.36 
 
 		 691 aa  60.5  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.678112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2315  hypothetical protein  34.81 
 
 		 609 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.92 
 
 		 746 aa  57  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1033  hypothetical protein  33.12 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1110  hypothetical protein  34.58 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2655  hypothetical protein  33.33 
 
 		 650 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26710  hypothetical protein  40.78 
 
 		 450 aa  54.3  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.376533 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4168  hypothetical protein  27.87 
 
 		 367 aa  54.3  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0118  hypothetical protein  29.06 
 
 		 367 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1227  hypothetical protein  34.19 
 
 		 534 aa  50.8  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2709  membrane protein-like protein  32.53 
 
 		 631 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2501  hypothetical protein  27.78 
 
 		 371 aa  49.7  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0697497  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0661  hypothetical protein  26.67 
 
 		 361 aa  48.9  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.238233  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0582  hypothetical protein  26.67 
 
 		 361 aa  48.9  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.43804  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2067  hypothetical protein  28.47 
 
 		 638 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012683  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2840  AraE family aromatic acid exporter  26.57 
 
 		 883 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1612  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.57 
 
 		 851 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2853  hypothetical protein  26.57 
 
 		 758 aa  47.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229586  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3511  hypothetical protein  30 
 
 		 375 aa  47.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0149  hypothetical protein  27.85 
 
 		 375 aa  46.6  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2789  hypothetical protein  26.01 
 
 		 372 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.278452  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1987  putative integral membrane protein  31.43 
 
 		 552 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.285044  hitchhiker  0.000714658 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1602  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  30 
 
 		 737 aa  45.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  29.93 
 
 		 733 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1750  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.17 
 
 		 806 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0916755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0138  hypothetical protein  29.46 
 
 		 375 aa  44.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0479408  normal  0.0468167 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1518  hypothetical protein  27.1 
 
 		 758 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4321  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  26.03 
 
 		 763 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1096  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  26.71 
 
 		 763 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1096  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.71 
 
 		 763 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0524683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1383  hypothetical protein  27.1 
 
 		 758 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1387  hypothetical protein  27.1 
 
 		 758 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1187  hypothetical protein  27.21 
 
 		 758 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.775183  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0683  hypothetical protein  27.21 
 
 		 758 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1772  hypothetical protein  27.21 
 
 		 758 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0697846  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0469  hypothetical protein  27.21 
 
 		 758 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646757  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1375  hypothetical protein  25.33 
 
 		 361 aa  44.7  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2812  hypothetical protein  32.05 
 
 		 363 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0873158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2531  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  21.92 
 
 		 740 aa  43.5  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3199  hypothetical protein  32.41 
 
 		 700 aa  43.5  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000232699  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2090  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.34 
 
 		 763 aa  43.9  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1213  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  26.71 
 
 		 764 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0139359  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2586  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  32.85 
 
 		 651 aa  42.7  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2534  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  32.85 
 
 		 651 aa  42.7  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0733  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  26.71 
 
 		 764 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525617  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01106  hypothetical protein  31.58 
 
 		 680 aa  42.7  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1186  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.71 
 
 		 764 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310514  normal  0.518709 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>