More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2472 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2472  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
306 aa  615  1e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10130  ornithine carbamoyltransferase  67.87 
 
 
308 aa  416  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3057  ornithine carbamoyltransferase  64.05 
 
 
315 aa  402  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00484569  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2369  ornithine carbamoyltransferase  67.1 
 
 
330 aa  403  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.943792  normal  0.0136411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5467  ornithine carbamoyltransferase  61.44 
 
 
308 aa  384  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974312  normal  0.0257666 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1331  ornithine carbamoyltransferase  64.94 
 
 
310 aa  382  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0593865  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1645  ornithine carbamoyltransferase  63.64 
 
 
310 aa  379  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2155  ornithine carbamoyltransferase  61.18 
 
 
311 aa  372  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000126395  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22290  ornithine carbamoyltransferase  66.34 
 
 
314 aa  369  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.586584  normal  0.554108 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1885  ornithine carbamoyltransferase  60.2 
 
 
323 aa  361  9e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0234789  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1115  ornithine carbamoyltransferase  56.17 
 
 
310 aa  359  3e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2027  ornithine carbamoyltransferase  60.59 
 
 
322 aa  359  4e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2837  ornithine carbamoyltransferase  59.34 
 
 
307 aa  357  9.999999999999999e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.10311  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3157  ornithine carbamoyltransferase  62.25 
 
 
306 aa  357  1.9999999999999998e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6073  ornithine carbamoyltransferase  56.91 
 
 
338 aa  352  4e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1500  ornithine carbamoyltransferase  56.68 
 
 
335 aa  351  7e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25590  ornithine carbamoyltransferase  57.84 
 
 
309 aa  350  2e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1501  ornithine carbamoyltransferase  57 
 
 
333 aa  347  2e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000190622 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3310  ornithine carbamoyltransferase  55.08 
 
 
307 aa  345  4e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00885285  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21700  ornithine carbamoyltransferase  55.77 
 
 
327 aa  345  6e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.513987  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1892  ornithine carbamoyltransferase  60.66 
 
 
321 aa  345  6e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11674  ornithine carbamoyltransferase  58.69 
 
 
307 aa  343  2e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.25899e-16  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2968  ornithine carbamoyltransferase  56.77 
 
 
307 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3012  ornithine carbamoyltransferase  56.77 
 
 
307 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.296238  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2983  ornithine carbamoyltransferase  56.44 
 
 
307 aa  342  5.999999999999999e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.886443  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5452  ornithine carbamoyltransferase  57.76 
 
 
310 aa  341  8e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2399  ornithine carbamoyltransferase  58.06 
 
 
312 aa  339  2.9999999999999998e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3024  ornithine carbamoyltransferase  59.62 
 
 
314 aa  338  7e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14380  ornithine carbamoyltransferase  58.61 
 
 
319 aa  335  3.9999999999999995e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3526  ornithine carbamoyltransferase  55.08 
 
 
307 aa  334  1e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0812  ornithine carbamoyltransferase  53.62 
 
 
321 aa  332  4e-90  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  56.21 
 
 
312 aa  323  2e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4127  ornithine carbamoyltransferase  53.31 
 
 
312 aa  321  9.000000000000001e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  hitchhiker  0.0000294127 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  53.62 
 
 
309 aa  305  8.000000000000001e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  52.29 
 
 
340 aa  300  2e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1741  ornithine carbamoyltransferase  53.27 
 
 
317 aa  294  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3066  ornithine carbamoyltransferase  53.31 
 
 
319 aa  287  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478337  normal  0.328556 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  47.87 
 
 
311 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  47.87 
 
 
311 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  48.69 
 
 
309 aa  276  3e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  46.73 
 
 
315 aa  275  8e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  46.67 
 
 
323 aa  271  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  45.45 
 
 
303 aa  269  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  45.25 
 
 
329 aa  269  5e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0246  ornithine carbamoyltransferase  45.51 
 
 
298 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  43.89 
 
 
307 aa  268  5.9999999999999995e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  45.72 
 
 
314 aa  268  8.999999999999999e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  46 
 
 
355 aa  267  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2763  ornithine carbamoyltransferase  45.39 
 
 
307 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  44.26 
 
 
320 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1902  ornithine carbamoyltransferase  47.04 
 
 
306 aa  266  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  46.73 
 
 
305 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  45.07 
 
 
309 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  43.61 
 
 
302 aa  265  5e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2514  ornithine carbamoyltransferase  47.7 
 
 
305 aa  265  5e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  43.75 
 
 
311 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  46.96 
 
 
313 aa  263  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  44.95 
 
 
303 aa  263  3e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  45.42 
 
 
303 aa  262  4.999999999999999e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2178  ornithine carbamoyltransferase  44.74 
 
 
310 aa  262  6e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280829  normal  0.684526 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  45.57 
 
 
300 aa  262  6e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3012  ornithine carbamoyltransferase  44.08 
 
 
309 aa  262  6e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  43.97 
 
 
303 aa  261  8e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  46.01 
 
 
313 aa  261  8e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  46.38 
 
 
306 aa  261  1e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  44.95 
 
 
303 aa  261  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  43.42 
 
 
301 aa  260  2e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2120  ornithine carbamoyltransferase  42.76 
 
 
302 aa  259  3e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0533894  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  44.44 
 
 
305 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0794  ornithine carbamoyltransferase  45.39 
 
 
313 aa  258  6e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0743  ornithine carbamoyltransferase  44.74 
 
 
309 aa  259  6e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.511035 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  42.16 
 
 
306 aa  258  7e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  43 
 
 
303 aa  258  7e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4159  ornithine carbamoyltransferase  44.04 
 
 
338 aa  258  8e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171177  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  43 
 
 
303 aa  258  9e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  42.71 
 
 
305 aa  258  9e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2554  ornithine carbamoyltransferase  43.79 
 
 
308 aa  258  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0520201  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1046  ornithine carbamoyltransferase  46.13 
 
 
330 aa  258  1e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0775  ornithine carbamoyltransferase  46.45 
 
 
334 aa  258  1e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.592297  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3205  ornithine carbamoyltransferase  44.74 
 
 
309 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820291  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  43.61 
 
 
312 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5885  ornithine carbamoyltransferase  44.41 
 
 
309 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0675  ornithine carbamoyltransferase  44.41 
 
 
309 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0375  ornithine carbamoyltransferase  44.41 
 
 
309 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1073  ornithine carbamoyltransferase  44.41 
 
 
309 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0921  ornithine carbamoyltransferase  44.41 
 
 
309 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0124  ornithine carbamoyltransferase  44.41 
 
 
309 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0757  ornithine carbamoyltransferase  44.41 
 
 
309 aa  256  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2510  ornithine carbamoyltransferase  44.41 
 
 
309 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0917  ornithine carbamoyltransferase  44.41 
 
 
309 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1942  ornithine carbamoyltransferase  44.41 
 
 
309 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2553  ornithine carbamoyltransferase  44.41 
 
 
309 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2577  ornithine carbamoyltransferase  44.41 
 
 
309 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2830  ornithine carbamoyltransferase  43.93 
 
 
308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.998909  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2424  ornithine carbamoyltransferase  43.93 
 
 
308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2472  ornithine carbamoyltransferase  44.41 
 
 
309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.893068  normal  0.0170187 
 
 
-
 
NC_002936  DET1394  ornithine carbamoyltransferase  45.21 
 
 
311 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.819554  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3003  ornithine carbamoyltransferase  43.93 
 
 
305 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2430  ornithine carbamoyltransferase  43.93 
 
 
305 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0529  ornithine carbamoyltransferase  44.08 
 
 
309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>