More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0424 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0424  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 239 aa  481  1e-135  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0317312 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  29.36 
 
 		 833 aa  95.1  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3557  nucleotidyl transferase  31.37 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0843  nucleotidyl transferase  32.1 
 
 		 222 aa  92  8e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000793597 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  30.84 
 
 		 833 aa  90.5  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  30.77 
 
 		 384 aa  89.7  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4321  Nucleotidyl transferase  30.69 
 
 		 238 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0289  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  27.97 
 
 		 392 aa  88.6  8e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  32 
 
 		 820 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  32.89 
 
 		 816 aa  87  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  26.78 
 
 		 832 aa  86.7  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4857  nucleotidyl transferase  27.66 
 
 		 351 aa  85.1  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.292001 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2404  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  27.2 
 
 		 392 aa  85.1  9e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.271478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  25.42 
 
 		 843 aa  85.1  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1973  mannose-1-phosphate guanyltransferase  28.74 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.878472 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26731  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  27.48 
 
 		 392 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01711  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  30 
 
 		 392 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.602072  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  29.8 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0154  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  29.62 
 
 		 392 aa  82.8  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01801  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  29.23 
 
 		 392 aa  83.2  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0529  Nucleotidyl transferase  29.28 
 
 		 352 aa  82.8  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01691  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  31.84 
 
 		 392 aa  82.8  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1518  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  27.8 
 
 		 392 aa  82.4  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02241  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  27.8 
 
 		 392 aa  82.4  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  29.11 
 
 		 384 aa  82  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0952  Nucleotidyl transferase  29.43 
 
 		 388 aa  82  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0925  Nucleotidyl transferase  29.43 
 
 		 388 aa  82  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  31.02 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3175  Nucleotidyl transferase  25.48 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.673633  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0885  Nucleotidyl transferase  27.62 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  32.79 
 
 		 828 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  31.43 
 
 		 828 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01681  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  28.35 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.78 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1511  Nucleotidyl transferase  28.57 
 
 		 388 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125436 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  24.9 
 
 		 834 aa  79.7  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3932  Nucleotidyl transferase  27.59 
 
 		 381 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  26.96 
 
 		 361 aa  79  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  30.49 
 
 		 385 aa  79  0.00000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4031  nucleotidyl transferase  25.58 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  28.32 
 
 		 835 aa  78.6  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  28.63 
 
 		 854 aa  78.6  0.00000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  30.89 
 
 		 810 aa  78.6  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  24.67 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3979  Nucleotidyl transferase  27.78 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1143  nucleotidyl transferase  29.2 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149781 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  32.06 
 
 		 776 aa  77  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  28.76 
 
 		 841 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  26.38 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  27.71 
 
 		 361 aa  76.6  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  27.71 
 
 		 361 aa  76.6  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3526  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  27.27 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  31.25 
 
 		 836 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  28.76 
 
 		 405 aa  75.9  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  28.32 
 
 		 348 aa  75.9  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1224  HAD superfamily hydrolase  23.75 
 
 		 412 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.72599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0072  nucleotidyl transferase  25.82 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.155346 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  24.26 
 
 		 828 aa  75.5  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.23 
 
 		 357 aa  75.5  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.25 
 
 		 357 aa  75.1  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  28.35 
 
 		 370 aa  75.1  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1897  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  28.03 
 
 		 265 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  26.83 
 
 		 840 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4077  nucleotidyl transferase  27.23 
 
 		 238 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.957763  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14051  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  30.21 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  26.41 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  27.35 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3422  nucleotidyl transferase  29.59 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  30.05 
 
 		 836 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  30.19 
 
 		 818 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  32.8 
 
 		 818 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.57 
 
 		 364 aa  74.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  28 
 
 		 832 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2301  nucleotidyl transferase  32.97 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  24.36 
 
 		 828 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  28.94 
 
 		 842 aa  73.2  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  22.92 
 
 		 841 aa  73.2  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0113  nucleotidyl transferase  23.97 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00523302  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0327  putative nucleotidyl transferase  29.83 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  25.97 
 
 		 827 aa  73.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0365  Nucleotidyl transferase  26.27 
 
 		 355 aa  73.2  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  27.56 
 
 		 832 aa  72.8  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  29.96 
 
 		 712 aa  72.8  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0287  Nucleotidyl transferase  25.11 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  28.89 
 
 		 784 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  29.77 
 
 		 821 aa  72.4  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1231  flagellin modification protein PtmE, putative sugar-phosphate nucleotide transferase  30.77 
 
 		 345 aa  72  0.000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000208573  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1489  nucleotidyl transferase  25.85 
 
 		 230 aa  72  0.000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.523541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.16 
 
 		 351 aa  72  0.000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  29.2 
 
 		 784 aa  72  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  28.89 
 
 		 784 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  30.57 
 
 		 343 aa  72  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  29.63 
 
 		 836 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  25.55 
 
 		 388 aa  71.6  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  29.2 
 
 		 784 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3723  Nucleotidyl transferase  25.99 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  29.2 
 
 		 784 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  29.2 
 
 		 784 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  24.11 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  29.2 
 
 		 784 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>