200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0078 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0078  acyl-CoA thioesterase  100 
 
 
300 aa  618  1e-176  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0087  acyl-CoA thioesterase II  88.07 
 
 
286 aa  536  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0297  acyl-CoA thioesterase II  83.85 
 
 
291 aa  518  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0370  acyl-CoA thioesterase II  83.86 
 
 
291 aa  515  1e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0452  acyl-CoA thioesterase II  82.99 
 
 
293 aa  514  1e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0145129  normal  0.290685 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0268  acyl-CoA thioesterase II  83.51 
 
 
291 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0509074  normal  0.217482 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0272  acyl-CoA thioesterase II  82.99 
 
 
291 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1819  acyl-CoA thioesterase II  61.62 
 
 
293 aa  356  2e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5500  acyl-CoA thioesterase II  62.32 
 
 
289 aa  344  9e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215107  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1862  acyl-CoA thioesterase II  56.14 
 
 
303 aa  332  5e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.93699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4095  acyl-CoA thioesterase II  55.79 
 
 
294 aa  330  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3049  acyl-CoA thioesterase II  56.38 
 
 
294 aa  330  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3771  acyl-CoA thioesterase II  55.09 
 
 
294 aa  327  1e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529792  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3628  acyl-CoA thioesterase II  57.64 
 
 
299 aa  327  2e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2049  acyl-CoA thioesterase II  56.84 
 
 
292 aa  323  3e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280365  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0958  acyl-CoA thioesterase II  55.63 
 
 
300 aa  321  1e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2373  Palmitoyl-CoA hydrolase  56.25 
 
 
287 aa  319  3e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.394315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2097  acyl-CoA thioesterase II  55.56 
 
 
287 aa  317  1e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  hitchhiker  0.00217835 
 
 
-
 
NC_004310  BR1898  acyl-CoA thioesterase II  53.9 
 
 
311 aa  317  2e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1825  acyl-CoA thioesterase II  54.93 
 
 
300 aa  315  9e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.115581  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3238  acyl-CoA thioesterase II  54.17 
 
 
288 aa  308  9e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2850  acyl-CoA thioesterase II  53.9 
 
 
296 aa  307  1e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105519  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4240  acyl-CoA thioesterase II  52.46 
 
 
294 aa  305  7e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1316  palmitoyl-CoA hydrolase  49.82 
 
 
285 aa  291  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.478481  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3719  acyl-CoA thioesterase II  52.1 
 
 
289 aa  290  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2137  acyl-CoA thioesterase II  56.4 
 
 
288 aa  287  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174647  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2210  acyl-CoA thioesterase II  54.8 
 
 
314 aa  286  4e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4916  palmitoyl-CoA hydrolase  50.7 
 
 
289 aa  279  5e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  2.79836e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12870  acyl-CoA thioesterase II  50 
 
 
289 aa  277  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18518  normal  0.438746 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1166  acyl-CoA thioesterase II  50 
 
 
289 aa  276  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2732  palmitoyl-CoA hydrolase  49.12 
 
 
281 aa  276  4e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0611615 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24760  acyl-CoA thioesterase II  52.28 
 
 
301 aa  275  7e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4293  Acyl-CoA thioesterase  49.3 
 
 
289 aa  271  9e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3590  palmitoyl-CoA hydrolase  47.74 
 
 
286 aa  270  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4636  acyl-CoA thioesterase II  51.1 
 
 
289 aa  269  3e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147271  hitchhiker  0.00276811 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07750  acyl-CoA thioesterase II  50.69 
 
 
290 aa  269  3e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4762  acyl-CoA thioesterase II  50.74 
 
 
289 aa  268  8e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000102019  decreased coverage  0.000737933 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4774  acyl-CoA thioesterase II  50.74 
 
 
289 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463605  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4660  acyl-CoA thioesterase II  48.25 
 
 
289 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5686  acyl-CoA thioesterase II  51.77 
 
 
310 aa  266  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1111  acyl-CoA thioesterase II  47.57 
 
 
287 aa  265  8e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000604466  hitchhiker  2.08414e-06 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0658  acyl-CoA thioesterase II  50 
 
 
289 aa  262  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0531  acyl-CoA thioesterase  53.61 
 
 
299 aa  261  7e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1278  acyl-CoA thioesterase II  45.86 
 
 
289 aa  260  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.456689  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1834  acyl-CoA thioesterase II  51.92 
 
 
283 aa  260  2e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4827  acyl-CoA thioesterase II  44.06 
 
 
285 aa  260  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3069  acyl-CoA thioesterase II  51.24 
 
 
314 aa  257  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  2.38384e-05  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4891  palmitoyl-CoA hydrolase  48.94 
 
 
286 aa  256  4e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3742  acyl-CoA thioesterase II  52.56 
 
 
294 aa  255  7e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102004  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3217  acyl-CoA thioesterase II  47.76 
 
 
286 aa  253  4e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752316  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3076  acyl-CoA thioesterase II  47.76 
 
 
286 aa  252  4e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00416001  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3037  acyl-CoA thioesterase II  47.76 
 
 
286 aa  253  4e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0997  palmitoyl-CoA hydrolase  48.58 
 
 
295 aa  252  5e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3384  palmitoyl-CoA hydrolase  48.43 
 
 
294 aa  250  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0920  acyl-CoA thioesterase II  46.5 
 
 
286 aa  250  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149003  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01450  acyl-CoA thioesterase II  46.77 
 
 
286 aa  249  4e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004014  acyl-CoA thioesterase II  46.77 
 
 
286 aa  248  8e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3159  palmitoyl-CoA hydrolase  48.08 
 
 
294 aa  248  9e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05531  acyl-CoA thioesterase II  47.5 
 
 
301 aa  248  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00816799  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4768  Palmitoyl-CoA hydrolase  49.66 
 
 
277 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3163  acyl-CoA thioesterase II  45.99 
 
 
286 aa  246  4e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0488  acyl-CoA thioesterase II  45.99 
 
 
286 aa  246  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3157  acyl-CoA thioesterase II  45.99 
 
 
286 aa  246  4e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46101  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00404  acyl-CoA thioesterase II  45.99 
 
 
286 aa  246  4e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0529  acyl-CoA thioesterase II  45.99 
 
 
286 aa  246  4e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00408  hypothetical protein  45.99 
 
 
286 aa  246  4e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0496  acyl-CoA thioesterase II  45.99 
 
 
286 aa  246  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0541  acyl-CoA thioesterase II  45.99 
 
 
286 aa  246  4e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909555  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0567  acyl-CoA thioesterase II  46.69 
 
 
286 aa  245  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0514  acyl-CoA thioesterase II  46.69 
 
 
286 aa  245  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1005  acyl-CoA thioesterase II  46.77 
 
 
287 aa  245  7e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.129501  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3803  Choloyl-CoA hydrolase  48.29 
 
 
291 aa  245  8e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  hitchhiker  0.0012585 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0505  acyl-CoA thioesterase II  46.34 
 
 
286 aa  243  2e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0264623  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0524  acyl-CoA thioesterase II  46.34 
 
 
286 aa  243  2e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.602046  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0508  acyl-CoA thioesterase II  46.34 
 
 
286 aa  243  2e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0379  acyl-CoA thioesterase II  45.64 
 
 
286 aa  243  3e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1968  acyl-CoA thioesterase II  45.86 
 
 
287 aa  243  4e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517331  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2722  acyl-CoA thioesterase II  47.18 
 
 
286 aa  242  5e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.700774  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2851  palmitoyl-CoA hydrolase  45.48 
 
 
288 aa  241  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1113  acyl-CoA thioesterase II  48.93 
 
 
306 aa  239  4e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.247123  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0581  acyl-CoA thioesterase II  44.87 
 
 
286 aa  239  4e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  6.05498e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3249  acyl-CoA thioesterase II  47.17 
 
 
287 aa  238  8e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2791  acyl-CoA thioesterase II  47.04 
 
 
288 aa  237  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000176702  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3055  acyl-CoA thioesterase II  45.63 
 
 
287 aa  236  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8358  acyl-CoA thioesterase II  47.84 
 
 
288 aa  236  5e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2238  Acyl-CoA thioesterase  44.93 
 
 
284 aa  235  7e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.58681  hitchhiker  1.02544e-11 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2417  palmitoyl-CoA hydrolase  45.83 
 
 
326 aa  234  1e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00372623  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0306  palmitoyl-CoA hydrolase  46.13 
 
 
283 aa  233  2e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000146303  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2170  Palmitoyl-CoA hydrolase  45.33 
 
 
326 aa  233  2e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.18533e-05 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0337  palmitoyl-CoA hydrolase  44.71 
 
 
310 aa  233  3e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00101802  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1062  acyl-CoA thioesterase II  46.04 
 
 
287 aa  232  5e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2850  palmitoyl-CoA hydrolase  47.75 
 
 
296 aa  232  5e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1670  acyl-CoA thioesterase II  45.3 
 
 
287 aa  231  9e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  2.6944e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2836  acyl-CoA thioesterase II  46.83 
 
 
288 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1540  acyl-CoA thioesterase II  46.83 
 
 
288 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2961  acyl-CoA thioesterase II  46.83 
 
 
288 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.524198 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1466  palmitoyl-CoA hydrolase  45.07 
 
 
288 aa  231  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  2.03719e-05  hitchhiker  7.92581e-05 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1064  palmitoyl-CoA hydrolase  45.74 
 
 
300 aa  231  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3210  acyl-CoA thioesterase II  43.64 
 
 
288 aa  229  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00091585  unclonable  1.40962e-08 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2818  acyl-CoA thioesterase II  46.83 
 
 
288 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>