62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2384 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2384  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  662    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0955  hypothetical protein  39.06 
 
 		 307 aa  125  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3520  hypothetical protein  28.47 
 
 		 314 aa  98.6  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.051391  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29770  hypothetical protein  33.9 
 
 		 275 aa  90.9  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0735  hypothetical protein  30.32 
 
 		 305 aa  89.7  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1050  hypothetical protein  31.91 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  29.68 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0991  hypothetical protein  35.19 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4502  hypothetical protein  32.38 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414331  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1181  hypothetical protein  31.78 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.59676 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  28.4 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  28.57 
 
 		 310 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  30.48 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2364  hypothetical protein  30.8 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3137  hypothetical protein  29.29 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1071  hypothetical protein  27.78 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4094  hypothetical protein  29.7 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.811217  normal  0.0134077 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  30.84 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31410  hypothetical protein  30.53 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.372839  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1976  hypothetical protein  29.17 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667209 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1897  hypothetical protein  29.41 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221334  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  33.98 
 
 		 286 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  33.98 
 
 		 286 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4733  hypothetical protein  31.43 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.545142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  29.35 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3059  hypothetical protein  29.73 
 
 		 278 aa  57  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.169206  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3967  hypothetical protein  27.68 
 
 		 329 aa  55.8  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2158  hypothetical protein  28.73 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0740  hypothetical protein  31.25 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4808  hypothetical protein  30.57 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4439  hypothetical protein  36.61 
 
 		 284 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  31.64 
 
 		 278 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4353  hypothetical protein  36.61 
 
 		 284 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0597  hypothetical protein  23.84 
 
 		 320 aa  52.8  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13550  hypothetical protein  37.38 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000138397  hitchhiker  0.00000300083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  28.23 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  28.23 
 
 		 284 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  28.23 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11511  hypothetical protein  32.04 
 
 		 280 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.494625 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2486  hypothetical protein  36.36 
 
 		 309 aa  50.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5011  hypothetical protein  34.15 
 
 		 277 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4629  hypothetical protein  31.76 
 
 		 277 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4717  hypothetical protein  31.76 
 
 		 277 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2812  hypothetical protein  40.59 
 
 		 261 aa  49.3  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.437661  normal  0.0518068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  30.46 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4303  hypothetical protein  29.22 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.670084 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4384  hypothetical protein  34.51 
 
 		 281 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.88032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  28.96 
 
 		 259 aa  47.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  29.9 
 
 		 301 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4699  hypothetical protein  25.84 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4228  hypothetical protein  33.63 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331823  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4153  hypothetical protein  33.63 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3007  hypothetical protein  25.63 
 
 		 424 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.153123  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20280  hypothetical protein  32.51 
 
 		 330 aa  45.1  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1165  hypothetical protein  27.84 
 
 		 302 aa  44.3  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000066316 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  34.62 
 
 		 320 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  34.62 
 
 		 320 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0677  hypothetical protein  30.83 
 
 		 257 aa  43.5  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  34.62 
 
 		 320 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11062  hypothetical protein  28.86 
 
 		 207 aa  43.9  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22770  hypothetical protein  31.33 
 
 		 303 aa  43.1  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.513597  normal  0.79035 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  28.31 
 
 		 295 aa  43.1  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>